# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpm08199.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0728.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0728, 1589 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7909297 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2982+/-0.0002; mu= 10.5779+/- 0.011 mean_var=122.1030+/-23.989, 0's: 40 Z-trim: 93 B-trim: 580 in 2/63 Lambda= 0.116068 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|194223631|ref|XP_001503309.2| PREDICTED: dyston (5501) 7776 1315.1 0 gi|55960336|emb|CAI16610.1| dystonin [Homo sapiens (5144) 7767 1313.6 0 gi|34577049|ref|NP_056363.2| dystonin isoform 1eA (5171) 7767 1313.6 0 gi|119624871|gb|EAX04466.1| dystonin, isoform CRA_ (5175) 7767 1313.6 0 gi|55960096|emb|CAI14342.1| dystonin [Homo sapiens (5457) 7767 1313.6 0 gi|34577047|ref|NP_899236.1| dystonin isoform 1 [H (5497) 7767 1313.6 0 gi|221316624|ref|NP_001138243.1| dystonin isoform (5526) 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