FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0575.ptfa, 1034 aa vs ./tmplib.26680 library 1767983 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9994+/-0.00633; mu= 8.7947+/- 0.422 mean_var=204.4946+/-48.438, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 8 in 1/35 Lambda= 0.0897 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4095 ( 825 res) mfj42182 ( 825) 1621 223 1.3e-58 >>mKIAA4095 ( 825 res) mfj42182 (825 aa) initn: 1622 init1: 869 opt: 1621 Z-score: 1144.5 bits: 223.1 E(): 1.3e-58 Smith-Waterman score: 2212; 46.339% identity (57.526% ungapped) in 833 aa overlap (329-1034:28-825) 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 LSSTDEDEEAGTEGCFEAGSTSEQRGPVKRERSHSHDSASSSLSSRASGSVLY-GESLVQ :: .:..:: .. .:::.. : : . mKIAA4 AALDLSAKEAERVPASENDSEELLIDLERPQSNSSAVTG----TSGSIMENGVSSSS 10 20 30 40 50 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 PSGPPQGELTRSPPPCGPAEEGRAPGEIQRLRVSQGSTVISRHSPGLVPQPDSSLRTGRR .: :: .: .: .:: :: ...:. : . . . . mKIAA4 TAGKPQQQLL-TPTSSIRLDEG----------VSASTAVV-----GEILKQECD------ 60 70 80 90 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 SLQVPAAPSSQLSSSSGSSSTCAVPTANVLVLQASQCSMAKACRQPPIVFLPKLVYDMLL ::. : : :. . ::.:::. :..:. . . .. : ::...: : .:..: mKIAA4 SLDPPMASSTTSKPSSSSSSS-----AQALAWSRQPRGLHTAL--PPVIILSKAAYSLLG 100 110 120 130 140 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 STDSSGLPKSASLLPSPSVMWTSSFRPLLSKMMTSTEQSLYYRQWTVPRPSHMDYGNRAE : .. ::.:.:::: .: :.::.:: : : :.: :::::::::: : : ::.:. . mKIAA4 SQKGGRLPSSSSLLPHADVAWVSSLRPGLHKDMSSEEQSLYYRQWTSARQHHADYSNQPD 150 160 170 180 190 200 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 --GRVDSFHPRRLLLSGPPQIGKTGAYLQFLSILSRMLIRLTEVDVYDEEEINTSFREES . . ..:::::::.::::.::::.::::: :: :::::: :::::.::::::. ..: mKIAA4 PISGARTLHPRRLLLTGPPQVGKTGSYLQFLRILFRMLIRLLEVDVYNEEEINTDHSDDS 210 220 230 240 250 260 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 EWRYLQLADPWPDLELFQKMPFDYIIHDPKYEDASLICSHPQTIKSEDRGMSRKPEDLYV : . ..::::.: :.::::: .:::::. ::. :. . ... : :. mKIAA4 ELSQSE-GEPWPDIETFSKMPFDVSVHDPKYRLMSLVYSEKLAGIKQEVIKEYKVEEPR- 270 280 290 300 310 320 660 670 680 690 mKIAA0 RRQTARMRLSKYAAYNTYHHCEQCQQYMGFHPHYQ------------------------- .:.: : :..::::::.::::::::::.: : : mKIAA4 QRETMSMMLTQYAAYNTFHHCEQCQQYMAFTPASQMSDSTLHAFTFSSSMLGEEVQLYFI 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 ---ERRSSF--------------------------------------------------- ..: : mKIAA4 IPKSKESHFVFSKQGRHLESMRLPLVSDKNLNAVKSPIFTPSSGRHEHGLLNLFHAMEGI 390 400 410 420 430 440 700 710 mKIAA0 -------------------------------------------IKELCYHNLELERNRQE :::: :::::::::: : mKIAA4 SHLHLLVVKEYEMPLYRKYWPNHIMLVLPGMFNNAGVGAARFLIKELSYHNLELERNRLE 450 460 470 480 490 500 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 ELGVKPQDVWPFIVIADDSCVMWNVADVDCAGERSREFSWSERNVSLKYIMLHIEASPNI ::::: : ::::::. :::::.::. .:. . : . : .::::: .. ::::.:.: mKIAA4 ELGVKRQCVWPFIVVMDDSCVLWNIHSVQEQTSQPTEAGISSKNVSLKSVLQHIEATPKI 510 520 530 540 550 560 780 790 800 810 820 830 mKIAA0 THYALLGMRKWASKTRGREVQEPFSRCHVHDFIILNVDLTQNVQYNQNRFTCDDVDFNLR :::.::..:: :: .. .. :::::::::::.::.::::::::. ::. :.::::::: mKIAA4 IHYAILGIQKWNSKLTSQSLKAPFSRCHVHDFILLNIDLTQNVQYDFNRYFCEDVDFNLR 570 580 590 600 610 620 840 850 860 870 880 890 mKIAA0 VHSAGLLLCRFNRFSVMKKQIAVGGHRSFHITSK--VSDSSVAIVPSQYICAPDSKHTFL ..:.:::.:::: ::.:::.. :::.:.: : : ::.. : :.: ::.:::::.::.: mKIAA4 TNSSGLLICRFNNFSLMKKHVQVGGQRDFIIKPKLMVSENVVPILPLQYVCAPDSEHTLL 630 640 650 660 670 680 900 910 920 930 940 950 mKIAA0 AAPAQLLLEKFLQYHSHRFFPLSLKNHSHPVLSVDCYLNLGPQISVCYVSSRPHSLNISC :::::.:::::::. :...:: ...: . :::..:::::.: ....::::::::: :..: mKIAA4 AAPAQFLLEKFLQHASYKLFPKAIHNFKSPVLAIDCYLNIGQEVAICYVSSRPHSSNVNC 690 700 710 720 730 740 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 SDMVFSGLLLYLCDSFVGASFLKKFHFLKGATLCVICQDRNSLRQTVVRLELEDEWQFRL . :::::::::::::::..::::.::::::::::::::.:::::.::::::::::::: mKIAA4 EGVFFSGLLLYLCDSFVGADLLKKFKFLKGATLCVICQDRSSLRQTIVRLELEDEWQFRL 750 760 770 780 790 800 1020 1030 mKIAA0 RDEFQTANAKEDRPLFFLTARHI ::::::::...:.::.:::.::. mKIAA4 RDEFQTANSSDDKPLYFLTGRHV 810 820 1034 residues in 1 query sequences 1767983 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:23:26 2006 done: Mon Mar 27 10:23:27 2006 Scan time: 1.070 Display time: 0.080 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]