FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0677.ptfa, 1080 aa vs ./tmplib.26680 library 1767937 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7397+/-0.00521; mu= 14.2461+/- 0.347 mean_var=138.9799+/-33.651, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 142 in 1/35 Lambda= 0.1088 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0876 ( 1027 res) mpg00855 (1027) 3200 515 2.8e-146 mKIAA0780 ( 1129 res) mic14040 (1129) 2034 332 3.7e-91 mKIAA0234 ( 1390 res) mpm08099 (1390) 454 84 1.9e-16 mKIAA4034 ( 1554 res) mbg21043 (1554) 448 83 3.8e-16 mKIAA0239 ( 842 res) mpf00448 ( 842) 370 70 1.3e-12 mKIAA0215 ( 822 res) mpm10302 ( 822) 362 69 3e-12 mKIAA1807 ( 850 res) mpm10336 ( 850) 344 66 2.2e-11 mKIAA4191 ( 931 res) msh25333 ( 931) 336 65 5.5e-11 mKIAA4140 ( 998 res) mfj05126 ( 998) 271 55 6.7e-08 >>mKIAA0876 ( 1027 res) mpg00855 (1027 aa) initn: 3227 init1: 1997 opt: 3200 Z-score: 2718.6 bits: 514.7 E(): 2.8e-146 Smith-Waterman score: 3232; 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