FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1366.ptfa, 884 aa vs ./tmplib.26680 library 1768133 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7047+/-0.00619; mu= -12.4398+/- 0.406 mean_var=331.0359+/-81.571, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0705 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1480 ( 876 res) mbg07853 ( 876) 2982 318 4.3e-87 mKIAA1070 ( 846 res) mbg05205 ( 846) 2150 233 1.2e-61 >>mKIAA1480 ( 876 res) mbg07853 (876 aa) initn: 3495 init1: 2559 opt: 2982 Z-score: 1655.9 bits: 317.5 E(): 4.3e-87 Smith-Waterman score: 3529; 64.388% identity (69.922% ungapped) in 834 aa overlap (90-884:70-876) 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 AGAQRGGGGPGGGAPGGPGLGLGSLGEERFPVVNTAYGRVRGVRRELNNEILGPVVQFLG :.::: .:..::.: : .:::::: :.:: mKIAA1 LSPTPTVGRSLCLTLGFLSLVLRASTQAPAPTVNTHFGKLRGARVPLPSEILGPVDQYLG 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 VPYATPPLGARRFQPPEAPASWPGVRNATTLPPACPQNLHGALPAIMLPVWFTDNLEAAA ::::.::.: .:: ::: : :: :.:::: .::.::::.: :.: .::::::: ::. .: mKIAA1 VPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNIHTAVPEVMLPVWFTANLDIVA 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 mKIAA1 TYVQNQSEDCLYLNLYVPTED--------------------GPLTKKRDEATLN---PPD ::.:. .:::::::.:::::: : .::. : . : mKIAA1 TYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDVKRISKECARKPNKKICRKGGSGAKKQGEDLADNDGDED 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 TDIRDSGKKPVMLFLHGGSYMEGTGNMFDGSVLAAYGNVIVATLNYRLGVLGFLSTGDQA :::::: ::::...::::::::::::.::::::.:::::: :::::.:::::::::::: mKIAA1 EDIRDSGAKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSVLASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGDQA 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 AKGNYGLLDQIQALRWLSENIAHFGGDPERITIFGSGAGASCVNLLILSHHSEGLFQKAI ::::::::::::::::.::::: :::::.:::.:::: :::::.:: ::::::::::.:: mKIAA1 AKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEGLFQRAI 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 AQSGTAISSWSVNYQPLKYTRLLAAKVGCDREDSTEAVECLRRKSSRELVDQDVQPARYH :::.:.:::.:::::.::: ::: ::::. :... :.:::.::..:::.::.:::::: mKIAA1 IQSGSALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYH 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 IAFGPVVDGDVVPDDPEILMQQGEFLNYDMLIGVNQGEGLKFVEDSAESEDGVSASAFDF .:::::.::::.::::::::.::::::::...:::::::::::: .. :::::.. ::. mKIAA1 VAFGPVIDGDVIPDDPEILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDY 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 TVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTDWADRDNGEMRRKTLLALFTDHQWVAPAVATA .::::::::::::::::.::::::::::::::::: : :::::.::::::::: :.:.:: mKIAA1 SVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTA 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 KLHADYQSPVYFYTFYHHCQAEGRPEWADAAHGDELPYVFGVPMVGATDLFPCNFSKNDV ::: : ::.:::.::::::. .: :.:::::::.:::::::::: ::::::::::::: mKIAA1 DLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDV 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 MLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVVWSKFNSKEKQYLHIGLKPR ::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::.:::.: ... ::::::::: mKIAA1 MLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPR 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 VRDNYRANKVAFWLELVPHLHNLHTELF---TTTTRLPPYATRWP---PRTPGPGTSGTR :::.:::.::::: .:::::.::: ..: .:::..:: : : :. : .:. mKIAA1 VRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLH-DMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTWSTK 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 RPP-PPA----TLPP--ESDIDLGPRAYDRFPGDSRDYSTELSVTVAVGASLLFLNILAF :: :: . : ..: : :: . . ::::::::::.::::::::::.::: mKIAA1 RPAISPAYSNENAPGSWNGDQDAGPLLVE----NPRDYSTELSVTIAVGASLLFLNVLAF 700 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 AALYYKRDRRQELRCRRLSPPGGSGSGVPGGGPLLPTAGRELPPEEELVSLQL--KRGGG :::::..:.:.. :. :: :.:. : : :: :::::..::: . mKIAA1 AALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGTGA------PELGTA-----PEEELAALQLGPTHHEC 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 mKIAA1 VGADPAEALRPACPPDYTLALRRAPDDVPLLAPGALTLLPSGLGPPPPPPPPSLHPFGPF .. : ..:: . :::::.:::.:::.::..:...:..:..: .:::.. : mKIAA1 EAGPPHDTLRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSL-----VGLQTLHPYNTF 810 820 830 840 850 870 880 mKIAA1 PPPPPTATSHNNT-LPHPHSTTRV :.. :.: ::: :::::: mKIAA1 ------AAGFNSTGLPHSHSTTRV 860 870 >>mKIAA1070 ( 846 res) mbg05205 (846 aa) initn: 3534 init1: 1905 opt: 2150 Z-score: 1198.9 bits: 232.9 E(): 1.2e-61 Smith-Waterman score: 3574; 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