FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1077.ptfa, 1163 aa vs ./tmplib.26680 library 1767854 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2373+/-0.00496; mu= 16.7935+/- 0.333 mean_var=115.4277+/-28.074, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 87 in 1/35 Lambda= 0.1194 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1247 ( 948 res) mpm06364 ( 948) 2739 484 6.5e-137 mKIAA4172 ( 515 res) mbj00115 ( 515) 182 43 0.00016 mKIAA1001 ( 512 res) mbj00867 ( 512) 169 41 0.00077 mFLJ00319 ( 537 res) mib36033 ( 537) 164 40 0.0014 >>mKIAA1247 ( 948 res) mpm06364 (948 aa) initn: 3913 init1: 2635 opt: 2739 Z-score: 2550.3 bits: 483.6 E(): 6.5e-137 Smith-Waterman score: 3950; 63.431% identity (66.274% ungapped) in 886 aa overlap (36-901:81-948) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 PGYLIQAPRTQPTKELGRLCNFGPSTMKYSLWALLLAVLGTQLLGSLCSTVRSQRFRGRI :: : :.:. ::.. . . :..::. mKIAA1 IPSSRHHLGLCIQEEAKDQQATPMAPPGLPLWLLSTALLS--LLAGSSAFLSHPRLKGRF 60 70 80 90 100 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 QQERKNIRPNIILVLTDDQDVELGSLQVMNKTRKIMEQGGATFTNAFVTTPMCCPSRSSM :..:.::::::::::::::::::::.:::::::.::::::: : :::::::::::::::. mKIAA1 QRDRRNIRPNIILVLTDDQDVELGSMQVMNKTRRIMEQGGAHFINAFVTTPMCCPSRSSI 110 120 130 140 150 160 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 LTGKYVHNHNVYTNNENCSSPSWQAMHEPRTFAVYLNNTGYRTAFFGKYLNEYNGSYIPP ::::::::::.::::::::::::::.:: ::::::::.:::::::::::::::::::.:: mKIAA1 LTGKYVHNHNTYTNNENCSSPSWQAQHESRTFAVYLNSTGYRTAFFGKYLNEYNGSYVPP 170 180 190 200 210 220 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 GWREWLGLIKNSRFYNYTVCRNGIKEKHGFDYAKDYFTDLITNESINYFKMSKRMYPHRP ::.::.::.:::::::::.::::.::::: ::. ::.::::::.:...:. ::.:::::: mKIAA1 GWKEWVGLLKNSRFYNYTLCRNGVKEKHGSDYSTDYLTDLITNDSVSFFRTSKKMYPHRP 230 240 250 260 270 280 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 IMMVISHAAPHGPEDSAPQFSKLYPNASQHITPSYNYAPNMDKHWIMQYTGPMLPIHMEF ..:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::::::: ::::::.::::: :::::: mKIAA1 VLMVISHAAPHGPEDSAPQYSRLFPNASQHITPSYNYAPNPDKHWIMRYTGPMKPIHMEF 290 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 TNVLQRKRLQTLMSVDDSVERLYNMLVESGELDNTYIIYTADHGYHIGQFGLVKGKSMPY ::.:::::::::::::::.: .:.::::.::::::::.:::::::::::::::::::::: mKIAA1 TNMLQRKRLQTLMSVDDSMETIYDMLVETGELDNTYILYTADHGYHIGQFGLVKGKSMPY 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 DFDIRVPFFIRGPSIEPGSIVPQIVLNIDLAPTILDIAGLDSPSDVDGKSVLKLLDLEKP .:::::::..:::..: ::. :.:::::::::::::::::: :.:.::::.::::: :.: mKIAA1 EFDIRVPFYVRGPNVEAGSLNPHIVLNIDLAPTILDIAGLDIPADMDGKSILKLLDSERP 410 420 430 440 450 460 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 GNRFRTNKKAKIWRDTFLVERGKFLRKKEESGKNIQQSNHLPKYERVKELCQQARYQTAC :::. .:: ..:::.:::::::.:.:.: . : :. : ::::.:::.:::.:.::::: mKIAA1 VNRFHLKKKLRVWRDSFLVERGKLLHKREGDKVNAQEENFLPKYQRVKDLCQRAEYQTAC 470 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 EQPGQNWQCIEDTSGKLRIHKCKGPSDLLTV--RQNARNLYSRGLHDKDKECHCRDSGYR :: ::.:::.::.:: :..:::::: . . :: . .... : : ..: mKIAA1 EQLGQKWQCVEDASGTLKLHKCKGPMRFGGGGGGRALSNLVPKYDGQSSEACSCDSGGGG 530 540 550 560 570 580 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 SSRSQRKNQRQFLRNKGTPKYKPRFVHTRQTRSLSVEFEGEIYDINLEEEELQVLPPRSI . . ..:.....: :: ....:. ::...: .:::: ..:. : ::.. mKIAA1 DYKLGLAGRRKLFKKK----YKTSYARNRSIRSVAIEVDGEIYHVGLDT----VPQPRNL 590 600 610 620 630 640 610 620 630 640 650 660 mKIAA1 AKRHDEGHQGFIGHQAAAGDIRNEMLADSNNAVGLPATVRVTHKCFILPNDTIHCERELY .: : : . ... . : : . : ..:::.:.:: :::..:. .:: mKIAA1 SKPHWPGAPEDQDDKDGGSFSGTGGLPDYSA----PNPIKVTHRCYILENDTVQCDLDLY 650 660 670 680 690 670 680 690 700 710 720 mKIAA1 QSARAWKDHKAYIDKEIEVLQDKIKNLREVRGHLKKRKPEECGCGDQSYYNKEKGVKRQE .: .:::::: .::.:::.::.::::::::::::::..:::: : ::....:: : . mKIAA1 KSLQAWKDHKLHIDHEIETLQNKIKNLREVRGHLKKKRPEECDCHKISYHSQHKG--RLK 700 710 720 730 740 750 730 740 750 760 770 780 mKIAA1 KLKSHLHPFKEAAAQEVDSKLQLFKEHRRRKKERKEKKRQRKGEECSLPGLTCFTHDNNH . : ::::... :: : :. :..:..:.:: :: :: .... ::.::::::::::.: mKIAA1 HKGSSLHPFRKGL-QEKD-KVWLLREQKRKKKLRKLLKRLQNNDTCSMPGLTCFTHDNHH 760 770 780 790 800 810 790 800 810 820 830 840 mKIAA1 WQTAPFWNLGSFCACTSSNNNTYWCLRTVNETHNFLFCEFATGFLEYFDMNTDPYQLTNT :::::.:.:: ::::::.::::::::::.:::::::::::::::.::::..:::::: :. mKIAA1 WQTAPLWTLGPFCACTSANNNTYWCLRTINETHNFLFCEFATGFIEYFDLSTDPYQLMNA 820 830 840 850 860 870 850 860 870 880 890 mKIAA1 VHTVERSILNQLHIQLMELRSCQGYKQCNPRPKSLDIGAKEGGNYDPHR----------- :.:..:..:::::.::::::::.:::::::: ...:.: ..::.:. .: mKIAA1 VNTLDRDVLNQLHVQLMELRSCKGYKQCNPRTRNMDLGLRDGGSYEQYRQFQRRKWPEMK 880 890 900 910 920 930 900 910 920 930 940 mKIAA1 -------GQLWDGWEGSQSNITSDTSWQGLEELSGASNIDEYRSNPRLSLEDWTNYLRAV ::::.:::: mKIAA1 RPSSKSLGQLWEGWEG 940 >>mKIAA4172 ( 515 res) mbj00115 (515 aa) initn: 167 init1: 99 opt: 182 Z-score: 173.3 bits: 42.8 E(): 0.00016 Smith-Waterman score: 308; 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