FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0698.ptfa, 1169 aa vs ./tmplib.26680 library 1767848 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2314+/-0.00425; mu= 20.6906+/- 0.284 mean_var=79.5169+/-18.496, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 56 in 1/35 Lambda= 0.1438 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4124 ( 1066 res) mid09093 (1066) 1109 241 8.9e-64 >>mKIAA4124 ( 1066 res) mid09093 (1066 aa) initn: 2064 init1: 742 opt: 1109 Z-score: 1237.4 bits: 240.8 E(): 8.9e-64 Smith-Waterman score: 3668; 49.860% identity (51.054% ungapped) in 1069 aa overlap (18-1078:10-1061) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 IFHFLFLKVLWAMKAGHLLWALLLMHSLWSIPTDGAIRNYYLGIQDMQWNYAPKGRNVIT :: ......: .. : ..:..:: . :.:: .: . mKIAA4 PRGRKMKFLLLSTFIFLYSSLALARD---KHYFIGITEAVWDYA-SGTE--E 10 20 30 40 70 80 90 100 110 mKIAA0 NQTLNNDTVASSF-LKSGKNRIGSSYKKTVYKEYSDGTYTEEIAKPAWLGFLGPLLQAEV .. .. :: :.: :..: 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