FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA0956.ptfa, 1210 aa
vs ./tmplib.26680 library
1767807 residues in 2168 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.1377+/-0.00406; mu= 20.8417+/- 0.273
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Lambda= 0.1417
FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
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The best scores are: opt bits E(2168)
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30 40 50 60 70 80
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90 100 110 120 130 140
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150 160 170 180 190 200
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210 220 230 240 250 260
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270 280 290 300 310
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. ..... .::::: :.:::::: ::::..:::::.::::::::::::.:::::::::::
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320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
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380 390 400 410 420 430
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:.::.:.:::.:.::::::::::::.:: :: :.. :: . :::::::::::::::.
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440 450 460 470 480 490
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500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
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: : .:::.:. ::::::... . ::: . : . .
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560 570 580 590 600 610
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: .::::: ::::.. : :. .. .... ::. :.: .::..::..: ::: ::::
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::::.. .:: :: :::.:::.:. : :.. ..: .:.. :..::::::.::... ..
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790 800 810 820
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830 840 850 860 870 880
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890 900 910 920 930 940
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950 960 970 980 990 1000
mKIAA0 YNICFTSLPVLIYSLVEQHIDPHVLQSKPTLYRDISKNGLLSIKAFLYWTVLGFSHAFIF
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mKIAA1 YNISFTSLPILLYSLMEQHVGIDVLKRDPTLYRDIAKNALLRWRVFIYWTFLGVFDALVF
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1010 1020 1030 1040 1050 1060
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1070 1080 1090 1100 1110 1120
mKIAA0 IIFYFIFSLFYGGILWPFLGSQNMYFVFIQLLSSGSAWFAILLMVVTCLFIDVVKKVFDR
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1130 1140 1150 1160 1170 1180
mKIAA0 QLHPTSTEKAQLAEAHSSVKCLDSVCCFPGETPCASVGRMLERVIGRCSPNHISRLWNAS
:: ::.::..:.
mKIAA1 QLWPTATERTQVRS
1190
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30 40 50 60 70 80
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140 150 160 170 180 190
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260 270 280 290 300 310
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270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360 370
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:. ..: . :::. ... .. . :. ... . :: . : ..:. : .::.
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. : .:... . . .: : :. ...:::. :. ..
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. : ::::. . .. . : :: : :.. . :::. ::..: : .. :. .
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.:..:.: .:::: .: .::: .:::..:.. :::: .. .: .:.. ::: . .
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.: .:.::: : ..: . :. :..::. ::. : : ....: ::.:.
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Smith-Waterman score: 1532; 30.596% identity (33.564% ungapped) in 1108 aa overlap (39-1138:73-1090)
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:.. : : ..::....:.: :: ::: :::::.. :.. . . . : .
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:: ::..:: :... :. . :.:.:. . : : ::..:.::.:::.. . :..
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:::...: ... .::: . : .:::::. : .. : : : :.:.: .. . . ..
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:. :.. :.: . .. : . :. :. : :. . . . ::..::: : . ..:
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.. .: . . .: . : . :. ..: .. : ... :: :
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:.:: :.:.. :::::: :...: :.. :. : : . . : .:
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