FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0158.ptfa, 367 aa vs ./tmplib.26680 library 1768650 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7227+/-0.00488; mu= 14.2385+/- 0.327 mean_var=114.1657+/-26.247, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1200 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4020 ( 391 res) mfj24359 ( 391) 1268 230 1.6e-61 mKIAA0991 ( 605 res) mph02064 ( 605) 987 182 9e-47 mKIAA0128 ( 449 res) mfj19346 ( 449) 835 155 6.3e-39 mKIAA0202 ( 470 res) mbh00446 ( 470) 811 151 1.2e-37 mKIAA4169 ( 281 res) mbg08918 ( 281) 740 139 4.4e-34 >>mKIAA4020 ( 391 res) mfj24359 (391 aa) initn: 1014 init1: 631 opt: 1268 Z-score: 1197.0 bits: 230.2 E(): 1.6e-61 Smith-Waterman score: 1268; 58.876% identity (61.231% ungapped) in 338 aa overlap (22-354:19-348) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 TGKSRKMSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLI ::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::: mKIAA4 AEERSVNCGTMAQPKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 mKIAA0 NSLFLTDLY-PERIIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRD ::::::::: :: :: ...:..:::.: : : :.: ::.: ::.:::::.:::.. . mKIAA4 NSLFLTDLYSPEY--PGPSHRIKKTVQVEQSKVLIKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 CFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHN :.. .:.::: .:: ::. :: .:::.. ::::.::.:::.: ::::::::. ::: .:. mKIAA4 CWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEFMKRLHE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 KVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHSIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKA ::::.:.:::::::: .: ...::.:. ::.::.::::..: :.:..:. : .. .: mKIAA4 KVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFP--ETDDEEENK-LVKKIKD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 SIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLI-THMQDLQEVTQ .:..::::: .::..::.:::: :::::.:::: :: :: ::.::: ::::::..::. mKIAA4 RLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 DLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQIL---LEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQG ..::::.::..: . ... :: :. : . : :: : .:.:. .:.:.:. mKIAA4 NVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERR--EHVAKMK-KMEMEMEQ 300 310 320 330 340 360 mKIAA0 GDSDSGALGQHV mKIAA4 VFEMKVKEKVQKLKDSEAEVISLISSLSVFLLNKFKLYLYIL 350 360 370 380 390 >>mKIAA0991 ( 605 res) mph02064 (605 aa) initn: 629 init1: 456 opt: 987 Z-score: 932.1 bits: 181.8 E(): 9e-47 Smith-Waterman score: 987; 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