FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1584.ptfa, 746 aa vs ./tmplib.26680 library 1768271 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2359+/-0.00708; mu= 8.4200+/- 0.475 mean_var=264.6236+/-63.864, 0's: 0 Z-trim: 20 B-trim: 89 in 1/35 Lambda= 0.0788 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0461 ( 853 res) mbg03064 ( 853) 698 93 1.4e-19 mKIAA1388 ( 523 res) mbg09616 ( 523) 238 40 0.0006 mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 226 39 0.0014 mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 217 38 0.0031 mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 216 38 0.0046 mKIAA0198 ( 506 res) mpm05258 ( 506) 204 36 0.0085 >>mKIAA0461 ( 853 res) mbg03064 (853 aa) initn: 901 init1: 566 opt: 698 Z-score: 443.9 bits: 93.0 E(): 1.4e-19 Smith-Waterman score: 876; 43.323% identity (51.590% ungapped) in 337 aa overlap (394-727:1-286) 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 TTCQHCYRQYPNPFQLQCHIESTHTPHDFSTICKICELSFETEHMLLQHMKDTHKPGEMP : ::::: .::.: ..:::::::::::::: mKIAA0 TKCKICEWAFESEPLFLQHMKDTHKPGEMP 10 20 30 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 YICQVCQFRSSIFSDVETHFRSSHENTKNLLCPFCLKVSRMATPYMNHYMRHQKKGIYRC :.:::::.:::..:.:..::: ::.:..::::.:::: . .. ...:::::::...:.: mKIAA0 YVCQVCQYRSSLYSEVDVHFRMIHEDTRHLLCPYCLKVFKNGNAFQQHYMRHQKRNVYHC 40 50 60 70 80 90 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 PKCRLQFLTSKEKTEHKLEH-RTFIKPKELEGLPPGTKVIIRASLGSSQSRASSPPSSTI ::::::: .:.: ::::.: .:: :::.:::: ::::: :::: : : :. :. mKIAA0 NKCRLQFLFAKDKIEHKLQHHKTFRKPKQLEGLKPGTKVTIRASRG--QPRTVPVSSNDA 100 110 120 130 140 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 PSTSLQLSVPKSKSTTTKNNSKVSANKATTTSPQTVATTTGKPSASKPGTGTTKSKAKPS :: .:: : :.:.: : : mKIAA0 PSGTLQ-----------------EAAALTSTDPLPVFLY-------------------PP 150 160 170 610 620 630 640 650 660 mKIAA1 YKQKRQRTRKNKFSIDLKNLRCHQGSHMCIECRSKIKDFSSHFSTHINCDFCKYTTNCNK ... :. :.:. .: . :.:: .: :: .:: :...:..:.:.: :.. mKIAA0 VQRNIQKRAVRKMSV--------MGRQTCLECSFEIPDFPNHFPTYVHCSLCRYSTCCSR 180 190 200 210 220 670 680 690 700 710 720 mKIAA1 AFTNHM-SSHNDHPS-KQLYIFKKQSRARRGITLVCLKCDFLADTSGLDRMAKHLNQRKT :..::: ..: . : : : .::.. :: :.: .: : : . : : ::::: . mKIAA0 AYANHMINNHVPRKSPKYLALFKNSVS---GIKLACTSCTF-ATSVG-DAMAKHLVFNPS 230 240 250 260 270 730 740 mKIAA1 HTCQVVIENVTERAVTSESASDGLFK : . .. mKIAA0 HRSSNILPRGLSWMSHLRPGQASERVFDWSMKNTYLPPPLVPNKAATVKPVGVTPAEPQE 280 290 300 310 320 330 >>mKIAA1388 ( 523 res) mbg09616 (523 aa) initn: 140 init1: 71 opt: 238 Z-score: 163.3 bits: 40.4 E(): 0.0006 Smith-Waterman score: 252; 24.231% identity (26.582% ungapped) in 260 aa overlap (244-503:269-505) 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 SSSQTAPSGASSQTVLSNVNTSSVQSAPGSSSLRSCPKCNVKFRLLDPLKCHMKRCCPDM :.::. . . : :.:: . :: mKIAA1 ESSELLQHPCTPSGERPFRCGECQKAFKRPSDLRQHERTHSAER---PFKCDL---CPMG 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 INKFLETLKSENSKAVSKATTDSDKEKLIMLVSDFYYGRHEGTIEESQKTHTTFKCFSCT ... .. . .. . . . :: . : . : .: :.: : ::: : mKIAA1 FKQQYALMRHRRTHKTEEPFKCGLCEKGFGQPSHLLYHQHVHTLE------TLFKCPVCQ 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 KVLKNNIRFMNHMKHHLELEKQNNETWESHTTCQHCYRQYPNPFQLQCHIESTHTPHDFS : . .. ... : : . : : : . : :: : : . . mKIAA1 KGFDQSAELLRH--------KCLPTSTERPFKCPVCNKAYKRASALQKHQLSHCAAAEKP 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 TICKICELSFETEHMLLQHMKDTHKPGEMPYICQVCQFRSSIFSDVETHFRSSHENTKNL : .:: : . ..:: : . : : : :. : . ::.. : : : . : mKIAA1 LRCTLCERRFFSSSEFVQHRCDPAR--EKPLKCPDCEKRFKYASDLQRH-RRVHTGEKPY 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 LCPFCLKVSRMATPYMNHYMRHQKKGIYRCPKCRLQFLTSKEKTEHKLEHRTFIKPKELE :: : :. .. .: : .. ..: : .:: ::. .: mKIAA1 KCPSCDKAFKQREHLNKHQGVHAREQQFKCVWCGERFLDVALLQEHSAQHSAAAAAAEGA 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 GLPPGTKVIIRASLGSSQSRASSPPSSTIPSTSLQLSVPKSKSTTTKNNSKVSANKATTT mKIAA1 YQVAACLP 520 >>mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 (437 aa) initn: 74 init1: 74 opt: 226 Z-score: 156.7 bits: 38.9 E(): 0.0014 Smith-Waterman score: 266; 26.923% identity (32.308% ungapped) in 312 aa overlap (234-511:6-299) 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 SISETRPCSSSSSQTAPSGASSQTVLSNVNTSSVQSAPGSSSLRSCPKCNVKFRLLDPLK : ... : . .: : : :: . :: mKIAA4 SFAQLTEHIKTHTGEKPFR-CKVCARTFRNSSCLK 10 20 30 270 280 290 300 310 mKIAA1 CHMKRCCPDMINKFLETLKSENSKAVSKATTDSDKEKLIMLVSDFYYGRHEGT------- :.. :. .. : . . : . :. :: : .. : mKIAA4 THFR------IHTGIKPYKCNYCGKAFTARSGLTKHVLIHNGEKPYECKECGKAFSTSSG 40 50 60 70 80 320 330 340 350 360 mKIAA1 IEESQKTHT---TFKCFSCTKVLKNNIRFMNHMKHHL---ELE-KQNNETW--------- . : . :: :.:..: :.: .. ...:.. : .: .: ..:. mKIAA4 LVEHIRIHTGEKPFECYQCGKALAHSSSLVGHLRTHTGEKPFECNQCDKTFTRSSYLRIH 90 100 110 120 130 140 370 380 390 400 410 mKIAA1 -ESHT-----TCQHCYRQYPNPFQLQCHIESTHT---PHDFSTICKICELSFETEHMLLQ ..:: :..: . .:. : ::. ::: :.. :: : .: . .: mKIAA4 MRTHTGEKPYECKECGKTFPERSCLTKHIR-THTGERPYE----CKECGKGFISFAQLTV 150 160 170 180 190 200 420 430 440 450 460 mKIAA1 HMKDTHKPGEMPYICQVC--QFRSSIFSDVETHFRSSHENTKNLLCPFCLKVSRMATPYM :.: ::. .: :. :.:: .::.: :..::::: : ..: : .: :. . mKIAA4 HIK-THS-SERPFQCKVCTKSFRNS--SSLETHFRI-HTGVKPYKCSYCGKAFTARSGLT 210 220 230 240 250 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 NHYMRHQKKGIYRCPKCRLQFLTSKEKTEHKLEHRTFIKPKELEGLPPGTKVIIRASLGS : : . : : .: : ::. : :. :: : mKIAA4 IHLRNHTGEKSYACQECGKAFSTSSGLIAHIRSHKGE-KPFECDHCGKAFASSSYLNVHL 260 270 280 290 300 310 530 540 550 560 570 580 mKIAA1 SQSRASSPPSSTIPSTSLQLSVPKSKSTTTKNNSKVSANKATTTSPQTVATTTGKPSASK mKIAA4 KIHTGEKPFQCTVCGKTFTCSSYLPVHMRTHTGEKPFQCIICGKSFLWSSYLRVHMRIHT 320 330 340 350 360 370 >>mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 (504 aa) initn: 245 init1: 57 opt: 217 Z-score: 150.5 bits: 38.0 E(): 0.0031 Smith-Waterman score: 242; 21.827% identity (24.363% ungapped) in 394 aa overlap (310-690:124-489) 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 TLKSENSKAVSKATTDSDKEKLIMLVSDFYYGRHEGTIEESQKTHTTFKCFSCTKVLKNN : .: . . : :.... : . : . :. mKIAA1 DQECKHKTGLQKEPQEGYFGQLKITSEKVTYEKH-SFLSEYQRVQNEEKFYECKECRKTF 100 110 120 130 140 150 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 IRFMNHMKHHLELEKQNNETWESHTTCQHCYRQYPNPFQLQCHIESTHTPH--DFSTICK :: . ...::... : :. :..: . ::. . :. : : . :: mKIAA1 IR-RSTLSQHLRIH-----TGEKPYKCKECGQ----PFRQRAHLIRHHKLHTGEKPYECK 160 170 180 190 200 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 ICELSFETEHMLLQHMKDTHKPGEMPYICQVCQFRSSIFSDVETHFRSSHENTKNLLCPF : .: . . : ::.. : :: :: :. : . ... : : : . : : mKIAA1 DCGKAFTVLQELTQHQR-LHT-GEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRI-HTGEKPYECKE 210 220 230 240 250 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 CLKVSRMATPYMNHYMRHQKKGIYRCPKCRLQFLTSKEKTEHKLEHRTFIKPKELEGLPP : :. :. : : : .. .:.: .: :. . . :. : :: . mKIAA1 CGKTFRQCTHLTRHQRLHTSEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFGE-KPYACKDCGK 260 270 280 290 300 310 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 GTKVIIRASLGSSQSRASSPPSSTIPSTSLQLS---VPKSKSTTTKNNSKVSANKATTTS . .. . .. .: . .: . ...: : ... : . . : .: mKIAA1 SFRICQQLTVHQSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTHERPYECLECWKTFSS 320 330 340 350 360 370 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 PQTVATTTGKPSASKPGTGTTKSKAKPSYKQKRQRTRKNKFSIDLKNLRCHQGSHMCIEC . . . . . .: .:: .. : :..... : .:. :: mKIAA1 YSQLISHQSIHVGERPYECEECGKA---FRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECQ-------EC 380 390 400 410 420 640 650 660 670 680 mKIAA1 RSKIK---DFSSHFSTHINCD--FCKYTTNCNKAFT--NHMSSHND-HPSKQLYIFKKQS :. .. ....: : : . :: .:.::: . .:.:. : ... : :. . mKIAA1 RKPFRLLSQLTQHRSIHTGEKPYECK---DCGKAFRLYSFLSQHQRIHTGEKPYKCKECK 430 440 450 460 470 480 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 RARRGITLVCLKCDFLADTSGLDRMAKHLNQRKTHTCQVVIENVTERAVTSESASDGLFK .: : mKIAA1 KAFRQHSHLTQHQKIHSGT 490 500 >>mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 (885 aa) initn: 229 init1: 115 opt: 216 Z-score: 147.4 bits: 38.2 E(): 0.0046 Smith-Waterman score: 311; 23.232% identity (25.275% ungapped) in 495 aa overlap (146-615:52-531) 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 LVALPSFHPALKSSESSDGQTVSKLDFTKTSPQEDSGACSVSQSDSTQDIPSSNILQ-PR :::..:.. . .: .:. :.. . : mKIAA0 ETVLWGPDLQGPEESQNEAHRGAGSGNEEESPQQESSGEEIILGDPAQSPESKDPSEMPL 30 40 50 60 70 80 180 190 200 210 220 mKIAA1 TGVDQTLGLKHPSTSKVNS--------VNPKKPKTSASISE-TRPCSSSSSQTAPSGASS . .: . . : . ..: ..:. :.. : :: :. : .. . . . .: mKIAA0 ESPSQDASAPQDSPTPLGSSPLDHQTPMDPSAPEVVPSPSEWTKACETNWQWGTLTPWNS 90 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 QTVLSNVNTSS---VQSAP-GSSSLRSCPKCNVKFRLLDPLKCHMKRCCPDMINKFLETL :.. . : ::. : :. . : .:. .: . : :.. . : : mKIAA0 TPVVTASEPSLRELVQGRPSGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGERPNTCSECG 150 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 mKIAA1 KS--ENSKAVSKATTDSDKEKLIMLVSDFYYGRHEGTIEESQKTHTTFKCFSCTKVLKNN :: ..:. :.. : . .. .. . ... :.::: : ..::. : mKIAA0 KSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQH-QRTHTGEKPYKCTECEKAF 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 IRFMNHMKHHLELEKQNNETWESHTTCQHCYRQYPNPFQLQCHIESTHTPHDFSTICKIC . : .:: : ..: :. : .: : . .: : ..::: . : : mKIAA0 TQSTNLIKH------QRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQH-QATHTGEK-PYKCPEC 270 280 290 300 310 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 ELSFETEHMLLQHMKDTHKPGEMPYICQVCQFRSSIFSDVETHFRSSHENTKNLLCPFCL : .: ::.:.: : :: :: : : .: : :. :. . .: . : : : mKIAA0 GKRFGQNHNLLKHQK-IHA-GEKPYRCTECG-KSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECG 320 330 340 350 360 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 KVSRMATPYMNHYMRHQKKGIYRCPKCRLQFLTSKEKTEHKLEH---RTFIKPKELEGLP : .. ..: : .. ..:: : : : .:. : : . :. ... mKIAA0 KSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFS 370 380 390 400 410 420 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 PGTKVI--IRASLGSSQSRASSPPSSTIPSTSLQLSVPKSKSTTTKNNSKVS-ANKATTT ....: : : .. .: : :..: . ... : .. : : .:. mKIAA0 VSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTL---IRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSFIR 430 440 450 460 470 480 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 SPQTVA---TTTGKPSASKPGTGTTKSKAKPSYKQKRQRTRKNKFSIDLKNLRCHQGSHM : . . : ::. . : : . :... . : . .: : mKIAA0 SSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAQEL 490 500 510 520 530 540 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 CIECRSKIKDFSSHFSTHINCDFCKYTTNCNKAFTNHMSSHNDHPSKQLYIFKKQSRARR mKIAA0 EQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGFGDPALMTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEGIFMQHQR 550 560 570 580 590 600 >>mKIAA0198 ( 506 res) mpm05258 (506 aa) initn: 103 init1: 79 opt: 204 Z-score: 142.5 bits: 36.5 E(): 0.0085 Smith-Waterman score: 241; 24.149% identity (29.104% ungapped) in 323 aa overlap (304-590:89-392) 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 INKFLETLKSENSKAVSKATTDSDKEKLIMLVSDFYYGRHEGTIEESQKTHTTFKCFSCT ..: . :: .: . .:: : .:. : mKIAA0 FSNGEKLRPHSLPHPEQRPYSCPQLHCGKAFASKYKLYRHMAT-HSAQKPH---QCMYCD 60 70 80 90 100 110 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 KVLKNNIRFMNHMKHHLELEKQNNETWESHTTCQHCYRQYPNPFQLQCHIESTHTPHDFS :... . .:...::. . :.:. . :..: ..: . . . :. . :. . . mKIAA0 KMFHRK----DHLRNHLQTHDPNKEALH----CSECGKNYNTKLGYRRHL-AMHAASSGD 120 130 140 150 160 400 410 420 430 440 mKIAA1 TICKICELSFETEHMLLQHMKDTHK--PG---EMPYICQVCQFRSSIFSDVETHFRSSHE ::.: .::. . ::.:.: . : : . :. :. : .::. :. : mKIAA0 LSCKVCLQTFESTQALLEHLKAHSRRVAGGAKEKKHPCDHCDRRFYTRKDVRRHL-VVHT 170 180 190 200 210 220 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 NTKNLLCPFCLKVSRMATPYMNHYMRHQKKG-------IYRCPKCRLQFLTSKEKTEHKL . :..:: .: . :.. .: :: ::. : : : .:. . . : mKIAA0 GRKDFLCQYCAQ--RFGRK--DHLTRHVKKSHSQELLKIKTEPVDMLGLLSCSSTVSVKE 230 240 250 260 270 280 510 520 530 540 mKIAA1 E--------HRTFIKPKELEGLPP----GTKVIIRASLGSSQSRA--------SSPPSST : : . : . :. : :... : : .: . : : :. mKIAA0 ELSPVLCMASRDVMGAKAFPGMLPMGMYGAHIPTMPSAGMPHSLVHNTLPMGMSYPLESS 290 300 310 320 330 340 550 560 570 580 590 mKIAA1 IPSTSLQLSVPK----SKSTTTKNNSKVSANKATTTSPQTVATTTGKPSASKPGTGTTKS :.: :: :: : : . :: ... . : ... ....:. ..: mKIAA0 PISSSAQLP-PKYQLGSTSYLPDKLPKVEVDSFLAELPGSLSLSSAEPQPASPQPAAAAA 350 360 370 380 390 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 KAKPSYKQKRQRTRKNKFSIDLKNLRCHQGSHMCIECRSKIKDFSSHFSTHINCDFCKYT mKIAA0 LLDEALLAKSPANLSEALCAANVDFSHLLGFLPLNLPPCNPPGATGGLVMGYSQAEAQPL 400 410 420 430 440 450 746 residues in 1 query sequences 1768271 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:48:50 2006 done: Mon Mar 27 10:48:51 2006 Scan time: 0.880 Display time: 0.140 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]