# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpm08381.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1333.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1333, 731 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7919486 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7573+/-0.000183; mu= 14.5025+/- 0.010 mean_var=72.3417+/-14.038, 0's: 34 Z-trim: 46 B-trim: 49 in 2/63 Lambda= 0.150793 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81889411|sp|Q5RJY2.1|G2E3_MOUSE RecName: Full=G ( 716) 4883 1072.2 0 gi|67967629|dbj|BAE00297.1| unnamed protein produc ( 706) 3967 872.9 0 gi|114149932|sp|Q4R9C4.2|G2E3_MACFA RecName: Full= ( 706) 3961 871.6 0 gi|67969244|dbj|BAE00975.1| unnamed protein produc ( 706) 3955 870.3 0 gi|149692816|ref|XP_001489219.1| PREDICTED: simila ( 706) 3949 869.0 0 gi|73962928|ref|XP_547761.2| PREDICTED: similar to ( 718) 3949 869.0 0 gi|7020359|dbj|BAA91095.1| unnamed protein product ( 706) 3934 865.7 0 gi|194676899|ref|XP_001790307.1| PREDICTED: G2/M p ( 703) 3841 845.5 0 gi|194384550|dbj|BAG59435.1| unnamed protein produ ( 660) 3645 802.8 0 gi|126282080|ref|XP_001368632.1| PREDICTED: hypoth ( 704) 3242 715.2 2.1e-203 gi|26351027|dbj|BAC39150.1| unnamed protein produc ( 356) 2548 563.9 3.7e-158 gi|148704838|gb|EDL36785.1| RIKEN cDNA 6030408C04, ( 754) 2516 557.2 7.8e-156 gi|148704839|gb|EDL36786.1| RIKEN cDNA 6030408C04, ( 637) 2515 557.0 8.1e-156 gi|67967882|dbj|BAE00423.1| unnamed protein produc ( 375) 2240 496.9 5.6e-138 gi|71679838|gb|AAI00037.1| Si:busm1-234g15.1 prote ( 706) 1897 422.6 2.6e-115 gi|83759123|gb|AAI10161.1| G2E3 protein [Bos tauru ( 296) 1863 414.8 2.3e-113 gi|224051384|ref|XP_002199684.1| PREDICTED: G2/M-p (1516) 1685 376.7 3.4e-101 gi|82075465|sp|Q5F4A1.1|G2E3_CHICK RecName: Full=G ( 742) 1681 375.6 3.7e-101 gi|10434508|dbj|BAB14280.1| unnamed protein produc ( 290) 1495 334.7 2.9e-89 gi|47214823|emb|CAF89650.1| unnamed protein produc ( 716) 1269 285.9 3.5e-74 gi|194380636|dbj|BAG58471.1| unnamed protein produ ( 259) 1112 251.4 3.2e-64 gi|74218399|dbj|BAE23799.1| unnamed protein produc ( 170) 1052 238.1 2e-60 gi|210089411|gb|EEA37718.1| hypothetical protein B ( 284) 1032 234.0 5.9e-59 gi|156210607|gb|EDO31769.1| predicted protein [Nem ( 276) 977 222.0 2.3e-55 gi|73985312|ref|XP_533800.2| PREDICTED: similar to ( 383) 935 213.0 1.7e-52 gi|149445026|ref|XP_001518535.1| PREDICTED: hypoth ( 274) 930 211.8 2.8e-52 gi|118100133|ref|XP_425396.2| PREDICTED: similar t ( 386) 925 210.9 7.5e-52 gi|198419984|ref|XP_002126862.1| PREDICTED: simila ( 510) 921 210.1 1.7e-51 gi|67969280|dbj|BAE00993.1| unnamed protein produc ( 381) 919 209.5 1.8e-51 gi|126336640|ref|XP_001380336.1| PREDICTED: simila ( 274) 917 209.0 2e-51 gi|62900704|sp|Q9BWX1.1|PHF7_HUMAN RecName: Full=P ( 381) 909 207.4 8.3e-51 gi|62898794|dbj|BAD97251.1| PHD finger protein 7 i ( 381) 909 207.4 8.3e-51 gi|194221237|ref|XP_001915371.1| PREDICTED: PHD fi ( 383) 908 207.2 9.7e-51 gi|114587279|ref|XP_001172012.1| PREDICTED: PHD fi ( 381) 904 206.3 1.8e-50 gi|158257874|dbj|BAF84910.1| unnamed protein produ ( 381) 900 205.4 3.2e-50 gi|62900705|sp|Q9DAG9.1|PHF7_MOUSE RecName: Full=P ( 307) 893 203.8 8e-50 gi|149034186|gb|EDL88956.1| rCG42401, isoform CRA_ ( 334) 889 203.0 1.5e-49 gi|62900629|sp|Q6AXW4.1|PHF7_RAT RecName: Full=PHD ( 380) 889 203.0 1.7e-49 gi|193678760|ref|XP_001945076.1| PREDICTED: simila ( 431) 883 201.8 4.6e-49 gi|210095085|gb|EEA43256.1| hypothetical protein B ( 278) 868 198.3 3.2e-48 gi|108872589|gb|EAT36814.1| phd finger protein [Ae ( 771) 845 193.7 2.1e-46 gi|108872588|gb|EAT36813.1| phd finger protein [Ae ( 781) 845 193.7 2.2e-46 gi|110770160|ref|XP_623772.2| PREDICTED: similar t ( 395) 841 192.6 2.4e-46 gi|212511808|gb|EEB14690.1| PHD finger protein, pu ( 359) 833 190.8 7.6e-46 gi|221124151|ref|XP_002166667.1| PREDICTED: simila ( 607) 819 188.0 9.1e-45 gi|157017860|gb|EAA07617.3| AGAP002930-PA [Anophel ( 285) 815 186.8 9.7e-45 gi|114587291|ref|XP_001172095.1| PREDICTED: PHD fi ( 324) 811 186.0 1.9e-44 gi|118085153|ref|XP_001235247.1| PREDICTED: hypoth ( 653) 737 170.2 2.3e-39 gi|167875381|gb|EDS38764.1| phd finger protein [Cu ( 533) 735 169.6 2.6e-39 gi|221124153|ref|XP_002166715.1| PREDICTED: simila ( 281) 714 164.8 3.9e-38 >>gi|81889411|sp|Q5RJY2.1|G2E3_MOUSE RecName: Full=G2/M (716 aa) initn: 4883 init1: 4883 opt: 4883 Z-score: 5737.2 bits: 1072.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 4883; 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