FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0742.ptfa, 1334 aa vs ./tmplib.26680 library 1767683 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1200+/-0.00511; mu= 6.8087+/- 0.338 mean_var=149.1335+/-35.569, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 137 in 1/35 Lambda= 0.1050 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1082 ( 1150 res) mpm09312 (1150) 1257 203 2.2e-52 mKIAA1380 ( 2428 res) meg02309 (2428) 1065 174 2.2e-43 >>mKIAA1082 ( 1150 res) mpm09312 (1150 aa) initn: 1330 init1: 699 opt: 1257 Z-score: 1032.6 bits: 203.2 E(): 2.2e-52 Smith-Waterman score: 1502; 31.214% identity (39.178% ungapped) in 1038 aa overlap (54-887:74-1104) 30 40 50 60 70 80 mKIAA0 VGKRFLSLSAAEGNEGGQDNWDLERVAEWPWLSGTIRAVSHTDVTKKDLKVCVEFDGESW : .::.::.: .. .:: . ::::: .: mKIAA1 ADPTASASASAPTAAAVVSGDPGPALRTRAWRAGTVRAMS--GAVPQDLAIFVEFDGCNW 50 60 70 80 90 100 90 100 110 120 130 mKIAA0 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