FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1212.ptfa, 826 aa vs ./tmplib.26680 library 1768191 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8548+/-0.00857; mu= -8.6906+/- 0.566 mean_var=394.1868+/-96.321, 0's: 0 Z-trim: 25 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0646 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1509 ( 1178 res) mbg12984 (1178) 1578 162 3.4e-40 mKIAA0378 ( 632 res) mbg02680 ( 632) 267 40 0.0014 >>mKIAA1509 ( 1178 res) mbg12984 (1178 aa) initn: 1464 init1: 1345 opt: 1578 Z-score: 814.1 bits: 162.1 E(): 3.4e-40 Smith-Waterman score: 1605; 40.986% identity (45.207% ungapped) in 771 aa overlap (12-758:128-850) 10 20 30 40 mKIAA1 VNPLRNRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEEST ..: ::.:: .: .:::::. :::..::. mKIAA1 SELDKLSQELEKVGLSKDLLLQEDDGHGDGKGKTESALKTTLAMKEEKIVFLEAQVEEKE 100 110 120 130 140 150 50 60 70 80 90 mKIAA1 NYNQQLRHELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSI--P---VSGEDDK--WGRESQEATRE . ..::. ::. .::..: :.: :. .:... : :.....: : .::: : mKIAA1 SLSRQLQIELQMIKKEHEQLRQTQEGGDKAQNALKRPPGKVTSHQEKEAWEPSHKEATME 160 170 180 190 200 210 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 LLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTL ::.:::: ::.::.::.::::.: :: ::..::::: ....:::.::.:.. :::..::: mKIAA1 LLRVKDRAIELERSNAALQAERQLLKEQLQHLETQNVSFSSQILTLQKQSAFLQEHTTTL 220 230 240 250 260 270 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 QTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENESIMKEREDLKSLYDALIKDH :::.::::::::::.::...: : . : ::.. : :.:......:.: ..:.::..:: mKIAA1 QTQTAKLQVENSTLSSQNAALSAQYTVLQSQQAAKEAEHEGLQQQQEQLAAVYEALLQDH 280 290 300 310 320 330 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 EKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMIK ..: :.: :.::::.:: .:. ::. :.:::.:::.: .:...: ..:..::.:::... mKIAA1 KHLGTLYECQSSEYEALIRQHSCLKTLHRNLELEHKELGERHGDLQQRKAELEELEKVLS 340 350 360 370 380 390 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 TEQEKMLLESKNHEVVASEYKKLCGENDRLNYTYSQLLKETEILQMDHKNLKSVLNNSKL ::.: . :.:.. ...:: ..: :: ::... ..:: : : :. :.::. ::::.: mKIAA1 TEREALEREQKTNAIATSENQRLRGELDRISFLHQQLKGEYEELHAHTKELKTSLNNSQL 400 410 420 430 440 450 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 EQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRT : .: ...:..::::.:..::. ::..:.:::::.:::::::::.:::.::: : ::. mKIAA1 ELSRWQVRFDELKEQHQSMDISLTKMDNHCELLSRLKGNLEEENHHLLSQIQLLSQQNQM 460 470 480 490 500 510 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 LLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLK- :::::::::. .: ::.::::::: :::.:::::::::::::::::.: .....:: : mKIAA1 LLEQNMESKEQYHEEQKQYIDKLNALRRHKEKLEEKIMDQYKFYDPAP-KKKNHWIGAKA 520 530 540 550 560 570 460 470 480 490 500 mKIAA1 MRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPT-RSDSSEGFLQLPHQ------DSQDSSSVGSNSLED . :::: ::. .::: :: : .: . . :. : : .. :. : : .:. mKIAA1 LVKLIKPKKEGSRERLKSTTDSPPWQLEPSDPASPSPSQALRSQTENPDNPPSGPNCVEE 580 590 600 610 620 630 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 GQTLGTKKSSMVALKRLPFLRNRPKDKDKMKACYRRSMSMNDLVQSMVLAGGQWTGSTEN .: . .. :. ::::.. ::::: . : . . . :..: mKIAA1 RDTHNGPVGKAFQRKKSPFLRSKSKDKDK------SPLVHPALSKRLRF----WSSS--- 640 650 660 670 680 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 LEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAAFRSKQLVNNKDTTSFEDISPQGIS ..: .. : :: . :.: :. :. . :.: mKIAA1 -DIP-------------------SSPNESTPIPKHLGRTKG-CNSDDNLCEPSSEPDG-- 690 700 710 720 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 DDSSTGSRVYASRPASLDSGRTSTSNSNN---NASLHEVKEVMKSLSVSSDFLGKDKPVS : :::: ::.:.:...:::. ..: ... .:.: :.:.. . :. mKIAA1 ----PYHRQQASRPNSLESSRNASSNSSPLSLKGSSDHLHSRCESFS-SADLIPSRDPA- 730 740 750 760 770 690 700 710 720 730 mKIAA1 CTLARSVSGKTPG-DFYDRRTTKPEFLRTGP--QKT---EDAYTISSAGKPTPSTQGKIK ::.:. :.: : . :. : :.:: :.: . : . .. .: .. .. mKIAA1 -TLSRD--GNTSGRGLLGRHEYPPP--RNGPVSQETIQKKGAASTHTGVRPHSASPSSEM 780 790 800 810 820 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 LVKETSVSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLSKDSRLPVSVDSSPPTA .. : . .... ..: : mKIAA1 VTLEEFLEESNRGGSPTHDTPSCRDDLLSDYFRKAHDPPALGGQPGPPARKDGAKMPTSF 830 840 850 860 870 880 >>mKIAA0378 ( 632 res) mbg02680 (632 aa) initn: 263 init1: 91 opt: 267 Z-score: 156.8 bits: 39.6 E(): 0.0014 Smith-Waterman score: 298; 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