FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1338.ptfa, 1397 aa vs ./tmplib.26680 library 1767620 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1526+/-0.00593; mu= 7.0802+/- 0.395 mean_var=208.6342+/-51.281, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0888 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1369 ( 635 res) mid17020 ( 635) 351 59 4e-09 mKIAA1995 ( 1005 res) meh01075 (1005) 199 40 0.0039 mKIAA0213 ( 1502 res) mbg05341 (1502) 196 39 0.0066 mKIAA0175 ( 648 res) mpj02836 ( 648) 188 38 0.0078 mKIAA4088 ( 652 res) mph00951 ( 652) 187 38 0.0086 >>mKIAA1369 ( 635 res) mid17020 (635 aa) initn: 480 init1: 172 opt: 351 Z-score: 256.1 bits: 58.7 E(): 4e-09 Smith-Waterman score: 603; 32.584% identity (36.160% ungapped) in 445 aa overlap (328-749:173-596) 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 QSPEDSGGQDYIETVIPSNQLPSAAFFSETQKQFSRYFIEFEELQLLGKGAFGAVIKVQN . : :::. ::::: .::::..: : ::.: mKIAA1 LMRSAKERVRQDPCQDNSYMQKIRSREIAFEAQTSRYLNEFEELAILGKGGYGRVYKVRN 150 160 170 180 190 200 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 KLDGCCYAVKRIPINPASR-HFRRIKGEVTLLSRLHHENIVRYYNAWIER----HERPAV :::: ::.:.: :. :.. .. :: .:. :.: ::: :..::::. . . : mKIAA1 KLDGQHYAIKKILIKSATKTDCMKVLREVKVLAGLQHPNIVGYHTAWIEHVHVVQPQDRV 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 mKIAA1 PGTPPPDCTPQAQDSPATYGKTSGDTEELGSVEAAAPP----PILSSSVEWSTSAERSTS : : . . :.. : .. . . : : : :. : :. .. : . mKIAA1 PIQLPSLEVLSEQEGDRDQGGVKDNESSSSIVFAELTPEKEKPFGESEVKNENNNLVSYT 270 280 290 300 310 320 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 TRFPVTGQDSSSDEEDEDERDGVFSQSFLPASDSDSDIIFDNEDENSKSQNQDEDCNQKD . . :. ..: :. : ..::. . : :. . . ..: :.. ... ::. .. mKIAA1 ANL-VVRNSSESESSIELQEDGLTDLSVRPVVRHQLPLGHSSELEGNFTST-DES---SE 330 340 350 360 370 530 540 550 560 570 mKIAA1 GSHEVEPSVTAEAVHYLYIQMEYCEKSTL----------RDTIDQGL--FRDTSRLWRLF :. .. .. .. .:.:::. :: : :. .:.. . .: ..: mKIAA1 GNLNLLGQTEVRYHLMLHIQMQLCELSLWDWITERNKRSREYVDEAACPYVMASVATKIF 380 390 400 410 420 430 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 REILDGLAYIHEKGMIHRDLKPVNIFLDS-DDHVKIGDFGLATDHLAFTAEGKQDDQAGD .:...:. :::. :..:::::: :::: . :..::::::::: . .:. . . : mKIAA1 QELVEGVFYIHNMGIVHRDLKPRNIFLHGPDQQVKIGDFGLACADIIQNADWTNRNGKGT 440 450 460 470 480 490 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 RVIKSDPSCHLTGMVGTALYVSPE-VQGSTKSAYNQKVDLFSLGIIFFEMSYHPMVTASE :. : :. ::: ::.::: ..:: :. : :..:::.:..:. ..:. : : mKIAA1 RT-------H-TSRVGTCLYASPEQLEGSQ---YDAKSDMYSLGVILLEL-FQPFGTEME 500 510 520 530 540 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 RIFVLNQLRDPTSPKFPDDFDDGEHTKQKSVISWLLNHDPAKRPTAMELLKSELLPPPQM : ::. .: . ..:.... .. : :. : ... ..::.:..::.:::. mKIAA1 RATVLTGVR---TGRIPESLSKRCPVQAK-YIQLLTGRNVSQRPSALQLLQSELFQTTGN 550 560 570 580 590 600 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 EESELHEVLHHTLANIDGKAYRTMMSQIFCQHISPAIDYTYDSDILKGNFLIRTAKIQQL mKIAA1 VNLTLQMKIIEQEKEIEELKKQLSLLSQDRGLKR 610 620 630 >>mKIAA1995 ( 1005 res) meh01075 (1005 aa) initn: 264 init1: 138 opt: 199 Z-score: 148.6 bits: 39.5 E(): 0.0039 Smith-Waterman score: 266; 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