FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00062.ptfa, 852 aa vs ./tmplib.26680 library 1768165 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0293+/-0.00745; mu= -6.4375+/- 0.494 mean_var=345.0112+/-82.803, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0690 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0600 ( 917 res) mbg03056a ( 917) 1455 159 2.1e-39 mKIAA0744 ( 573 res) mbg11691 ( 573) 1420 155 1.7e-38 >>mKIAA0600 ( 917 res) mbg03056a (917 aa) initn: 1707 init1: 1415 opt: 1455 Z-score: 800.0 bits: 159.2 E(): 2.1e-39 Smith-Waterman score: 1592; 38.851% identity (50.810% ungapped) in 888 aa overlap (168-850:28-911) 140 150 160 170 180 190 mFLJ00 VHPSSPSIPYRTLEPLDTEGAARSVLSSFLPPVPSLPTEPP----EHFPLRKTVSEPNLK :: .:: : . ::::::.:::::: mKIAA0 PQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLLGPYDSRDDFPLRKTASEPNLK 10 20 30 40 50 200 210 220 230 240 mFLJ00 LRYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSS---STPASGCSSPND .: . :... :::..::::.... ....: .: : . :: :.:.:: ::::. mKIAA0 VRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGTGPGVSSVCNSAPGSGPSSPNS 60 70 80 90 100 110 250 mFLJ00 S-----EHG-----PN-------------------------------------------- : :.: :: mKIAA0 SHSTIAENGFTGSVPNIPTEMIPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTN 120 130 140 150 160 170 260 270 280 290 300 mFLJ00 ------PALGSEADGDRRTHSTLGPRGPVLGNPHAPLFLHHGLEPEA--GGTLP----SR : :... ...:.. ..: : . :. . . : : : : : : mKIAA0 SHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDTSPHGHASL 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 360 mFLJ00 LQPILLLDPSVSHAPLWTVPGLGPLPFHFAQPLLTTERLSGS-GLHRPLNRTRSEPLPPS :: .:::. . ... : .:: : :. .. . :. : :. ::::.::.: ::: : mKIAA0 LQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQS 240 250 260 270 280 290 370 380 390 400 mFLJ00 ATASPLLAPLQPRQDRL----KPHVQLIK-----------PAISPPQRPAKPSEKPRLRQ : :. : .:. : . ..:: : :. : . . .:. . mKIAA0 PQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQMQLGKILTKTGELSRQPTTHPEETEEELTEQQEALL 300 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 mFLJ00 IPSAEDLETDGGGVGPMANDGLEHRESGRGPPEGRGSISLQQH------QQVPPWEQ--- .: . .:. . ... ::..: . : . :..... .. : :. mKIAA0 GEGALTIPREGSTESESTQEDLEEEEEEEEEEEEEDCIQVKDEDGESGPDEGPDLEESSA 360 370 380 390 400 410 460 470 480 490 500 mFLJ00 --QHLAGRLSQGSPGDSVLIPL--AQVGHRPLSRTQSSPAAPVSLLSP--EPT------- ..: . .: .: . :: : : :. :.::::::::: :. :: .:: mKIAA0 GYKKLFADAQQLQPLQVYQAPLSLATVPHQALGRTQSSPAAPGSMKSPTDQPTVVKHLFT 420 430 440 450 460 470 mFLJ00 ---------------C------------------------------------------QT : :: mKIAA0 TGVVYDTFMLKHQCMCGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLGKCERIRGRKATLDEIQT 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 mFLJ00 -----------------QVLNSSET--PATGLVYD-------SVDTDTIWNELHSSNAAR : :.:.. : . .: .::.::.:::.:::.:.: mKIAA0 VHSEYHTLLYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAMLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVR 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 mFLJ00 WAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQHGKAS :.: ...::::::. :::::::..:::::::..::::::::::::::. . :::. ... mKIAA0 MAVGCLVELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLSVG 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 mFLJ00 KILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGTGSGEGFNVNV :.::::::.::::::::.::.:::::::::::.:.::::::::: .::: : : :.:::: mKIAA0 KVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNV 660 670 680 690 700 710 670 680 690 700 710 720 mFLJ00 AWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFAPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHVSAKC ::.::.:::.:: :::.::: ::::::.::.::.:::::::::.::: .::::: :.:.: mKIAA0 AWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAQEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARC 720 730 740 750 760 770 730 740 750 760 770 780 mFLJ00 FGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNKVDPLSEESWKQKPNLS ::..:.:::.:::: ::::::::::::::::::::::.:::. ...::.: .:::... mKIAA0 FGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPSVN 780 790 800 810 820 830 790 800 810 820 830 mFLJ00 AIRSLEAVVRVHRKYWGCMQRLAS---CPDSWLPRVPGADAEVEAVTALASLSVGI---- :. .:: :.... :.:.:.::.:. : : : :.:.:.:.: :::: mKIAA0 AVATLEKVIEIQSKHWSCVQRFAAGLGC--SLREAQTGEKEEAETVSAMALLSVGAEQAQ 840 850 860 870 880 890 840 850 mFLJ00 -LAEDRPSERLVEEEEPMNL .: .. : : ::::. mKIAA0 AVATQEHSPR--PAEEPMEQEPAL 900 910 >>mKIAA0744 ( 573 res) mbg11691 (573 aa) initn: 1415 init1: 1371 opt: 1420 Z-score: 783.7 bits: 155.5 E(): 1.7e-38 Smith-Waterman score: 1433; 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