FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0215.ptfa, 822 aa vs ./tmplib.26680 library 1768195 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9333+/-0.00587; mu= 14.1741+/- 0.392 mean_var=171.8257+/-39.472, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0978 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0239 ( 842 res) mpf00448 ( 842) 1755 260 6.5e-70 mKIAA1807 ( 850 res) mpm10336 ( 850) 1692 251 3.1e-67 mKIAA4191 ( 931 res) msh25333 ( 931) 397 69 3.5e-12 mKIAA0876 ( 1027 res) mpg00855 (1027) 380 66 1.9e-11 mKIAA0780 ( 1129 res) mic14040 (1129) 372 65 4.5e-11 mKIAA0677 ( 1080 res) mpm07016 (1080) 362 64 1.2e-10 mKIAA4140 ( 998 res) mfj05126 ( 998) 335 60 1.6e-09 mKIAA0304 ( 1744 res) mbg06324 (1744) 192 40 0.0026 >>mKIAA0239 ( 842 res) mpf00448 (842 aa) initn: 2101 init1: 1282 opt: 1755 Z-score: 1347.6 bits: 260.3 E(): 6.5e-70 Smith-Waterman score: 2016; 42.963% identity (47.476% ungapped) in 810 aa overlap (33-796:55-833) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 IDLSAAVRVQMSVLPLPLLLAQCIGRSQKNPKE-QKKSAEVFRKDLISAMKIPDSHHVNP :.. .:: .:::: :::.:::::::....: mKIAA0 SDNSDTTDGHVTSTSASRCSKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITAMKIPDSYQLSP 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 DSYYLFTDTWKEEWEKGVQVPANPDSVPTPSLRIISEKVKEMLFVRPRKYIRCSSPESAE :.::...: :..::::::::::. ...: : .:.. : : .. ::.: mKIAA0 DDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRLLPP-----LKGPPTQM----SPDSPT 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 PGYINTLEQAASTCRYDLDDMDIFWLQELNEDLGEMGYGPIDETLMEKTIEVLERHCHEN : . ... :::::..: .::. :: .: :: .:: .:...: :: ::.: mKIAA0 LGEGAHPDWPGGS-RYDLDEIDAYWLELLNSELKEMEKPELDELTLERVLEELETLCHQN 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 MNHAIETVEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILKIPEGSW : .:::: :::::::::::.:::::::..:.::.::::::::::::::::::::.: ::: mKIAA0 MAQAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTGSW 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 LCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGAMKTTRTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEPVTKISH :::.:.::. :.:.::::.:::.: ::.::::.:::::::::::::.:::.:::.::::: mKIAA0 LCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKISH 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 IPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSVKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEVKFKSFC :: ::::: :.::: ::.:::::. ::::::::::::..::::.::: ..:::::::.: mKIAA0 IPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCITAFHVTCAFDRGLEMRTILADNDEVKFKSLC 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 mKIAA0 LKHSQNKPKLGDAEYHHHRVAEQSQAKS--EKTSLRAQKLRELEEEFYTLVQVEDVAKEM .::.. :. .: . : : ::: ::..:: :.:..:::.:: ::. .::... mKIAA0 QEHSDGGPR---SEPTSEPV-EPSQAVEDLEKVTLRKQRLQQLEENFYELVEPAEVAERL 380 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 ELSAFTVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLIPPKEEEENGLVQPKEESIHTRMRMFMHLRQDLE .:. :::::.::::::..: :.::. :: .: ..:.: ... .. :...: ::::::: mKIAA0 DLAEALVDFIYQYWKLKRRANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYRRLKLFTHLRQDLE 440 450 460 470 480 490 480 490 500 510 mKIAA0 RVRNLCYMISRREKLKLSHTKVQEQIFGLQVQLINEEIT--------------------E ::::::::..:::. : . :.::::: ::..::.... : mKIAA0 RVRNLCYMVTRRERTKHTICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCREPSGRRSKGKKNDSKRKGRE 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 GLSLTNALENSLFYPPPRITL-KLKMPKSTSED--------CKDSSTETEHQLSSPGSSS : . .. .. :. .: .: . : : .. . .: . : : . mKIAA0 GPKGSSPEKKEKVKAGPESVLGQLGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQITAEDMAMSEWSLN 560 570 580 590 600 610 580 590 600 610 620 mKIAA0 PGHSKR-SPQMPEEPLDMNVKI---YPRYPLESKSNCLQTSRSHSRCETKSS-SPTPRAP :: . .: . : : .. . . : : .. . .:...: .:.. :: .: mKIAA0 SGHREDPAPGLLSEELLQDEETLLSFMRDPSLRPGDPARKARGRTRLPAKKKPSPLQDGP 620 630 640 650 660 670 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 SAEFYHGQSLGKPLALQAALHGQVSIGNGKNQPNSRVSS---SNGLEGNWSGNITQKVN- ::. .. : : . :. . : .: :.:: :. :. : . mKIAA0 SARTTPDKQPKKAWAQD----GKGTQGPPMRKPPRRTSSHLPSSPAAGDCPVPATLESPP 680 690 700 710 720 690 700 710 720 730 mKIAA0 --SSEVCYDQESMLSSHL--PSPGNIRKSSMEHFSRSFKEATNTWVKPTEDLQYCVKPTK .::. :. . ..: : :: : . ..: ..: .... : mKIAA0 PLASEI-LDKTAPMASDLNVQVPGPT--VSPKPLGR---------LRPPREMKVSRKSPG 730 740 750 760 770 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 NVSSKEQLWGRQLLRRPTGRASYQ-ETDGYCPDLEPSDSEAEGEGSKETPRVKRESSDRE :. . .:: .. :.::: : : ::::.:.: : . :..::.. .: mKIAA0 ARSDAGTGLPSAVAERPKVSLHFDTEADGYFSDEEMSDSEVEAEDSG-VQRASREAGAEE 780 790 800 810 820 830 800 810 820 mKIAA0 NPSHDSARECHGKTKTHPHSHSSMQR mKIAA0 VVRMGVLAS 840 >>mKIAA1807 ( 850 res) mpm10336 (850 aa) initn: 1967 init1: 1397 opt: 1692 Z-score: 1299.4 bits: 251.4 E(): 3.1e-67 Smith-Waterman score: 2192; 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