FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0697.ptfa, 1119 aa vs ./tmplib.26680 library 1767898 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.6231+/-0.00879; mu= -34.4273+/- 0.574 mean_var=722.3411+/-176.765, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0477 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1085 ( 595 res) mbg19731 ( 595) 629 59 2.5e-09 mKIAA0618 ( 971 res) mfj10160 ( 971) 328 38 0.0063 >>mKIAA1085 ( 595 res) mbg19731 (595 aa) initn: 977 init1: 258 opt: 629 Z-score: 259.7 bits: 59.0 E(): 2.5e-09 Smith-Waterman score: 939; 30.347% identity (36.458% ungapped) in 692 aa overlap (426-1101:1-592) 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 AYPPPQFAHALLAAQTFQQIRPPRLPMTHFGGTFPPAQSTWGPFPVRPLSPARATNSPKP :::: :. .:::::::::..:. ...::: mKIAA1 GGTFSPSPNTWGPFPVRPVNPGNTSSSPKH 10 20 30 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 HMVPRHSNQNSSGSQVNSAGSLTSSPTTTASSSASAVPGTTSNGSPSSPSVRRQLFVTVV . . : :::. .: : :.. :.:: ..: ..: . :::.:::. : mKIAA1 NNTARLPNQNGPVLPSESPGLATTGCPITVSSVVAASQQLCMTNSRTPSSVRKQLFACVP 40 50 60 70 80 90 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 KTSNATTTTVTTTASNNSTAPTNATYPMPTAKEHYPVSSPSSPSPPAQPGGVSRNSPLDC ::: .:......:..:. :. .. . ... :.. :.: : . .. .. mKIAA1 KTS-PPATVISSVTSTSSSLPSVSSTSITSGH----VTTTFMPAPTQVPLSSQKVESFSV 100 110 120 130 140 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 GSASPNKGASASEQEASSPPVVEPA-NSRPPHSSSSSGSSSGH--STQQQPPGSVPQEPR :.. .:...: .. . :: .: .:..::. .: :: :::.. .: . mKIAA1 -IPPPKEKVSTQDQPLTNLCTPSPAATSCNSSASNTSGAPEAHPSSTPPPPPGNTQEEGQ 150 160 170 180 190 200 640 650 660 670 680 mKIAA0 PP----LQQSQVPSPDVRMTVPPTATSSAPVAVPSTAPVTYP---MPQTQMGCSQPPKME : :. ..: . :.: : .: ::. . . : .: ... . :. mKIAA1 PSKASDLSPVSMPFASNSETAPLTLASPRLVAADNRDTGSLPQLTVPAPRVSHRMQPRGS 210 220 230 240 250 260 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 APAIRPPSHATAAPHKTPAPVQSSSASVLNVNHIKRPHSVPSSVQLPSTLSTQSACQNSV .. : .:. :. : .: : : . :.. :..::: :... ... : . mKIAA1 FYSVVP----NATMHQDP-----QSIFVTNPVPLTPPQGPPAAVQLSSAVNIMNGSQVHI 270 280 290 300 310 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 HPANKPVAPNFSAPLPFGPFSTLFENNPTNAHAFWG-GPVVSSQSTPESMLSGKSSYLPN .:::: . :.:. :. ::.::... . :. :: ::. :. . .. .. .:..: : mKIAA1 NPANKSLQPTFGPATLFNHFSSLFDSGQVPANQGWGDGPL-PSRVAADASFTVQSAFLSN 320 330 340 350 360 370 810 820 830 840 850 860 mKIAA0 SDPLH----QSDTSKAPGFRPPLQRPAPSPSGIVNMDTPYGSVTPSSTHLGNFASSLSGG : : . :.::::::::: :: . :: :. ..: : :. ... : .: :.. : mKIAA1 SVLGHLENVHPDNSKAPGFRPPSQRVSTSPVGLPSID-PSGNSPSAAAPLTSF-SGIPGT 380 390 400 410 420 430 870 880 890 900 910 920 mKIAA0 QMYGPGAPLGGAPLGGAPTAANFNRQHFSPLSLLTPCSSASNESPAQSVSSGVRAPSPAP ... : : ::.: .:. :::::::: : .:::: mKIAA1 RVFLQG-P---APVG-TPS---FNRQHFSP----HPWTSASNTC---------------- 440 450 460 930 940 950 960 970 980 mKIAA0 SSVPLGSEKPSSVSQDRKVPVPIGTERSARIRQTGTSAPSVIGSNLSTSVGHSGIWSFEG :... . :::.::::: : mKIAA1 ------------------------------------------GTSFVAPVGHGGIWSF-G 470 480 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 IGGNQDKVD-WCNPGMGNPMIHRPMSDPGVFSQHQAMERDSTGIVTPSGTFHQHVPAGYM ... .. .. : . .:: .:. .:::..::::: ::::..:.:.:.. ::: : : mKIAA1 VNAMSEGLSGWSQSVIGNHPMHQQLSDPSTFSQHQPMERDDSGMVAPTNIFHQ--PMG-- 490 500 510 520 530 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA0 DFPKVGSMPFSVYGNAMLPPVAPIADGAGGPIFNGPHSAEPSWNSLIKMVSSSTENNGPQ .:.:.::....: .:: :::.::: :. .:.:: .::....:.: . : mKIAA1 -------LPISMYGGTIIPSHPQLADVPGGPLFNGLHNPDPAWNPMIKVIQNSAECTEAQ 540 550 560 570 580 590 1100 1110 mKIAA0 TVWTGPWAPHMNSVHMNQLG : mKIAA1 QVKQA >>mKIAA0618 ( 971 res) mfj10160 (971 aa) initn: 140 init1: 66 opt: 328 Z-score: 144.9 bits: 38.4 E(): 0.0063 Smith-Waterman score: 345; 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