FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1820.ptfa, 1518 aa vs ./tmplib.26680 library 1767499 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8872+/-0.00748; mu= -19.2848+/- 0.489 mean_var=461.1041+/-115.838, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0597 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0292 ( 1725 res) mbg10230 (1725) 758 81 2.6e-15 mKIAA0722 ( 1004 res) mbg09316 (1004) 268 38 0.0088 >>mKIAA0292 ( 1725 res) mbg10230 (1725 aa) initn: 905 init1: 407 opt: 758 Z-score: 367.2 bits: 80.9 E(): 2.6e-15 Smith-Waterman score: 1176; 25.716% identity (30.338% ungapped) in 1641 aa overlap (3-1514:179-1698) 10 20 30 mKIAA1 HSHFMPLLNPSPTDAASSVDPQAGNCKPLQKE ..:: :.:.:. : . .:.. : . : mKIAA0 SSTPSPLMQSGENLQCGQGNVPMSSRNRILQLMPQLSPTPS-MMPSPNSHAAGFKGFGLE 150 160 170 180 190 200 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 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