FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00018.ptfa, 1372 aa vs ./tmplib.26680 library 1767645 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0191+/-0.00783; mu= -8.0655+/- 0.516 mean_var=407.9627+/-100.130, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0635 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1209 ( 1220 res) mbg08960 (1220) 901 98 1.5e-20 mKIAA0362 ( 806 res) mbe05003 ( 806) 433 55 9e-08 mFLJ00298 ( 577 res) mbg10993 ( 577) 388 50 1.2e-06 mKIAA0424 ( 520 res) mbg05532 ( 520) 367 48 4.4e-06 mKIAA1415 ( 1665 res) mib23074 (1665) 369 49 8.7e-06 mKIAA0142 ( 809 res) mbg20462 ( 809) 354 47 1.4e-05 mKIAA4037 ( 919 res) mfj00669 ( 919) 283 41 0.0014 mKIAA1626 ( 1241 res) mpg00117 (1241) 263 39 0.006 mKIAA0294 ( 1324 res) mbg02039 (1324) 260 39 0.0075 >>mKIAA1209 ( 1220 res) mbg08960 (1220 aa) initn: 857 init1: 322 opt: 901 Z-score: 461.3 bits: 97.6 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::.: mKIAA1 PD---HTAVQSALQAMKTVCSNINETKRQMEKLEALEQLQSHIEGWEGSNLTDICTELLL 230 240 250 260 270 280 350 360 370 380 mFLJ00 EGTFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRR-----------------GPEYTYKGH .:.. ..:. . :: .:::. .:. ::. : : ..:. mKIAA1 QGNLLKISAGNIQ----ERAFFLFDNLLVYCKRKSRVTGSKKSTKRTKSINGSLYIFRGR 290 300 310 320 330 340 390 400 410 420 430 mFLJ00 IFCCNLSVSETPRDPLGFKVSDLTIP---------KHR-HLFQAKNQEEKRLWIHCLQRL : . : .. .. . :. :.. . .::. :::. :. : : mKIAA1 INTEVMEVENVEDGTADYHSNGYTVTNGWKIHNTAKNKWFVCMAKTAEEKQKWLDALIRE 350 360 370 380 390 400 440 450 460 470 480 490 mFLJ00 FFENHPASIPAKAKQVLLENSLHCAPKSKHIPEPPTSPLDSPRPRDAPGFTPGRRNPAPS mKIAA1 REQRESLKLGMERDAYVMIAEKGEKLYHMMMSKKVNLIKDRRRKLSTVPKCFLGNEFVAW 410 420 430 440 450 460 >>mKIAA0142 ( 809 res) mbg20462 (809 aa) initn: 152 init1: 67 opt: 354 Z-score: 192.7 bits: 47.3 E(): 1.4e-05 Smith-Waterman score: 372; 23.967% identity (26.914% ungapped) in 484 aa overlap (96-563:240-686) 70 80 90 100 110 120 mFLJ00 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.....: .. . .:. mKIAA0 SMTAFKNLSAQCQEVRKRKE--LELQILTEPIRSWEGDDIKTLGSVTYMSQVTIQCAGSE 450 460 470 480 490 500 360 370 380 390 400 mFLJ00 RLRGGERLLFLFSRMLLV--AKRRGPEYTYKGHIFCCNLSV-----SETPRDPLGFKVSD . .:: :.:: .::. :. : . :.:.. .... ::. :. .:..: mKIAA0 E--KNERYLLLFPNLLLMLSASPRMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENHRN--AFEISG 510 520 530 540 550 410 420 430 440 450 460 mFLJ00 LTIPKHRHLFQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPASIPAKAKQVLLENSLHCAPKSKHIP : .: : . .:.. . :.. ::. ... .:. . . : .: :. .: mKIAA0 SMI--ERILVSCTSQQDLHEWVEHLQK---QTKVTSVSNPTIKP------HSVP-SHTLP 560 570 580 590 600 470 480 490 500 510 520 mFLJ00 EPPTSPLDSPRPRDAPGFTPGRRNPAPSPRLSGSRRGRRQSEPAKEAYVIFPQNDKPQVK : .: .. ..::. .. : : :. . . : . :.. :: mKIAA0 SHPLTPSSKHADSKPVALTPAYHT-LPHPSHHGTPHTTISWGPLEP-----PKTPKPW-- 610 620 630 640 650 530 540 550 560 570 580 mFLJ00 HAGSEGELHPSSELQPVSASGLPEDLEDAGPPTLDPSGTSITEEILELLNQRGLRDSGPA : . :.:. :.: .: ::: . : :. mKIAA0 ---SLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKS-PKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFAVRKSTAA 660 670 680 690 700 710 590 600 610 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