FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1082.ptfa, 1150 aa vs ./tmplib.26680 library 1767867 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8590+/-0.00605; mu= 4.4811+/- 0.404 mean_var=193.5215+/-47.559, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 43 in 1/35 Lambda= 0.0922 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0742 ( 1334 res) mpm06338 (1334) 1257 180 1.6e-45 mKIAA1380 ( 2428 res) meg02309 (2428) 1083 158 2.3e-38 >>mKIAA0742 ( 1334 res) mpm06338 (1334 aa) initn: 1330 init1: 699 opt: 1257 Z-score: 909.7 bits: 180.5 E(): 1.6e-45 Smith-Waterman score: 1502; 31.214% identity (39.178% ungapped) in 1038 aa overlap (74-1104:54-887) 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 ADPTASASASAPTAAAVVSGDPGPALRTRAWRAGTVRAMS--GAVPQDLAIFVEFDGCNW : .::.::.: .. .:: . ::::: .: mKIAA0 VGKRFLSLSAAEGNEGGQDNWDLERVAEWPWLSGTIRAVSHTDVTKKDLKVCVEFDGESW 30 40 50 60 70 80 110 120 130 140 150 mKIAA1 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:::::::::::::: :::..:: mKIAA0 FGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWIRCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGD 700 710 720 730 740 940 950 960 970 980 990 mKIAA1 MVHAARGKWGIKANCPCISRQSKSVLRPAVTNGISQLPSVTPSASSGNETTFSSGGGAAA .::..:.:::::::::: .:: : .::. . ..: .. ::.. :. : . mKIAA0 IVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPALKEDLKQ------TSLSGEKPTL---GTMVQ 750 760 770 780 790 1000 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA1 VTNPEPDQVPKGAGTDGRSEEPLKAEGSASNSNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLA ..: ::. . : :... . ....: :: .. : :.:::::. mKIAA0 QSSP--------------VLEPVAVCGEAASKPA--SSVKPTCPTSTSP---LNWLADLT 800 810 820 830 1060 1070 1080 1090 1100 1110 mKIAA1 TQKAKEETKDAGSLRSVLNKESHSPFGLDSFNSTAKVSPHVTSDLAHPRRWGCSPSRTLH . ....:.:. .:..: . : .:. . : .: . : mKIAA0 SGNVNKENKEKQLTMPILKNEIKCLPPLPPLNKPSTVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNL 840 850 860 870 880 890 1120 1130 1140 1150 mKIAA1 EHRSLQDPGRAHCFSQEAPGLGNVYLVKNRFVVK mKIAA0 LNSSTAKTENGLKNTPKILDDIFASLVQNKTSSDSSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCD 900 910 920 930 940 950 >>mKIAA1380 ( 2428 res) meg02309 (2428 aa) initn: 1170 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