# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpm09063.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1815.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1815, 895 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7919796 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9755+/-0.000184; mu= 14.7022+/- 0.010 mean_var=75.0927+/-14.838, 0's: 32 Z-trim: 43 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.148005 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|118597349|sp|Q3UVK0.2|ERMP1_MOUSE RecName: Full ( 898) 5916 1273.3 0 gi|148709742|gb|EDL41688.1| mCG124990, isoform CRA ( 918) 5916 1273.3 0 gi|74209380|dbj|BAE23269.1| unnamed protein produc ( 898) 5910 1272.0 0 gi|81864306|sp|Q6UPR8.1|ERMP1_RAT RecName: Full=En ( 898) 5670 1220.8 0 gi|117949602|sp|Q7Z2K6.2|ERMP1_HUMAN RecName: Full ( 904) 5172 1114.4 0 gi|194034135|ref|XP_001924252.1| PREDICTED: endopl ( 905) 5115 1102.3 0 gi|149736855|ref|XP_001493226.1| PREDICTED: endopl ( 893) 5083 1095.4 0 gi|126335629|ref|XP_001365350.1| PREDICTED: hypoth ( 899) 4842 1044.0 0 gi|73946936|ref|XP_852123.1| PREDICTED: similar to ( 917) 4753 1025.0 0 gi|26349293|dbj|BAC38286.1| unnamed protein produc ( 680) 4555 982.6 0 gi|109111623|ref|XP_001108869.1| PREDICTED: simila (1016) 4501 971.2 0 gi|224091246|ref|XP_002192981.1| PREDICTED: simila ( 922) 3887 840.1 0 gi|118597350|sp|Q0VGW4.1|ERMP1_XENLA RecName: Full ( 876) 3789 819.1 0 gi|66347358|emb|CAI95005.1| endoplasmic reticulum ( 518) 3147 681.8 2e-193 gi|148709741|gb|EDL41687.1| mCG124990, isoform CRA ( 850) 2788 605.4 3.5e-170 gi|149062677|gb|EDM13100.1| rCG48104 [Rattus norve ( 850) 2632 572.1 3.7e-160 gi|211826946|gb|AAH31630.2| ERMP1 protein [Homo sa ( 376) 2347 510.9 4.3e-142 gi|210091075|gb|EEA39335.1| hypothetical protein B ( 889) 2337 509.1 3.5e-141 gi|47077855|dbj|BAD18796.1| unnamed protein produc ( 419) 2265 493.4 8.6e-137 gi|21618719|gb|AAH31519.1| Ermp1 protein [Mus musc ( 317) 2179 475.0 2.4e-131 gi|193787467|dbj|BAG52673.1| unnamed protein produ ( 351) 2093 456.6 8.6e-126 gi|10439948|dbj|BAB15604.1| unnamed protein produc ( 317) 1989 434.4 3.9e-119 gi|190583340|gb|EDV23411.1| hypothetical protein T ( 846) 1971 430.9 1.1e-117 gi|156546880|ref|XP_001606695.1| PREDICTED: simila ( 883) 1893 414.3 1.2e-112 gi|47223597|emb|CAF99206.1| unnamed protein produc ( 913) 1850 405.1 7.2e-110 gi|55731416|emb|CAH92422.1| hypothetical protein [ ( 303) 1828 400.0 8.3e-109 gi|83318276|gb|AAI08866.1| LOC398673 protein [Xeno ( 408) 1803 394.8 4.2e-107 gi|170285061|gb|AAI61393.1| LOC100145630 protein [ ( 400) 1795 393.1 1.4e-106 gi|189539973|ref|XP_001921528.1| PREDICTED: simila ( 663) 1741 381.7 5.8e-103 gi|32766491|gb|AAH55270.1| LOC398673 protein [Xeno ( 380) 1703 373.4 1.1e-100 gi|157018304|gb|EAA07277.4| AGAP003432-PA [Anophel ( 874) 1596 350.9 1.5e-93 gi|193910545|gb|EDW09412.1| GI19045 [Drosophila mo ( 862) 1567 344.7 1.1e-91 gi|193910546|gb|EDW09413.1| GI20486 [Drosophila mo ( 861) 1538 338.5 7.9e-90 gi|187029005|emb|CAP31863.1| Hypothetical protein ( 894) 1537 338.3 9.4e-90 gi|198136160|gb|EDY69036.1| GA24794 [Drosophila ps ( 862) 1536 338.0 1.1e-89 gi|194157383|gb|EDW72284.1| GK20844 [Drosophila wi ( 861) 1535 337.8 1.2e-89 gi|193902156|gb|EDW01023.1| GH20682 [Drosophila gr ( 862) 1531 337.0 2.2e-89 gi|194145573|gb|EDW61969.1| GJ20013 [Drosophila vi ( 865) 1530 336.8 2.6e-89 gi|194110367|gb|EDW32410.1| GL11618 [Drosophila pe ( 862) 1526 335.9 4.6e-89 gi|190620194|gb|EDV35718.1| GF12333 [Drosophila an ( 862) 1523 335.3 7.2e-89 gi|21903501|sp|Q09216.2|YP67_CAEEL RecName: Full=U ( 895) 1523 335.3 7.4e-89 gi|194177895|gb|EDW91506.1| GE12043 [Drosophila ya ( 862) 1522 335.1 8.4e-89 gi|194110373|gb|EDW32416.1| GL11624 [Drosophila pe ( 879) 1515 333.6 2.4e-88 gi|198136164|gb|EAL25422.2| GA15604 [Drosophila ps ( 881) 1514 333.4 2.8e-88 gi|198136159|gb|EAL25420.2| GA21772 [Drosophila ps ( 861) 1507 331.9 7.7e-88 gi|194170880|gb|EDW85781.1| GK23251 [Drosophila wi ( 904) 1507 331.9 8e-88 gi|194110366|gb|EDW32409.1| GL10445 [Drosophila pe ( 861) 1506 331.6 9e-88 gi|194194230|gb|EDX07806.1| GD11449 [Drosophila si ( 862) 1506 331.6 9e-88 gi|25395595|pir||D88216 protein B0495.7 [imported] ( 863) 1503 331.0 1.4e-87 gi|190657987|gb|EDV55200.1| GG21965 [Drosophila er ( 872) 1502 330.8 1.6e-87 >>gi|118597349|sp|Q3UVK0.2|ERMP1_MOUSE RecName: Full=End (898 aa) initn: 5916 init1: 5916 opt: 5916 Z-score: 6821.0 bits: 1273.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 5916; 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