FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1286.ptfa, 649 aa vs ./tmplib.26680 library 1768368 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3928+/-0.00736; mu= -4.0924+/- 0.488 mean_var=303.5018+/-72.304, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0736 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4191 ( 931 res) msh25333 ( 931) 1339 156 1.6e-38 >>mKIAA4191 ( 931 res) msh25333 (931 aa) initn: 1863 init1: 1288 opt: 1339 Z-score: 784.1 bits: 155.9 E(): 1.6e-38 Smith-Waterman score: 1868; 48.692% identity (54.120% ungapped) in 688 aa overlap (2-649:213-871) 10 20 30 mKIAA1 TQFMQRLHNYWLLKRQARNGVPLIRRLHSHL ::..: :.:::::: .:::.::.:::.: : mKIAA4 CAVLPTVCAPYIPPQRLNRIANQVAIQRKKQFVERAHSYWLLKRLSRNGAPLLRRLQSSL 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 QSQRNAEQREQDEKTSAVKEELKYWQKLRHDLERARLLIELIRKREKLKREQVKVQQAAM :::::..:::.::. .:.::.:::::.::::::::::::::.:::::::::::::.: :: mKIAA4 QSQRNTQQRENDEEMKAAKEKLKYWQRLRHDLERARLLIELLRKREKLKREQVKVEQMAM 250 260 270 280 290 300 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 ELELMPFTVLLRTTLDLLQEKDSAHIFAEPVSLSEVPDYLEFISKPMDFSTMRRKLESHL ::.: :.:::::..:. ::::: :.:::.::::.::::::. :..::::.:::..::.. mKIAA4 ELRLTPLTVLLRSVLEQLQEKDPAKIFAQPVSLKEVPDYLDHIKHPMDFATMRKRLEAQG 310 320 330 340 350 360 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 YHTLEEFEEDFNLIVTNCMKYNAKDTIFHRAAVRLRDLGGAILRHARRQAENIGYDPERG :..:. ::::::::: ::::::::::.:.:::::::: ::..::.:::..:.:: . : mKIAA4 YKNLHAFEEDFNLIVDNCMKYNAKDTVFYRAAVRLRDQGGVVLRQARREVESIGLEEASG 370 380 390 400 410 420 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 THLPESPRLEDFYRFSWEDVDNILIPENRAHLSPEAQLKELLEKLDLVSTMRSSGARTRR :::: : ::::.:: .: : ::::.: : ::.:::.::::. .:.:::.:..: mKIAA4 MHLPERPIAAPRRPFSWEEVDRLLDPANRAHMSLEEQLRELLDKLDLTCSMKSSGSRSKR 430 440 450 460 470 480 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 VRMLRREINALRQKLAQPPPPQLLSLNKTVPNGELPAGSRGDTAVLEQAQQEEPEEEGDR ...:..:: ::.::.: ... :.: .: . ..: : . ::: mKIAA4 AKLLKKEIALLRNKLSQQH-------SQAPPTGAGTGGFEDEAAPLAP----DTAEEGAN 490 500 510 520 530 340 350 360 370 380 mKIAA1 DDSKLPAPPTLEPTGPAPSLSEQESPPDPPTLKPISDSKPSSRFLKSRKVEDEE--LLEK .:: :::. : :..:. .::::.:. .:...: ..: . mKIAA4 ------SPPKLEPSDALPLPSNSETNSEPPTLNPVELHPEQSKLFKRVTFDNESHSTCTQ 540 550 560 570 580 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 SALQLGSEPLQCLLSDNGIDRLSLTNPDSHPDTPLGTVGRRTSVLFKKAKNGVKLQRGPD ::: : : : :.. . . : : . :.::::::: :.:. .: mKIAA4 SALVSGHPPEPTLASSGDVP----AAAASAVAEPSSDVNRRTSVLFCKSKS-----VSPP 590 600 610 620 630 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 GTLENGEDH--GPEDDPASPAST-----EDEHYSRKRPRSRSCSDSE-GERSPQQEEETG . .: : . .:. . :. : ::: :: .:.::: :.:: .. .:: mKIAA4 KSAKNTETQPTSPQLGTKTFLSVVLPRLETLLQPRKRSRS-TCGDSEVEEESPGKRLDTG 640 650 660 670 680 690 510 520 530 540 mKIAA1 VTNGFG---KHTESGSD------------SECSLGLSGGLAFEAGSGLTPPKRSRGKPAL .::::: .. : :. :: :. :.. . :... :: .:::::: mKIAA4 LTNGFGGARSEQEPGGGPGRKAAPRRRCASESSICSSNSPLCD--SSFSTPKCGRGKPAL 700 710 720 730 740 750 550 560 570 580 590 mKIAA1 SRVPFLEGV--------NGDSDHSGS-----GRSLLMPFEDHGD--LEPLELVWAKCRGY : :: ::. ... :.: . : . ::::..::::: :: mKIAA4 VRRHTLEDRSELISCIENGNYAKAARIAAEVGQSNMWISTDAAASVLEPLKVVWAKCSGY 760 770 780 790 800 810 600 610 620 630 640 mKIAA1 PSYPALIIDPKMPREGLLHNGVPIPVPPLDVLKLGEQKQAEAGERLFLVLFFDNKRTW :::::::::::::: :::: ::.:::::::.::. :... :.:::::::::::.: mKIAA4 PSYPALIIDPKMPRVPGHHNGVTIPAPPLDVLKIGEHMQTKSEEKLFLVLFFDNKRSWQW 820 830 840 850 860 870 mKIAA4 LPKSKMVPLGVDETIDKLKMMEGRNSSIRKAVRIAFDRAMNHLSRVHGEPASDLSDID 880 890 900 910 920 930 649 residues in 1 query sequences 1768368 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:39:57 2006 done: Mon Mar 27 10:39:58 2006 Scan time: 0.840 Display time: 0.040 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]