FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0922.ptfa, 1346 aa vs ./tmplib.26680 library 1767671 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9920+/-0.00656; mu= 10.1969+/- 0.434 mean_var=224.1188+/-55.857, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 153 in 1/35 Lambda= 0.0857 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0257 ( 1749 res) mbg01040 (1749) 891 124 1.8e-28 >>mKIAA0257 ( 1749 res) mbg01040 (1749 aa) initn: 785 init1: 681 opt: 891 Z-score: 603.5 bits: 124.4 E(): 1.8e-28 Smith-Waterman score: 987; 27.327% identity (31.936% ungapped) in 1171 aa overlap (302-1337:605-1741) 280 290 300 310 320 mKIAA0 GIVLNLFTNVFLTTNTGAIFAIPLQIFSAPTKEGSLGFEVLAHCGMHYFMGK---SKTEN .: ... :. .:: : ..: ::.: mKIAA0 IQQIRSLSEDVRFYYKRLRGNREDLEPGKKSKIANIYFDPGLQCGDHCYIGLPFLSKSE- 580 590 600 610 620 630 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 PNWERSLSLDRSTWDMDSELANKLYERWKKYKSGDACRRNVLGMAQFAFTKK--SKETEP 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