FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0617.ptfa, 792 aa vs ./tmplib.26680 library 1768225 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3277+/-0.00449; mu= 12.6607+/- 0.300 mean_var=96.9808+/-22.175, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1302 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0695 ( 738 res) mbg01635 ( 738) 682 139 1.6e-33 mKIAA4106 ( 748 res) mid05034 ( 748) 665 136 1.5e-32 mKIAA4122 ( 790 res) mbg19439a ( 790) 608 125 2.6e-29 mKIAA1406 ( 838 res) mph00927 ( 838) 141 38 0.0072 >>mKIAA0695 ( 738 res) mbg01635 (738 aa) initn: 1230 init1: 262 opt: 682 Z-score: 694.0 bits: 139.1 E(): 1.6e-33 Smith-Waterman score: 1506; 35.516% identity (39.718% ungapped) in 794 aa overlap (9-792:19-738) 10 20 30 40 mKIAA0 HRRLRVRAAAAAAVSAAAGEGPST--MSNLSKGT-GSRKDTKMRIRAFP- ...:.: : : . :. .:..... :: : :. :. : mKIAA0 ATSQQEQQQQLKTKSILISSVASVHHANGLAKSSTAVSSFANSKPGSAK--KLVIKNFKD 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 -MTMDEKYVNSIWDLLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVV . :.:.. :. ::.:.. :: ... ..::::. . .. :: . .:: ::.. mKIAA0 KPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSHKISANLYKQLRQIC 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 TEHL---INKVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNNV-E .:. :.. ::: :.:. ::. ... :..: :.:::.:....::.:: ::.. mKIAA0 EDHIKAQIHQFREDSLDSVL--FLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLP 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 NVYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEG .....:: .:: ... .. . . .: .: :::.::..::. .:. .:: : mKIAA0 SIWDMGLELFRAHIISDQKVQTKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSDL---- 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 mKIAA0 RSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTE ..:...:: ::. . ... :.::.. : . :...:. :..:: .:.. ::..:. mKIAA0 -QIYQDSFEQQFLQETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 EPIVKVVERELISKHMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLACMYKLFSRVPNGLKTMCECM . .. ::..:...:. .:.. .:: .: ... .::. .:.::::: .:.... . mKIAA0 KSLIASVEKQLLGEHLTAILQ---KGLNSLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 SCYLREQGKALVSEEGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLQESFNNDRLFKQTIAGDFEYF :.. :...: . . :. ..: :::.:.. :.... : ... : ... :: : mKIAA0 IEYIKAFGSTIVINPEKDKT---MVQELLDFKDKVDHIIDTCFLKNEKFINAMKEAFETF 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 LNLNSRSP-EYLSLFIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHL .: .: : .. ..:.::. : : :..:.: .::: :..:::. ::::: .::. : mKIAA0 INKRPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDL 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 ARRLLTNKSVSDDSEKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGV :.:::..::.: :.::.:.:::: ...: .: mKIAA0 AKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLK-----------------------------HYMQNQNV 470 480 490 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 SLGGVDLTVRVLTTGYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGS :...::: .:: ::::: . ..:: . :::. :::.:::::.: : .: mKIAA0 P-GNIELTVNILTMGYWPTYVPM-EVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGH 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 ADLNATFYGPVKKEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEI :.: : :: .: :::: :: .:..::. :....::: mKIAA0 CVLKAEF-----KEGKKE-----------------LQVSLFQTMVLLMFNEGEEFSLEEI 560 570 580 590 650 660 670 680 690 700 mKIAA0 QQETDIPERELVRALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIESGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQT .. : : . :: :.:::::::: :::.:.::.:.::.: : ::.: :: :.::. mKIAA0 KHATGIEDGELRRTLQSLACGKA--RVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQ 600 610 620 630 640 650 710 720 730 740 750 760 mKIAA0 VAAKQGESDPERKETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLP . : :. :. : ..: .::...:.:::::::: :: ..::.::.:: .::: : mKIAA0 IQMK--ETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLK--FPV 660 670 680 690 700 770 780 790 mKIAA0 SPVVIKKRIEGLIEREYLARTPEDRKVYTYVA .:. .:::::.::.:.:. : :. . .:.: mKIAA0 KPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQSNYIA 710 720 730 >>mKIAA4106 ( 748 res) mid05034 (748 aa) initn: 845 init1: 323 opt: 665 Z-score: 676.6 bits: 136.0 E(): 1.5e-32 Smith-Waterman score: 1059; 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