# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpm10302.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0215.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0215, 822 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917731 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3065+/-0.00019; mu= 12.6822+/- 0.011 mean_var=86.0170+/-16.207, 0's: 36 Z-trim: 50 B-trim: 7 in 2/66 Lambda= 0.138287 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81891667|sp|Q6IE82.1|JADE3_MOUSE RecName: Full= ( 823) 5442 1096.3 0 gi|123121965|emb|CAM21272.1| PHD finger protein 16 ( 824) 5442 1096.3 0 gi|109511472|ref|XP_001056752.1| PREDICTED: simila ( 824) 5236 1055.2 0 gi|34098663|sp|Q92613.1|JADE3_HUMAN RecName: Full= ( 823) 4528 913.9 0 gi|109130629|ref|XP_001100171.1| PREDICTED: PHD fi ( 938) 4528 914.0 0 gi|158255876|dbj|BAF83909.1| unnamed protein produ ( 823) 4520 912.3 0 gi|149744467|ref|XP_001491347.1| PREDICTED: PHD fi ( 824) 4507 909.7 0 gi|57111725|ref|XP_538010.1| PREDICTED: similar to ( 823) 4449 898.2 0 gi|119923239|ref|XP_583146.3| PREDICTED: similar t ( 785) 4290 866.4 0 gi|126337132|ref|XP_001365577.1| PREDICTED: simila ( 820) 3979 804.4 0 gi|224043022|ref|XP_002195036.1| PREDICTED: PHD fi ( 819) 3897 788.0 0 gi|116248179|sp|Q0P4S5.1|JADE3_XENTR RecName: Full ( 817) 3478 704.4 4.6e-200 gi|109510415|ref|XP_234528.4| PREDICTED: similar t ( 542) 3174 643.6 6.2e-182 gi|82188675|sp|Q7ZVP1.1|JADE3_DANRE RecName: Full= ( 795) 2721 553.4 1.3e-154 gi|114158604|ref|NP_001041504.1| Jade3 protein [Ta ( 790) 2621 533.5 1.3e-148 gi|148668426|gb|EDL00750.1| mCG1050919 [Mus muscul ( 355) 2399 488.9 1.6e-135 gi|73970748|ref|XP_862088.1| PREDICTED: similar to ( 791) 2081 425.7 3.6e-116 gi|73970746|ref|XP_862056.1| PREDICTED: similar to ( 792) 2062 421.9 5e-115 gi|118097582|ref|XP_414632.2| PREDICTED: similar t ( 797) 2060 421.5 6.6e-115 gi|73970744|ref|XP_862030.1| PREDICTED: similar to ( 788) 2053 420.1 1.7e-114 gi|73970754|ref|XP_862165.1| PREDICTED: similar to ( 788) 2046 418.7 4.5e-114 gi|67678113|gb|AAH97813.1| LOC733278 protein [Xeno ( 544) 2028 415.0 4.2e-113 gi|210111929|gb|EEA59717.1| hypothetical protein B ( 578) 1999 409.2 2.4e-111 gi|212516969|gb|EEB18923.1| PHD finger protein, pu (2563) 1870 384.1 4e-103 gi|126290186|ref|XP_001370894.1| PREDICTED: simila ( 916) 1807 371.1 1.1e-99 gi|194219920|ref|XP_001504443.2| PREDICTED: PHD fi ( 784) 1796 368.9 4.7e-99 gi|116242597|sp|Q9NQC1.2|JADE2_HUMAN RecName: Full ( 790) 1793 368.3 7.1e-99 gi|148701695|gb|EDL33642.1| PHD finger protein 15, ( 770) 1792 368.1 8e-99 gi|40389491|tpe|CAE30498.1| TPA: Jade2 protein [Mu ( 806) 1792 368.1 8.3e-99 gi|158261965|dbj|BAF83160.1| unnamed protein produ ( 790) 1789 367.5 1.2e-98 gi|168267232|dbj|BAG09672.1| PHD finger protein 15 ( 790) 1787 367.1 1.6e-98 gi|73970750|ref|XP_862116.1| PREDICTED: similar to ( 770) 1786 366.9 1.8e-98 gi|73970752|ref|XP_850716.1| PREDICTED: similar to ( 782) 1785 366.7 2.1e-98 gi|33871210|gb|AAH21962.2| PHF15 protein [Homo sap ( 791) 1781 365.9 3.8e-98 gi|158258707|dbj|BAF85324.1| unnamed protein produ ( 791) 1772 364.1 1.3e-97 gi|40389473|tpe|CAE30490.1| TPA: Jade protein [Cio ( 585) 1769 363.4 1.6e-97 gi|73970742|ref|XP_538629.2| PREDICTED: similar to ( 824) 1770 363.7 1.8e-97 gi|109078746|ref|XP_001102649.1| PREDICTED: simila ( 834) 1768 363.3 2.4e-97 gi|18676594|dbj|BAB84949.1| FLJ00195 protein [Homo ( 639) 1765 362.6 2.9e-97 gi|114601894|ref|XP_517936.2| PREDICTED: PHD finge ( 825) 1766 362.9 3.1e-97 gi|194377302|dbj|BAG57599.1| unnamed protein produ ( 793) 1765 362.7 3.4e-97 gi|119582660|gb|EAW62256.1| PHD finger protein 15, ( 834) 1765 362.7 3.6e-97 gi|119582656|gb|EAW62252.1| PHD finger protein 15, ( 850) 1765 362.7 3.6e-97 gi|197245973|gb|AAI68752.1| Unknown (protein for I ( 549) 1760 361.5 5.2e-97 gi|123255297|emb|CAM26924.1| PHD finger protein 15 ( 576) 1755 360.6 1.1e-96 gi|148701696|gb|EDL33643.1| PHD finger protein 15, ( 793) 1755 360.7 1.4e-96 gi|116248178|sp|Q6ZQF7.2|JADE2_MOUSE RecName: Full ( 829) 1755 360.7 1.4e-96 gi|149052516|gb|EDM04333.1| PHD finger protein 15 ( 829) 1753 360.3 1.9e-96 gi|40389481|tpe|CAE30494.1| TPA: putative Jade2 pr ( 463) 1735 356.5 1.5e-95 gi|194208456|ref|XP_001501746.2| PREDICTED: PHD fi ( 851) 1722 354.1 1.4e-94 >>gi|81891667|sp|Q6IE82.1|JADE3_MOUSE RecName: Full=Prot (823 aa) initn: 5442 init1: 5442 opt: 5442 Z-score: 5865.6 bits: 1096.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 5442; 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