FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0425.ptfa, 1578 aa vs ./tmplib.26680 library 1767439 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3815+/-0.00558; mu= 6.9266+/- 0.371 mean_var=162.9093+/-40.932, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 91 in 1/35 Lambda= 0.1005 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0385 ( 1377 res) mbg07892 (1377) 651 108 2e-23 >>mKIAA0385 ( 1377 res) mbg07892 (1377 aa) initn: 2419 init1: 499 opt: 651 Z-score: 512.8 bits: 107.5 E(): 2e-23 Smith-Waterman score: 2850; 39.396% identity (46.309% ungapped) in 1226 aa overlap (367-1573:316-1377) 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 LAPQLTTGFQPSLASPGMNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTAYQRKGSTQLFCST ..::. :. :::::::::::: :::::. mKIAA0 DFVPFRPRRSPRMSLRSSMAQRAGRSSMGTKMSCAHCRTPLQKGQTAYQRKGLPQLFCSS 290 300 310 320 330 340 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 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