FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1807.ptfa, 850 aa vs ./tmplib.26680 library 1768167 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4691+/-0.00517; mu= 16.2546+/- 0.345 mean_var=128.4332+/-30.348, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 42 in 1/35 Lambda= 0.1132 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0215 ( 822 res) mpm10302 ( 822) 1692 288 3.4e-78 mKIAA0239 ( 842 res) mpf00448 ( 842) 1487 254 4.1e-68 mKIAA0876 ( 1027 res) mpg00855 (1027) 376 73 1.9e-13 mKIAA4191 ( 931 res) msh25333 ( 931) 364 71 6.8e-13 mKIAA0677 ( 1080 res) mpm07016 (1080) 344 68 7.2e-12 mKIAA0780 ( 1129 res) mic14040 (1129) 343 68 8.2e-12 mKIAA4140 ( 998 res) mfj05126 ( 998) 326 65 5.2e-11 mKIAA1820 ( 1518 res) mpm10033 (1518) 177 41 0.0014 mKIAA0304 ( 1744 res) mbg06324 (1744) 168 39 0.0043 mKIAA1286 ( 649 res) mpm06087 ( 649) 157 37 0.0081 >>mKIAA0215 ( 822 res) mpm10302 (822 aa) initn: 1967 init1: 1397 opt: 1692 Z-score: 1496.3 bits: 287.9 E(): 3.4e-78 Smith-Waterman score: 2192; 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