FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA0742.ptfa, 1334 aa
vs ./tmplib.26680 library
1767683 residues in 2168 sequences
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Lambda= 0.1050
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The best scores are: opt bits E(2168)
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30 40 50 60 70 80
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... :. :.. . :.:.: .:: : ::.: .:: : ::::. . :.:: :::
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110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
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... :..: :.. :.: :.. ::.. : .. .. . .::: . .
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200 210 220 230 240 250
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220 230 240 250 260 270
260 270 280 290
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.. :. . ....:.... .. :..:: .. . ::
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280 290 300 310 320 330
300 310 320 330
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: :: :. : :.::.: . . .: ::.: :.
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340 350 360 370 380 390
340 350 360
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:.: :.: :.. .:.. . ::. . . :..
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: .: . ... .:: ::..... . : :.. :..... :: .
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: : : . . : . . : :.. .. .:. .:: .:..: : ..
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580 590 600 610 620 630
520
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:... :.: .:
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700 710 720 730 740 750
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::::.::::.. :.. .. . ..:::..:.:.: :::::::::::::: :::..::
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1400 1410 1420 1430 1440
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1950 1960 1970 1980 1990 2000
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.:.: ::: :. ...:. .. : .. : :: :.::...: :.: .:
mKIAA1 VVENKIPPNKTSKINIKSEPNEEPKESSLPATDESNKSYRDIPHSWICDQHILWLKDYKN
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mKIAA0 KSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNTELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGAT
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mKIAA1 CVQVTEDFVSPEHLVQSFHLTQELRLLKE-EINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKMHED
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Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]