# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpm06332.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1614.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1614, 909 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7912842 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9648+/-0.000198; mu= 10.8971+/- 0.011 mean_var=107.6374+/-20.893, 0's: 26 Z-trim: 45 B-trim: 638 in 2/64 Lambda= 0.123621 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|21707619|gb|AAH34090.1| BC034090 protein [Mus m ( 858) 5866 1057.5 0 gi|148707459|gb|EDL39406.1| mCG8216 [Mus musculus] ( 938) 4311 780.2 0 gi|119611495|gb|EAW91089.1| hCG24169, isoform CRA_ (1221) 3107 565.5 5e-158 gi|109019271|ref|XP_001111115.1| PREDICTED: hypoth (1182) 2777 506.7 2.6e-140 gi|193786887|dbj|BAG52210.1| unnamed protein produ ( 811) 2658 485.3 4.7e-134 gi|149058354|gb|EDM09511.1| rCG46474 [Rattus norve ( 930) 2599 474.8 7.7e-131 gi|194210373|ref|XP_001488925.2| PREDICTED: simila (1309) 1979 364.4 1.9e-97 gi|73961009|ref|XP_853011.1| PREDICTED: hypothetic ( 838) 1398 260.6 2.2e-66 gi|126306485|ref|XP_001374665.1| PREDICTED: simila (1226) 946 180.1 5.3e-42 gi|149630742|ref|XP_001521648.1| PREDICTED: simila ( 428) 842 161.2 9.3e-37 gi|224058925|ref|XP_002190988.1| PREDICTED: simila ( 976) 767 148.1 1.8e-32 gi|118094169|ref|XP_422257.2| PREDICTED: similar t ( 753) 718 139.3 6.4e-30 gi|94732147|emb|CAK05135.1| novel protein [Danio r ( 747) 513 102.7 6.5e-19 gi|189535113|ref|XP_695219.3| PREDICTED: hypotheti (1044) 513 102.8 8.3e-19 gi|94733176|emb|CAK04100.1| novel protein [Danio r ( 117) 436 88.3 2.2e-15 gi|210126510|gb|EEA74197.1| hypothetical protein B ( 917) 329 70.0 5.7e-09 gi|210085182|gb|EEA33663.1| hypothetical protein B (1118) 329 70.1 6.6e-09 gi|220678163|emb|CAX14822.1| novel protein [Danio ( 101) 266 57.9 2.7e-06 gi|198423951|ref|XP_002123645.1| PREDICTED: simila ( 840) 237 53.5 0.00046 gi|119628202|gb|EAX07797.1| AT rich interactive do (1374) 234 53.2 0.00096 gi|119628199|gb|EAX07794.1| AT rich interactive do (1710) 234 53.3 0.0011 gi|73950153|ref|XP_865927.1| PREDICTED: similar to (1374) 232 52.8 0.0012 gi|68533099|dbj|BAE06104.1| ARID1A variant protein (1374) 232 52.8 0.0012 gi|73950155|ref|XP_865949.1| PREDICTED: similar to (2138) 232 53.0 0.0017 gi|125535176|gb|EAY81724.1| hypothetical protein O ( 854) 217 50.0 0.0056 gi|156222537|gb|EDO43380.1| predicted protein [Nem ( 614) 215 49.5 0.0056 gi|123229220|emb|CAM25148.1| AT rich interactive d (1174) 218 50.3 0.0062 gi|215507400|gb|EEC16892.1| hypothetical protein I ( 273) 209 48.1 0.0064 gi|198151215|gb|EDY74106.1| GA28568 [Drosophila ps (1997) 218 50.5 0.0092 >>gi|21707619|gb|AAH34090.1| BC034090 protein [Mus muscu (858 aa) initn: 5866 init1: 5866 opt: 5866 Z-score: 5654.7 bits: 1057.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 5866; 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