FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0956.ptfa, 1210 aa vs ./tmplib.26680 library 1767807 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1377+/-0.00406; mu= 20.8417+/- 0.273 mean_var=81.9773+/-18.985, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1417 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1021 ( 1196 res) mpm09008 (1196) 3489 724 3.4e-209 mKIAA4233 ( 1195 res) mbg18924 (1195) 1404 298 6.3e-81 mKIAA0611 ( 1093 res) mbh02036 (1093) 932 201 6.5e-52 mKIAA1137 ( 923 res) meh02020 ( 923) 824 179 2.6e-45 mKIAA0715 ( 889 res) mbp06183 ( 889) 765 167 1.1e-41 mKIAA0566 ( 1521 res) mbg09880 (1521) 762 167 2.3e-41 mKIAA1939 ( 798 res) mng04094 ( 798) 563 126 2.7e-29 mKIAA1825 ( 1100 res) mfj34163 (1100) 148 41 0.0011 mKIAA1487 ( 197 res) msj04098 ( 197) 138 38 0.0017 >>mKIAA1021 ( 1196 res) mpm09008 (1196 aa) initn: 2700 init1: 1089 opt: 3489 Z-score: 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.:.:::::.:::.... :: ..:.:... .::. : .: : : . . . .. mKIAA4 IWILTGDKQETAINIGHSCRLLKRNMGMI-VINEGSLDGTRETLSRHCTTLGDALRKEND 720 730 740 750 760 770 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 -GLVVDGTSLSLALREH-EKLFMEVCRNCSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLA .:..:: .:. :: .. :... .:.::.:::..::::..:....: . : :::: mKIAA4 FALIIDGKTLKYALTFGVRQYFLDLALSCKAVICCRVSPLQKSEVVEMVK-KQVKVITLA 780 790 800 810 820 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 VGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATL .::::::::::: ::::.:: :.:: ::: .:::.::.::.:..::.::: . : :.. mKIAA4 IGDGANDVSMIQTAHVGVGISGNEGLQAANSSDYSIAQFKYLKNLLMVHGAWNYNRVSKC 830 840 850 860 870 880 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 VQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTSLPVLIYSLVEQHIDPH . : ::::. . .. . : :: : :.. . :::. ::..: : .. :. . mKIAA4 ILYCFYKNIVLYIIEIWFAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVMFTAMPPLTLGIFERSCRKE 890 900 910 920 930 940 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 VLQSKPTLYRDISKNGL-LSIKAFLYWTVLGFSHAFIFFFGSYFLVGKDTSLLGNGQMFG . . : ::. :.:.: .. :.: . :. :. :.:. . : ..:::. mKIAA4 NMLKYPELYKT-SQNALDFNTKVFWVHCLNGLFHSVILFWFPLKALQYGT-VFGNGKTSD 950 960 970 980 990 1000 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA0 NWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYFIFSLFYGGILWPFLG-S .:..:.: .:::: .: .::: .:::..:.. :::: .. .: .:.. ::: . . mKIAA4 YLLLGNFVYTFVVITVCLKAGLETSYWTWFSHIAIWGSIALWVVFFGIYSS-LWPAVPMA 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA0 QNMYFVFIQLLSSGSAWFAILLMVVTCLFIDVVKKVFDRQLHPTSTEKAQLAEAHSSVKC .: .:.::: : ..: . :. :..::. ::. : : ....: ::.:. mKIAA4 PDMSGEAAMLFSSGVFWVGLLSIPVASLLLDVLYKVIKRTAFKTLVDEVQELEAKSQDPG 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1160 1170 1180 1190 1200 1210 mKIAA0 LDSVCCFPGETPCASVGRMLERVIGRCSPNHISRLWNASDPFYTNDRSILTLSPMDSSTC mKIAA4 AVVLGKSLTERAQLLKNVFKKNHVNLYRSESLQQNLLHGYAFSQDENGIVSQSEVIRAYD 1130 1140 1150 1160 1170 1180 >>mKIAA0611 ( 1093 res) mbh02036 (1093 aa) initn: 1284 init1: 305 opt: 932 Z-score: 1024.4 bits: 201.5 E(): 6.5e-52 Smith-Waterman score: 1532; 30.596% identity (33.564% ungapped) in 1108 aa overlap 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...:. : . mKIAA0 IYTQQSQDPPAQKGPTV--TTKVRRTMSSRVHEAV-KAIALCHNVT-PVYESNGVTDQAE 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 WQPNLAPAQLEYYASSPDEKALVEAAARAGIIFVGISEETMEVKVLG-RLERYKLLHILE . .. . : :::::: :::. . .:. .:: .. .:.... : .. .:... mKIAA0 AEKQFEDSCRVYQASSPDEVALVQWTESVGLTLVGRDQSSMQLRTPGDQVLNLTILQVFP 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 FDSDRRRMSVIVQAPS-GEKLLFAKGAESSILPKCIGGEIAKTRIHVDEFALKGLRTLCI : . .::..::. : :: .. :::. .. : . . ..: .:::.: . mKIAA0 FTYESKRMGIIVRDESTGEITFYMKGAD--VVMAGIVQYNDWLEEECGNMAREGLRVLVV 590 600 610 620 630 640 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 AYRQFTAKEYEDVDRRLFEARTALQHREEKLADAFQYIEKDLILLGATAVEDRLQDKVRE : ...: ..:.: . : .:. ... : :.: ... .: .. :: :.:::.:: :: mKIAA0 AKKSLTEEQYQDFEARYVQAKLSVHDRSLKVATVIESLEMEMELLCLTGVEDQLQADVRP 650 660 670 680 690 700 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 TIEALRMAGIKVWVLTGDKHETAVSVSLSCGHF---HRTMNILELINQKSDSGCAEQLRQ :.:.:: ::::::.::::: ::: . . . .:. .. .....:....... .:. mKIAA0 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:.::.:::..:::::.:..:.: . .: .:::.:::::: mKIAA1 HSLAHALEADMELEFLETACACKAVICCRVTPLQKAQVVELVK-KYKKAVTLAIGDGAND 500 510 520 530 540 550 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 VSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYK ::::. ::.:.:: :.:: ::. :::....::::..::.:::.. :.:. .. ::::: mKIAA1 VSMIKTAHIGVGISGQEGIQAVLASDYSFSQFKFLQRLLLVHGRWSYLRMCKFLCYFFYK 560 570 580 590 600 610 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 NVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYLTLYNICFTSLPVLIYSLVEQHIDPHVLQSKPT : : .: . :.: :: ::.::. ..::::: .:::::: ... .: . . . : mKIAA1 NFAFTMVHFWFGFFCGFSAQTVYDQYFITLYNIVYTSLPVLAMGVFDQDVPEQRSMEYPK 620 630 640 650 660 670 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 LYRDISKNGLLSIKAFLYWTVLGFSHAFIFFFGSYFLVGKDTSLLGNGQMFGNWTFGTLV ::. . : :.. . :. . :. . ..:: : . .. : :. :. .:.. : mKIAA1 LYEPGQLNLLFNKREFFICIAQGIYTSVLMFFIPYGVFAEATRDDGT-QLADYQSFAVTV 680 690 700 710 720 730 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA0 FTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTWGSIIFYF--IFSLFYGGILWPFLGSQNMYFVF : .::.:.:...:.: .:: :::. :::. :: .:.. .: :. .. .: . mKIAA1 ATSLVIVVSVQIGLDTGYWTAINHFFIWGSLAVYFAILFAMHSNG-LFDMFPNQFRFVGN 740 750 760 770 780 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA0 IQ-LLSSGSAWFAILLMVVTCLFIDVVKKVFDRQLHPTSTEKAQLAEAHSSVKCLDSVCC : :.. ..:..: : ...:.. :. . . .:.: .. .. .. mKIAA1 AQNTLAQPTVWLTIALTTAVCIMPVVAFRFLRLSLKPDLSDTVRYTQLVRKKQKAQHRCM 790 800 810 820 830 840 1160 1170 1180 1190 1200 1210 mKIAA0 FPGETPCASVGRMLERVIGRCSPNHISRLWNASDPFYTNDRSILTLSPMDSSTC mKIAA1 RRVGRTGSRRSGYAFSHQEGFGELIMSGKNMRLSSLALSSFSTRSSSSWIESLRRKKSDS 850 860 870 880 890 900 >>mKIAA0715 ( 889 res) mbp06183 (889 aa) initn: 1094 init1: 512 opt: 765 Z-score: 840.9 bits: 167.2 E(): 1.1e-41 Smith-Waterman score: 1202; 36.977% identity (40.708% ungapped) in 622 aa overlap (544-1119:114-724) 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 ELIKEHDLFFKAVSLCHTVQISNVQTDGIGDGPWQPNLA--PAQLEYYASSPDEKALVEA .: :.:. .: : : :::: :::.: mKIAA0 SGDCSTDGGYRSSTWEQGDILGSESGTSLEEGLEAPTLSQDEPELCYEAESPDEAALVHA 90 100 110 120 130 140 580 590 600 610 620 mKIAA0 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