FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0728.ptfa, 1589 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767428 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7266+/-0.00705; mu= -0.1201+/- 0.463
 mean_var=291.7893+/-71.125, 0's: 0 Z-trim: 19  B-trim: 142 in 1/35
 Lambda= 0.0751

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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        .:    .::.:. ..:::.:  :: ..:  :. :   :. .. . .::: :. : :: :
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          . .:. .: :..:  : .  . . .  . ...  . .  .::.  :   ..:.. . 
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       : ..   :.. .  : : .   .:.... ..   ::  : .::.::....:..: .:. .
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       . ::.. :.. : .... . :  ... . . : .:.  ..:.. . .: .  .. :  ..
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            .... . :   .:. . :...:..  :..:.  ...: . :  :  .  :.:.  
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        : :    ...:    :..:.  : :. ..  :    :  :     .........: .  
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         .:. ..: :: :.: :.      ::   .. :.::.  :. ::     ...  :.  :
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       . :.. . .. .   . . .::.. :..:  : :.: .. : .. .:... ....  .. 
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       . :... ...     . .   :. .  :.:...:  ..   :.: :  . . .  .: : 
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        . :..  . . :. :    . : : .. ..    . ::.::     .:. ::....   
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       :: . :.:   .:.... .... .: ..  ::.    :... . :. ::..  . ::: .
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       .     : :  ..:..  .  . :.    . . :   .  .. ::.:.  .:.  .:.  
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        .: : .. :.:.      .  ::  ::..    .:  :  . . .  . .. ... . .
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       .     . : . . : .:  .   ::  .  .: ..  .:: .:.::  .  ::. .:  
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       : :.  :  :.:    .. . : . : ..: .:    :  .::    .....   .  ::
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       .  . ..  :::   . :: ..   . .  : :.:     ..: . ..: : :::     
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       :    :..  :... ...:  ::.: :. .. ..  ::.:  .:: . ::  : :.   :
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       .:   .:.  :: : .:.    :.. . :. .:  :   .. :...   ..  . . .:.
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            :. :..::::: .:. ..  . .    :..   .  . .:::  :.     :. :
mKIAA4 -----TLSKEFEALMAEKDALSEETRNLKLQVEAQ---VLKQASLEATEKS-----DEPK
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          :.:  :.    . .  : . :. :. .:    ..:     .::.... :. . .:  
mKIAA4 DVIEEVTQAVVGKSQERDALSD-SAKLEDSEAILMGDGAKPGVSETFSSHDDIKNYLQQL
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          :.:: : .  ...        :  : :.. .:. .  ..:     .. .. . :.. 
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       :.. :::    : :.... :        :. :.  ::: .:.  ::.. .  .   ::  
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        . ..:. :.: ::  .. .. : . ... . :.  :..:. :. ...: ..:     . 
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       .:: ..... .:.   ::   :   :. . :..  :..   ....:. . : .   :   
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mKIAA4 HKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMAATPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSK--PSRT
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