FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00153.ptfa, 505 aa vs ./tmplib.26680 library 1768512 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9225+/-0.00817; mu= -8.6470+/- 0.541 mean_var=479.6982+/-116.520, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0586 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1308 ( 924 res) mbh02485 ( 924) 920 92 2.3e-19 mKIAA0959 ( 333 res) mid17095 ( 333) 340 42 6.8e-05 >>mKIAA1308 ( 924 res) mbh02485 (924 aa) initn: 1251 init1: 590 opt: 920 Z-score: 439.9 bits: 91.8 E(): 2.3e-19 Smith-Waterman score: 1184; 42.500% identity (47.222% ungapped) in 520 aa overlap (35-505:364-880) 10 20 30 40 50 60 mFLJ00 AEAREAEKLLEDFLKEAKGEQTEEEKRLAWSGP-PRIAQTPGSEFAEDCVEEEGPSSEGP :.: : : :. . : . :.: .: : mKIAA1 PVPEPPQEPEPSLALAPELEPAVSQSLELESAPVPTPALEPSWSLPE--ATENG-LTEKP 340 350 360 370 380 390 70 80 90 100 110 120 mFLJ00 ELLDFSVDDVAEQLTLMDVELFLRVRSCECLGSMWSQRDRPGAAGISPTVRATVAQFNTV .:: : : ::::.::::.::: .: .::::.:::::. : ..::.::::::::.: mKIAA1 HLLLFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVAQFNNV 400 410 420 430 440 450 130 140 150 160 170 180 mFLJ00 TGCVLGSVLAAPGLAASQRAQRIEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRS ..::. . :. .. : .::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::.. mKIAA1 ANCVITTCLGDQSMKAPDRARVVEHWIEVARECRALKNFSSLYAILSALQSNAIHRLKKT 460 470 480 490 500 510 190 200 210 220 230 mFLJ00 WGAVSREPLSVFRKLSQIFSDEDNHLSSRAILSQEETTE---DDDCPSGSL----PSKLP : :::. . ::.:::.:::::.:. :: .: .: :.. . : . . . mKIAA1 WEEVSRDSFRVFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPRRAQRRQKETGVI 520 530 540 550 560 570 240 250 260 270 280 290 mFLJ00 PGPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDTLKGNLINFEKRRKEWEILARIQQLQQRCQRYSLSPR : :::::::::::::::::. : : : ::::::::::.:..:.:. ::. :. ::..:. mKIAA1 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPE 580 590 600 610 620 630 300 310 320 330 340 mFLJ00 PPILAALRAQRQLSEEQSYRVSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKR----------LSA . . .::...::: .:: .: .:::. : .. : .. ...:: ::. mKIAA1 EHFGTWFRAMERLSEAESYTLSCELEPPSESASNTLRSKKSTAIVKRWSDRQAPSTELST 640 650 660 670 680 690 350 360 370 380 mFLJ00 KLSREKNS------SPGGSPGDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRNREP---- . : ...: :: . :: .. : : :: : :: ..: mKIAA1 SSSAHSKSCDQLRCSPYLGSGDITDALSVHSAGSSSSDVEEINMSFVPESPDGQEKKFWE 700 710 720 730 740 750 390 400 410 420 430 mFLJ00 PPPGSPPASPGPQSPSTKLSLTMDPPGPWPVTLTPS---------SSRVPLLGQQTSEAR : : . : .: :.. : . : .: : . :: .:: .::... mKIAA1 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVSTTRTHKRSVSGVCSYSSSLPLYNQQVGDCC 760 770 780 790 800 810 440 450 460 470 480 490 mFLJ00 VIRVSINNNHGNLYRSILLTCQDKAPSVVQRALEKHNVPQPWARDYQLFQVLPGDRELLI .::::.. ..::.:.:::.: :::::.:...:..:::. . .::.: :.. :..: : mKIAA1 IIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPTVIRKAMDKHNLDEDEPEDYELVQIISEDHKLKI 820 830 840 850 860 870 500 mFLJ00 PDGANVFYAM :..::::::: mKIAA1 PENANVFYAMNSTANYDFILKKRTFTKGAKVKHGASSTLPRMKQKGLRIAKGIF 880 890 900 910 920 >>mKIAA0959 ( 333 res) mid17095 (333 aa) initn: 548 init1: 317 opt: 340 Z-score: 180.2 bits: 42.3 E(): 6.8e-05 Smith-Waterman score: 520; 38.194% identity (45.082% ungapped) in 288 aa overlap (259-505:1-285) 230 240 250 260 270 280 mFLJ00 GSLPSKLPPGPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDTLKGNLINFEKRRKEWEILARIQQLQQRC : ..:.::::::::.:.:..:.:. ::. : mKIAA0 DYIEGGLINFEKRRREFEVIAQIKLLQSAC 10 20 30 290 300 310 320 330 340 mFLJ00 QRYSLSPRPPILAALRAQRQLSEEQSYRVSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKL . : ..: .. .. :. ::::.:: .: :: : . .::. :. :..:::: : mKIAA0 NSYCMGPDQKFIQWFQRQQLLSEEESYALSCEIEAAADANTTSPKPRK--SMVKRLSL-L 40 50 60 70 80 350 360 370 380 390 mFLJ00 SREKNSSPGGSPG--DPSSPTS--------SVSPGSPPSSPRNREPPP--PGSPPASPGP .. ::..: .:.: .: ::: .: :. . : : : . : : mKIAA0 FLGSDIIPGSTPTKEQPKSAASGSSGESMDSVSVSSCESNHSEAEEGPVTPMDTPDEPQK 90 100 110 120 130 140 400 410 420 mFLJ00 ---QSPSTKLSL-TMD---------------PP----GP----WPVTLTPSSSRV--PLL .: :. :. .:: :: .: :..: .: : :. mKIAA0 KLSESSSSCSSIHSMDTNSSGMSSLINPLSSPPTCNNNPKIHKRSVSVTSITSTVLPPVY 150 160 170 180 190 200 430 440 450 460 470 480 mFLJ00 GQQTSEARVIRVSINNNHGNLYRSILLTCQDKAPSVVQRALEKHNVPQPWARDYQLFQVL .::. .. .::.:...:.::.:.::.:: :::.:.:.:::. :::. . :..:.: ::. mKIAA0 NQQNEDTCIIRISVEDNNGNMYKSIMLTSQDKTPAVIQRAMSKHNLESDPAEEYELVQVI 210 220 230 240 250 260 490 500 mFLJ00 PGDRELLIPDGANVFYAM :.::.:::.::::::: mKIAA0 SEDKELVIPDSANVFYAMNSQVNFDFILRKKNSVEEQVKLRSRTSLTLPRTAKRGCWSNR 270 280 290 300 310 320 505 residues in 1 query sequences 1768512 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:07:26 2006 done: Mon Mar 27 10:07:27 2006 Scan time: 0.750 Display time: 0.040 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]