FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1633.ptfa, 1855 aa vs ./tmplib.26680 library 1767162 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9065+/-0.00732; mu= 6.4994+/- 0.484 mean_var=310.0419+/-75.591, 0's: 0 Z-trim: 19 B-trim: 23 in 1/35 Lambda= 0.0728 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 253 42 0.0012 mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729) 248 42 0.002 mKIAA3005 ( 1833 res) mbg08806 (1833) 240 41 0.0038 mKIAA1319 ( 1240 res) mic06048 (1240) 236 40 0.004 >>mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335 aa) initn: 210 init1: 84 opt: 253 Z-score: 157.7 bits: 42.0 E(): 0.0012 Smith-Waterman score: 355; 21.441% identity (24.393% ungapped) in 1124 aa overlap (81-1162:226-1255) 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 CSGLHPVLPSDLDVISDTSGLGNGVLPSMSEEKVSPTRARNMKDFENQITELKKENFNLK : ... .: ... ::..::.. . .: mFLJ00 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..:. :.. . . . . :.. : : : ..:.:::.. : :::.: mFLJ00 TKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQME-DEKNSFREQLEEEEEAKRNLEKQ 680 690 700 710 720 730 640 650 660 670 680 mKIAA1 --ALQEQLSEIRSREEEPFSFYS---DQTSYLSICLEEHNQFQLEHFSQ-EELKKKVSDL .:. :....... :. . . :. :: .: :. . ..:.: . : mFLJ00 IATLHAQVTDMKKKMEDGVGCLETAEEAKRRLQKDLEGLSQRLEEKVAAYDKLEKTKTRL 740 750 760 770 780 790 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 IQLVKDLHTDNQHLKKTIFDLSSVGFQGSDRLELTKQEELVASKEDEDTLKFEADVETPF : . :: .: .: .... .: . . . .: .:. ...: :. . ::... mFLJ00 QQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEK---KQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKE 800 810 820 830 840 850 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 QSDQHLEQS-REIMEDYAE-GGCKSGYGRHMDSNILGHDGAQTPGASEEHTLEDELLGLL . : .. .: ::. :: .. . .:.. . ..: . : : : :: .: mFLJ00 TKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDV---GKSV-HELEKSKRALE 860 870 880 890 900 810 820 830 840 850 mKIAA1 ATLFSKKATPLLESRPDLLKALGALLLERICLAE---------QGRPGDHLDSKTE--KA . : : : : . .: . : : .. : ::: . ..: . . mFLJ00 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