# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpm11077.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1676.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1676, 1373 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917199 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7889+/-0.000195; mu= 12.4906+/- 0.011 mean_var=101.3016+/-19.208, 0's: 46 Z-trim: 54 B-trim: 2 in 1/66 Lambda= 0.127428 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|82933099|ref|XP_125673.5| PREDICTED: CXXC finge (2007) 6334 1176.3 0 gi|74194333|dbj|BAE24685.1| unnamed protein produc ( 412) 2773 521.0 6.4e-145 gi|148700127|gb|EDL32074.1| mCG11334 [Mus musculus ( 630) 2572 484.2 1.2e-133 gi|194042292|ref|XP_001928338.1| PREDICTED: simila (2139) 2269 429.0 1.7e-116 gi|115502139|sp|Q8NFU7.2|TET1_HUMAN RecName: Full= (2136) 2200 416.3 1.1e-112 gi|119574684|gb|EAW54299.1| CXXC finger 6 [Homo sa (2150) 2200 416.3 1.1e-112 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