FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0211.ptfa, 1292 aa vs ./tmplib.26680 library 1767725 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8140+/-0.00881; mu= 4.0609+/- 0.588 mean_var=406.9862+/-97.465, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 5 in 1/35 Lambda= 0.0636 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1441 ( 557 res) mpm02367 ( 557) 608 71 8.9e-13 mKIAA1629 ( 675 res) mbg13789 ( 675) 503 61 7.9e-10 mKIAA1388 ( 523 res) mbg09616 ( 523) 263 39 0.0029 mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 ( 736) 262 39 0.0037 mKIAA0478 ( 1234 res) mib07095 (1234) 261 39 0.0053 mKIAA1141 ( 886 res) mef00011 ( 886) 254 38 0.0069 mKIAA1874 ( 435 res) mbg02924 ( 435) 245 37 0.0082 mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 ( 558) 245 37 0.0094 >>mKIAA1441 ( 557 res) mpm02367 (557 aa) initn: 978 init1: 518 opt: 608 Z-score: 321.7 bits: 70.6 E(): 8.9e-13 Smith-Waterman score: 1071; 36.852% identity (41.365% ungapped) in 559 aa overlap (304-832:22-549) 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 SHPSNSIGEPKKLAPELSACSSVPPRQRLKPAHSKLSSCVAALVALQAKRVANVTKEDQP :. : .. . : :. .::.:. ...: mKIAA1 QGALKQESCSPHHSQGLTQRGPGSSPETAGIPASVS--PPQVAGVSFKQSP 10 20 30 40 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 GHTKDSSGPTKEGSKGSPKMPKSPKSPRSPLEATRKSIKPSDSPRSICSDSSSKGSPSVA :: . ..:.: : : .:: :. .::.. .. .: .:. ::. . mKIAA1 GHQSPPASPVKAPSCKPLKEEDEGTVDKSP---PRSPQSPSSGAEA--ADEDSNDSPTSS 50 60 70 80 90 100 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 ASSPPAIPKVRIKTIKTSSGEIKRTVTRILPDPDDPSKSPAESPAGSTITEAP--SEAPG .:: : :::::::::: :.: :::::. :. :: :: :. ..:. . .: mKIAA1 SSSRPL--KVRIKTIKTSCGNITRTVTRV-PSEPDP---PAPLAEGAFLAETSFLKLSP- 110 120 130 140 150 460 470 480 490 500 mKIAA0 DEGTAMPVEEHFSEAGIHSGSPQGDR-KGDENMIKTSDSSSPCRISGSRVPKGSAL---N . :. : . .... :. : : :: . : ...: . .. : . ... . mKIAA1 ----VTPTPEGPKVVSVQLGD--GTRLKGTVLPVATIQNASTAMLMAASVARKAVVLPGG 160 170 180 190 200 210 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 SQASKKQQSTAPQASTPAASLLPKAVHLANLNLVPHSV-AASVTAKSSAQRRSQPQVTQM . .: : .. . . .: . :::: ....: ..: .:::. . .. . : .. mKIAA1 NATSPKTMTKSVLGLVPQT--LPKAEVRTGFSLGGQKVNGASVVMVQPSKSATGPGTAGG 220 230 240 250 260 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 TVPLVHQVKKAAPLIVEVFNKVLHSSNPVPLYAPNLSPPADSRIHVPASGYCCLECGDAF .: .... .::.:::.:.:.: .: : :::::::.. . .: .:: :::::::: mKIAA1 SV-----ISRTQSSLVEAFNKILNSKNLLPAYRPNLSPPAEAGLALPPTGYRCLECGDAF 270 280 290 300 310 320 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 ALEKSLSQHYSRRSVHIEVLCTLCSKTLFFFNKCSLLRHARDHKSKGLVMQCSQLLVKPI .:::::..::.:::..::: :. :.. : :::::::: :::.::.::::::::.:...:. mKIAA1 SLEKSLARHYDRRSMRIEVTCNHCARRLVFFNKCSLLLHAREHKDKGLVMQCSHLVMRPV 330 340 350 360 370 380 690 700 710 720 730 mKIAA0 SADQMFVAAPVNSTAPATPAASSSPKPSP----------------TLDNASSVIPALPLY . ::: :. : . .: :.: : :.: :. .... :.::: mKIAA1 ALDQM-VGQP--DITPLLPVAVP-PVPGPLALPVLGKGEGAVTSSTITTVATEAPVLPLP 390 400 410 420 430 440 740 750 760 770 780 mKIAA0 PD----PVRLIRYGTKCPECHKQMRDYMVLATHFQRTTEETEGLT---CQVCQMLLPNQC . :. . .: ::..: :: .:.:::. . : : : : :.:::.: mKIAA1 TEPPAPPTASVYTCFRCLECKEQCRDKAGMAAHFQQLGPPALGSTSNVCPSCPMMLPNRC 450 460 470 480 490 500 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 SFCAHQRVHAHKSPYCCPECGVLCRSAYFQTHVKENCLHYARKVGYRCIHCGVIHLTLAL :: ::::.: ...:. ::::: .: ::::..: :::..:.:::::. mKIAA1 SFSAHQRTHKNRAPHVCPECGGNFLQANFQTHLREACLHFSRRVGYRCLMLNSSLEL 510 520 530 540 550 850 860 870 880 890 900 mKIAA0 LKSHIQERHCQVFHKCAFCPMAFKTASSTMDHSTTQHPTQPHKPSQLIYKCSCEMVFNKK >>mKIAA1629 ( 675 res) mbg13789 (675 aa) initn: 981 init1: 399 opt: 503 Z-score: 268.9 bits: 61.1 E(): 7.9e-10 Smith-Waterman score: 1066; 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