FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0348.ptfa, 1299 aa vs ./tmplib.26680 library 1767718 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1553+/-0.00643; mu= -5.9638+/- 0.418 mean_var=423.3251+/-105.881, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0623 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0910 ( 1584 res) mbg06264 (1584) 3307 313 2.6e-85 mKIAA0851 ( 611 res) mbh00089 ( 611) 586 68 6.7e-12 mKIAA0966 ( 1169 res) mpm04106 (1169) 563 66 4.2e-11 >>mKIAA0910 ( 1584 res) mbg06264 (1584 aa) initn: 2735 init1: 1488 opt: 3307 Z-score: 1623.8 bits: 313.0 E(): 2.6e-85 Smith-Waterman score: 3504; 45.178% identity (49.312% ungapped) in 1348 aa overlap (1-1274:145-1453) 10 20 30 mKIAA0 SSLSVRSSFPASFTGSSSRAPVRTQWMNQL :..:. :. : . . . : : :: mKIAA0 SLRVDASDEDRISEVRKVLNSGNFYFAWSASGVSLDLSLNAHRSMQEHTTDNRFFW-NQS 120 130 140 150 160 170 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 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