FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1021.ptfa, 1196 aa vs ./tmplib.26680 library 1767821 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2053+/-0.00543; mu= 11.8661+/- 0.362 mean_var=141.5228+/-33.571, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1078 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0956 ( 1210 res) mpm12246 (1210) 3489 555 2.2e-158 mKIAA1137 ( 923 res) meh02020 ( 923) 1568 256 1.6e-68 mKIAA1939 ( 798 res) mng04094 ( 798) 1312 216 1.4e-56 mKIAA0715 ( 889 res) mbp06183 ( 889) 1069 179 3.6e-45 mKIAA0566 ( 1521 res) mbg09880 (1521) 1066 179 7.2e-45 mKIAA4233 ( 1195 res) mbg18924 (1195) 810 139 5.9e-33 mKIAA0611 ( 1093 res) mbh02036 (1093) 539 96 2.7e-20 mKIAA4195 ( 1061 res) mbg00956 (1061) 181 41 0.0016 >>mKIAA0956 ( 1210 res) mpm12246 (1210 aa) initn: 2700 init1: 1089 opt: 3489 Z-score: 2935.8 bits: 555.3 E(): 2.2e-158 Smith-Waterman 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. .:... ..... : . .:.:.:.: .:. .. mKIAA1 RKARKKMVDSSHAVGNGFTYQGNLSSSKLTSVLEAVAGEYALVINGHSLAHALE------ 450 460 470 480 490 500 860 870 880 890 900 910 mKIAA1 SSGNYRELFLEICRNCSAVLCCRMAPLQKAQIVKLIKFSKEHPITLAIGDGANDVSMILE .... ::: :.::.:::..::::::.:.:.: :. .:::::::::::::: mKIAA1 --ADMELEFLETACACKAVICCRVTPLQKAQVVELVKKYKK-AVTLAIGDGANDVSMIKT 510 520 530 540 550 920 930 940 950 960 970 mKIAA1 AHVGIGVIGKEGRQAARNSDYAIPKFKHLKKMLLVHGHFYYIRISELVQYFFYKNVCFIF ::.:.:. :.:: ::. :::.. .:: :...:::::.. :.:. ... :::::: : . mKIAA1 AHIGVGISGQEGIQAVLASDYSFSQFKFLQRLLLVHGRWSYLRMCKFLCYFFYKNFAFTM 560 570 580 590 600 610 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA1 PQFLYQFFCGFSQQTLYDTAYLTLYNISFTSLPILLYSLMEQHVGIDVLKRDPTLYRDIA .: . :::::: ::.:: ..::::: .::::.: .....: : . . : ::. mKIAA1 VHFWFGFFCGFSAQTVYDQYFITLYNIVYTSLPVLAMGVFDQDVPEQRSMEYPKLYEPGQ 620 630 640 650 660 670 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA1 KNALLRWRVFIYWTFLGVFDALVFFFGAYFIFENTTVTINGQMFGNWTFGTLVFTVMVLT : :. : :. :.. ....:: : .: ..: . :. .:.. : : .:.. mKIAA1 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:::::::::.: . : :.: :: ::: :......::. : .. mKIAA0 KIRSKTQNYLNLYAVEGLRTLCIAKRVLSKEEY--AC-WLQSHIEAEASVESREELLFQS 820 830 840 850 860 870 730 740 750 760 770 780 mKIAA1 YEQIEKDLVLLGATAVEDRLQEKAADTIEALQKAGIKVWVLTGDKMETASATCYACKLFR ..:..: :::::..:::::: . .:: :..::...:::::::.::: :::::. mKIAA0 AVRLERNLHLLGATGIEDRLQEGVPETIAKLRQAGLQIWVLTGDKQETAINIAYACKLLD 880 890 900 910 920 930 790 800 810 820 830 mKIAA1 RSTQLLELTTKKLE------EQSLHDVLFDLSKTVLRCSGSMTRDSFS----GLSTDMH- .. ... :.. . : .: : : ...:. : : .:: . ::: mKIAA0 HGEEVITLNADSQEACAALLDQCLSYVQSRNPRSTLQNSESNLSVGFSFNPVSTSTDASP 940 950 960 970 980 990 840 850 860 870 880 890 mKIAA1 DYGLIIDGAALSLIM-KPREDGSSSGNYRELFLEICRNCSAVLCCRMAPLQKAQIVKLIK . .:.::: .:. . : :: :: . ..: .::::: .::::...:::.. mKIAA0 SPSLVIDGRSLAYALEKSLEDK---------FLFLAKQCRSVLCCRSTPLQKSMVVKLVR 1000 1010 1020 1030 1040 900 910 920 930 940 950 mKIAA1 FSKEHPITLAIGDGANDVSMILEAHVGIGVIGKEGRQAARNSDYAIPKFKHLKKMLLVHG :: . .:::::::::::::: : ::.:. :.:: ::. ::.:.:.:..:...:.::: mKIAA0 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