FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1247.ptfa, 948 aa vs ./tmplib.26680 library 1768069 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6707+/-0.00501; mu= 21.5494+/- 0.335 mean_var=133.9803+/-30.406, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1108 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1077 ( 1163 res) mpm06017 (1163) 2739 450 8e-127 mKIAA1001 ( 512 res) mbj00867 ( 512) 176 40 0.0011 mKIAA4172 ( 515 res) mbj00115 ( 515) 166 38 0.0034 >>mKIAA1077 ( 1163 res) mpm06017 (1163 aa) initn: 3913 init1: 2635 opt: 2739 Z-score: 2369.2 bits: 450.0 E(): 8e-127 Smith-Waterman score: 3950; 63.431% identity (66.274% ungapped) in 886 aa overlap (81-948:36-901) 60 70 80 90 100 mKIAA1 IPSSRHHLGLCIQEEAKDQQATPMAPPGLPLWLLSTALL--SLLAGSSAFLSHPRLKGRF :: : :.: .::.. . . :..::. mKIAA1 PGYLIQAPRTQPTKELGRLCNFGPSTMKYSLWALLLAVLGTQLLGSLCSTVRSQRFRGRI 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 QRDRRNIRPNIILVLTDDQDVELGSMQVMNKTRRIMEQGGAHFINAFVTTPMCCPSRSSI :..:.::::::::::::::::::::.:::::::.::::::: : :::::::::::::::. mKIAA1 QQERKNIRPNIILVLTDDQDVELGSLQVMNKTRKIMEQGGATFTNAFVTTPMCCPSRSSM 70 80 90 100 110 120 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 LTGKYVHNHNTYTNNENCSSPSWQAQHESRTFAVYLNSTGYRTAFFGKYLNEYNGSYVPP ::::::::::.::::::::::::::.:: ::::::::.:::::::::::::::::::.:: mKIAA1 LTGKYVHNHNVYTNNENCSSPSWQAMHEPRTFAVYLNNTGYRTAFFGKYLNEYNGSYIPP 130 140 150 160 170 180 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 GWKEWVGLLKNSRFYNYTLCRNGVKEKHGSDYSTDYLTDLITNDSVSFFRTSKKMYPHRP ::.::.::.:::::::::.::::.::::: ::. ::.::::::.:...:. ::.:::::: mKIAA1 GWREWLGLIKNSRFYNYTVCRNGIKEKHGFDYAKDYFTDLITNESINYFKMSKRMYPHRP 190 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 VLMVISHAAPHGPEDSAPQYSRLFPNASQHITPSYNYAPNPDKHWIMRYTGPMKPIHMEF ..:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::::::: ::::::.::::: :::::: mKIAA1 IMMVISHAAPHGPEDSAPQFSKLYPNASQHITPSYNYAPNMDKHWIMQYTGPMLPIHMEF 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 TNMLQRKRLQTLMSVDDSMETIYDMLVETGELDNTYILYTADHGYHIGQFGLVKGKSMPY ::.:::::::::::::::.: .:.::::.::::::::.:::::::::::::::::::::: mKIAA1 TNVLQRKRLQTLMSVDDSVERLYNMLVESGELDNTYIIYTADHGYHIGQFGLVKGKSMPY 310 320 330 340 350 360 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 EFDIRVPFYVRGPNVEAGSLNPHIVLNIDLAPTILDIAGLDIPADMDGKSILKLLDSERP .:::::::..:::..: ::. :.:::::::::::::::::: :.:.::::.::::: :.: mKIAA1 DFDIRVPFFIRGPSIEPGSIVPQIVLNIDLAPTILDIAGLDSPSDVDGKSVLKLLDLEKP 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 VNRFHLKKKLRVWRDSFLVERGKLLHKREGDKVNAQEENFLPKYQRVKDLCQRAEYQTAC :::. .:: ..:::.:::::::.:.:.: . : :. : ::::.:::.:::.:.::::: mKIAA1 GNRFRTNKKAKIWRDTFLVERGKFLRKKEESGKNIQQSNHLPKYERVKELCQQARYQTAC 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 mKIAA1 EQLGQKWQCVEDASGTLKLHKCKGPMRFGGGGGGRALSNLVPKYDGQSSEACSCDSGGGG :: ::.:::.::.:: :..:::::: . . :: . .... : : ..: mKIAA1 EQPGQNWQCIEDTSGKLRIHKCKGPSDLLTVR--QNARNLYSRGLHDKDKECHCRDSGYR 490 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 640 mKIAA1 DYKLGLAGRRKLFKK----KYKTSYARNRSIRSVAIEVDGEIYHVGLDT----VPQPRNL . . ..:..... ::: ....:. ::...: .:::: ..:. : ::.. mKIAA1 SSRSQRKNQRQFLRNKGTPKYKPRFVHTRQTRSLSVEFEGEIYDINLEEEELQVLPPRSI 550 560 570 580 590 600 650 660 670 680 690 mKIAA1 SKPHWPGAPEDQDDKDGGSFSGTGGLPDYSA----PNPIKVTHRCYILENDTVQCDLDLY .: : : . ... . : : . : ..:::.:.:: :::..:. .:: mKIAA1 AKRHDEGHQGFIGHQAAAGDIRNEMLADSNNAVGLPATVRVTHKCFILPNDTIHCERELY 610 620 630 640 650 660 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 KSLQAWKDHKLHIDHEIETLQNKIKNLREVRGHLKKKRPEECDCHKISYHSQHKG--RLK .: .:::::: .::.:::.::.::::::::::::::..:::: : ::....:: : . mKIAA1 QSARAWKDHKAYIDKEIEVLQDKIKNLREVRGHLKKRKPEECGCGDQSYYNKEKGVKRQE 670 680 690 700 710 720 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 HKGSSLHPFRKGL-QEKD-KVWLLREQKRKKKLRKLLKRLQNNDTCSMPGLTCFTHDNHH . : ::::... :: : :. :..:..:.:: :: :: .... ::.::::::::::.: mKIAA1 KLKSHLHPFKEAAAQEVDSKLQLFKEHRRRKKERKEKKRQRKGEECSLPGLTCFTHDNNH 730 740 750 760 770 780 820 830 840 850 860 870 mKIAA1 WQTAPLWTLGPFCACTSANNNTYWCLRTINETHNFLFCEFATGFIEYFDLSTDPYQLMNA :::::.:.:: ::::::.::::::::::.:::::::::::::::.::::..:::::: :. mKIAA1 WQTAPFWNLGSFCACTSSNNNTYWCLRTVNETHNFLFCEFATGFLEYFDMNTDPYQLTNT 790 800 810 820 830 840 880 890 900 910 920 930 mKIAA1 VNTLDRDVLNQLHVQLMELRSCKGYKQCNPRTRNMDLGLRDGGSYEQYRQFQRRKWPEMK :.:..:..:::::.::::::::.:::::::: ...:.: ..::.:. .: mKIAA1 VHTVERSILNQLHIQLMELRSCQGYKQCNPRPKSLDIGAKEGGNYDPHR----------- 850 860 870 880 890 940 mKIAA1 RPSSKSLGQLWEGWEG ::::.:::: mKIAA1 -------GQLWDGWEGSQSNITSDTSWQGLEELSGASNIDEYRSNPRLSLEDWTNYLRAV 900 910 920 930 940 >>mKIAA1001 ( 512 res) mbj00867 (512 aa) initn: 197 init1: 59 opt: 176 Z-score: 158.3 bits: 39.8 E(): 0.0011 Smith-Waterman score: 243; 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