FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0667.ptfa, 1243 aa vs ./tmplib.26680 library 1767774 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5902+/-0.00477; mu= 20.7068+/- 0.319 mean_var=104.0627+/-23.817, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1257 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0829 ( 1332 res) mpm05057 (1332) 5115 940 0 >>mKIAA0829 ( 1332 res) mpm05057 (1332 aa) initn: 5188 init1: 1926 opt: 5115 Z-score: 5011.5 bits: 939.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 5115; 60.032% identity (61.003% ungapped) in 1256 aa overlap (1-1243:84-1332) 10 mKIAA0 PQPRG-----------AASMSTGAFYISSL :.::: :..:......::.: mKIAA0 RGLDVASERLPQSASRCDPGSGRRRQGEEEPRPRGPAATEPAGGIEAGNMASASYHISNL 60 70 80 90 100 110 20 30 40 50 60 70 mKIAA0 LEKMTSSDKDFRFMATSDLMSELQKDSIQLDEDSERKVVRTLLRLLEDRSGEVQNLAVKC ::::::::::::::::.:::.:::::::.::.:::::::. .::::::..:::::::::: mKIAA0 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