FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA4046.ptfa, 1319 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767698 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2737+/-0.00853; mu= -0.1271+/- 0.566
 mean_var=453.2697+/-108.117, 0's: 0 Z-trim: 42  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.0602

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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       .::::  :               :. ..:. :: ::::::::: ::: .:.:::::::::
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       ::::.:::.:.:::::.:.:::::.:  :.:::::::::::.  ::  ..  ... . ::
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       .:...:..::::::::::.::::..:::::::::::::::::         . .: .  .
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       :. .  . :.:. .. :  . : ...               :. .:              
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          .:                              ::::::::::::::::::::::::.
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        :.:.:.:: .  :.:.: : : :... : .:: . .:::.: ::::::.::::::::::
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      450                                          460       470   
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       ..:.::  :. ::..  :.:. ::.:   .   :.    :.:.: .   .:: . : :..
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       . .. ..  . .:: .   . ::.::. : ..  : .:    .:..  ::: .   . . 
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       . : .: .:    : .:    . ::. :. . . ..       :: : . .:     :. 
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       .:     ...:  :.   .   .  ..: : .:.    ::  .    :.:  .. . ..:
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mKIAA4 QLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKV
       .   . .  .::  :  ... :.:..:   ......  ::  .   .:. . :  :.  .
mFLJ00 EEEERCQYLQAEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEE--DQIIM
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mKIAA4 ELLN-QLEEEKRKVED--LQFR---VEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDL---ALR
       :  : .: .::. .::   .:    .:::  .:.  .. .  : . : .::. :     .
mFLJ00 EDQNCKLAKEKKLLEDRVAEFTTNLMEEEEKSKSLAKLKNKHE-AMITDLEERLRREEKQ
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mKIAA4 AQEVAELRRRLESSKPPGDVDMSLSLLQ-EISALQEKLEAIHTDHQGEMTSLKEHFGARE
        ::. . ::.::...   :.. ... :: .:. :. .:   . . :. .. ..:. . ..
mFLJ00 RQELEKTRRKLEGDST--DLSDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELQAALARVEEEAAQKN
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mKIAA4 EAFQKEIKALHTATEKLSKENESLRSKLDHANKENSDV---IALWKSKLETAIASH--QQ
        :..: :. :.:   .:... :: :.. ..:.:.. :.   .   :..:: .. :   ::
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        ..   : .::. :    : :.  :  .::...:  ... .: : .. .. . ..:    
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       : : : : :......   ...   :.    : .. ...  . ....::: . :.....: 
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         ::..:...... .... ...:... . .: :    :. ..... :   :. . :   .
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       .  :  ....: :. .:        : ... . ::. . .. .  .. :.:.. . :...
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mKIAA4 NLELQLKENK-------RQLSSSSGNTDAQAEEDERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLK
       .:: .:.:..        .:.... . : : . :   ..:. .  ...  .:.:.:..::
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        :.. :          : :::...  .:. . :.. .:.:. .:                
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         :. ::.  . :  :  ::    .  :..::: .:        ::  .:  : :    .
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        :.:.:::.:.. . : .  .    :.:     . :. .:.:.           :.   :
mKIAA1 -EHEQLRSRLEQKSGELGKKV----SELTLKNQTLQKDVEKLH-----------ADNKLL
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mKIAA4 AEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKANSITKELQEKELVLTGLQDSLNQVNQVKETLEKELQT
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mKIAA1 -EAERLLAENDKLTK-NVSRLEAVFVAPEKHEKELM--GLKSNIAELKKQLSELNKKCGE
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mKIAA1 GQEKIRALMSENSSLKKTLSSQYVPAKTHEEVKASLNSTVEKTNRAL--LEAK-KRFDDT
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mKIAA4 QKSIGEVTLKAEQSQQQAARKHEEEKKELEEKLLELEKKMETSYNQCQDLKAKYEKASSE
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mKIAA1 QEANAAILADHRQGQEEIVSLHAEIKAQKKE-LDTIQECIKLKYAPLARLEECERKFKAT
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mKIAA4 TKTKHEEILQNLQKMLADTEDKLKAAQEANRDLMQDMEELKTQADKAKAAQTAEDAMQIM
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mKIAA1 EKGLKEQLSEQTHKCRQRDEEVKKGKQENER-LRADLAALQKELQDRNA--LAEEAREAE
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mKIAA4 EQMTKEKTETLASLEDTKQTNARLQNELDTLKENNLKTVEELNKSKELLSVENQKMEEFK
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       ...:.::..     .::                 ..:. :.:. ::.:......  ::::
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        .:  :    .  . : .:.: ... .: : ::. : .:  .::. :. :  :.:.  . 
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       ..: :  :  : .   ..:: :... . .:.: . . : :: :.. . ... ..:.  : 
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        :...:.... : : :: . . : . .:      .: .:.. :. . : .: . : .. .
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       :: . . ..   ::  ..::.::..          ..... .  . ::. . ::.: .: 
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mKIAA4 LKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLE---LEAKMDQL
       :.: . ..:.   . .  .::  : .... ..:..:   . ....  ::    :::. .:
mKIAA0 LHEMEARLEEEEDRGQQLQAERKKMAQQMLDLEEQLEEEEAARQKLQLEKVTAEAKIKKL
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       .  . . : .. .: .. .  ...: ::   . ::     .:     ...: : :::   
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       :      ::. .:.:.::..   .:   ... :: .:. :. .:   . . :. .. : :
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       ... ...:..: :. :.     :... .: :.  ..:.:.. :.   .   :..:: .. 
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         :..:.  : .: .:.  :    . ..  :  .:....:  . . .: :  . .. . :
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       .:   :  .:.. .   .  : .  :  .: ...  . .  :...:  .: ...:    .
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        .. ...::..   .::.   ::...     : :.. .:  .. .: .: .. .::.. .
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       :. ::.: :.. : :...:..  :   ..:   .. .  . ::  .:.::. :.:  ...
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         .....: :   :..   .. ::      : ... . ::. . ....  . .:.: . .
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        :...:.... : : ::.. ..: . .:      .: .:.. :. . : .: . : .. .
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         .  ...:. :  .::.: ... : .: ..  : . . .: :: . ::. :  :::   
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mKIAA4 -TKQTNARLQNELDTLK---ENNLKTVEELNKSKELLSVENQKMEEFKKEIETLKQ----
        :.... ::. ....::   : .:.. .: :. :.  ... : ..:.. :.:  ..    
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       ::: :..  . :.. ... :.   . :.:. .. .::. . . .. .: . . .:.  : 
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       : .:: .. .:: .:.:   : . .:.   ..  :::.  .: : : .    : :.  .:
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       .:.:..:. :..                                                
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       . :..:        .  :::  .: . :..  :. . : ::         :. .: :.  
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        . :: .  .. :        ..  :: .:  . : ::.. :. .. . .  .. ::  .
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       .. : :         ..:.  . :.:  .   ..  .  . .:. :  .  . :     :
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       ..:.  .. :.  ..:.....   .:. :  :. :: ..:      .. . .. ..: . 
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mKIAA4 FKEKDDREDQLVKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERSVEELQLKLTKA

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Smith-Waterman score: 369;  23.476% identity (25.882% ungapped) in 656 aa overlap (628-1259:205-823)

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        :. .  . .::.:.. ::   :   . ::   :  .  .:  ..:.. .:. .      
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