# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpm09246.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0564.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0564, 1246 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7920650 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8031+/-0.000184; mu= 12.0081+/- 0.010 mean_var=83.3752+/-16.369, 0's: 39 Z-trim: 48 B-trim: 14 in 1/66 Lambda= 0.140461 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|149266164|ref|XP_920456.3| PREDICTED: hypotheti (1905) 8243 1681.1 0 gi|109501906|ref|XP_214237.4| PREDICTED: similar t (2021) 7871 1605.7 0 gi|57160636|emb|CAI39586.1| novel protein [Homo sa (1429) 7243 1478.4 0 gi|109120580|ref|XP_001091849.1| PREDICTED: simila (1903) 7224 1474.6 0 gi|73989044|ref|XP_848634.1| PREDICTED: similar to (1904) 7197 1469.1 0 gi|126337713|ref|XP_001368914.1| PREDICTED: hypoth (1908) 6770 1382.6 0 gi|118084822|ref|XP_425624.2| PREDICTED: hypotheti 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