FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1259.ptfa, 1196 aa vs ./tmplib.26680 library 1767821 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7874+/-0.00649; mu= 3.8273+/- 0.431 mean_var=215.1709+/-51.370, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0874 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4075 ( 1945 res) mbg09037 (1945) 542 82 7.7e-16 mKIAA1122 ( 1071 res) mbh00587 (1071) 532 81 1.2e-15 mKIAA0308 ( 1890 res) mia33045 (1890) 519 80 5.7e-15 mKIAA0809 ( 1368 res) mbp01279 (1368) 294 51 1.6e-06 mKIAA2023 ( 1687 res) mtg03092 (1687) 218 41 0.0014 >>mKIAA4075 ( 1945 res) mbg09037 (1945 aa) initn: 1169 init1: 336 opt: 542 Z-score: 376.7 bits: 82.4 E(): 7.7e-16 Smith-Waterman score: 689; 24.558% identity (36.252% ungapped) in 961 aa overlap (18-953:612-1287) 10 20 30 40 mKIAA1 KEHRKRAEKEALEQRKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSR ::: . ::... .: . ..: . .. mKIAA4 LQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEE-KSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKP 590 600 610 620 630 640 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 KRDMGHDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENAYHI . : : ... . .: . . :. : ...:. . : ...: mKIAA4 EWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLP------YDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWN 650 660 670 680 690 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 HQARTRSFD-EDAKESRAAALRAADKSGSGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKG :. :. . . .:. . . :: .. :. .. .:... .. .: :. mKIAA4 HRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPP----ETPTV-DPTVKYERQPEYLDATGGTLHP 700 710 720 730 740 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 YQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLN ::..:.::: . :: . :::::::::::::. ..: : .. . ::::. .: ::. mKIAA4 YQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTII 750 760 770 780 790 800 230 240 250 260 mKIAA1 NWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRS---QKTLYTQD-----------------APFHVV ::..:: ..: . :. : :. .:. .. . .: . :::. mKIAA4 NWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVL 810 820 830 840 850 860 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 ITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNT .:::.:.. :. . . : ...:::. ::...: ...: .. ...:::::::.::. mKIAA4 LTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNN 870 880 890 900 910 920 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 MAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRI . ::. ::.:. : : . : : : :. :: . :.:...:: .: : ::::. mKIAA4 LEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFA-DIAK---------EDQIKKLHDMLGPHMLRRL 930 940 950 960 970 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 KKDVENELSDKIEILTYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMN : :: ... .: :... .:. :: :. . .. ..: : .. :. .:. ::.: mKIAA4 KADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTR-NFEAL--NARGGGNQV-----SLLN 980 990 1000 1010 1020 1030 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 LVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYEISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLKVLLSP .::...: :::: :: : . .. .: mKIAA4 VVMDLKKCCNHPYLF-------P------------------------------VAAMEAP 1040 1050 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 FAPDYIQQSLFHRKGINEGSCFSFLRFIDVSPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRL :. :. .:: mKIAA4 KMPN----------GMYDGS---------------------------------------- 1060 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 HQLRSWAEPDGTSHQSYLRNKDFLLGVDFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDH mKIAA4 ------------------------------------------------------------ 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 VVHQRRSATSSLRCCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERGVLKEGGSLAA mKIAA4 ------------------------------------------------------------ 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 KQCLLNGAPELATDWLSRRSQFFPEPAGGLLSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYAL .:: :::: : mKIAA4 ------------------------------------------------ALIRASGKLLLL 1070 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 DVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQTR . .: :: ::::::.::::.:.::::... .. . : :.::. . :.. . :.. mKIAA4 QKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAP 1080 1090 1100 1110 1120 1130 810 820 830 840 850 860 mKIAA1 N-DIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLI . . : ::::::::::::::..:::::.::::::: : ::..::::.::.:.: .::.. mKIAA4 GAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFV 1140 1150 1160 1170 1180 1190 870 880 890 900 910 920 mKIAA1 CKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGG-NFKPDTLKPKEVVSLL-LDDEELEKKLRLRQE ....:::: : ::.: . ..:. : . : ... .:. ..: . ::: : mKIAA4 TRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGG 1200 1210 1220 1230 1240 1250 930 940 950 960 970 980 mKIAA1 -EKRQQEESNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADG .... :.:. .. . :. .... : : mKIAA4 GDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEE 1260 1270 1280 1290 1300 1310 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA1 DDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPPDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPAS mKIAA4 EEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDW 1320 1330 1340 1350 1360 1370 >>mKIAA1122 ( 1071 res) mbh00587 (1071 aa) initn: 1231 init1: 517 opt: 532 Z-score: 373.0 bits: 80.9 E(): 1.2e-15 Smith-Waterman score: 903; 29.504% identity (42.561% ungapped) in 766 aa overlap (151-908:527-1065) 130 140 150 160 170 mKIAA1 ESRAAALRAADKSGSGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKL--KGYQLKGMNWLANL : . ::...: .: : :: :.:::: . mKIAA1 RDVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWNREQPSLLNQSLSLKPYQKVGLNWLALV 500 510 520 530 540 550 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 YEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPK ...:.:::::::::::::.:.::.::.: .. : :: ::. ::::..:: .: . . :. mKIAA1 HKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLFQEGNK-GPHLIVVPASTIDNWLREVNLWCPS 560 570 580 590 600 610 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 FKVLPYWGNPHDRSQK--TLYTQDAPFHVVITSYQLVVQ---DVKYFQRVKWQYMVLDEA ..:: :.:. ..:.: ..... ..:..:.:. ... : . :.:.: .: ..::. mKIAA1 LNVLCYYGSQEERKQIRFNIHNKYEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKLNYAIFDEG 620 630 640 650 660 670 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 QALKSSSSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHE-EFNEWF . ::. .:.:.. :. .. ::::::::::.::.. :: .::.:.:: .:.: :. . : mKIAA1 HMLKNMGSIRYQHLMTINARNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSSTSEIRRMF 680 690 700 710 720 730 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 SKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILTYCQLTSRQKL :. . :...: ....... ..:.:::.:::.:..: . : : . . : .. .:. mKIAA1 SSKTKP-ADEQSIYEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKLLPPKKDRIELCAMSEKQEQ 740 750 760 770 780 790 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 LYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHI ::..: :. :..:... .. :: . :..::.::. ::: :..:: mKIAA1 LYSGLFNR------LKKSINNLEK--NTE--MCNVMMQLRKMANHP-LLHRQY------- 800 810 820 830 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 SLKPYEISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLKVLLSPFAPDYIQQSLFHRKGINEGSCFSFLR ..:. .. mKIAA1 ----------------------------------YTPEKLK------------------- 840 540 550 560 570 580 590 mKIAA1 FIDVSPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWAEPDGTSHQSYLRNKDFLLG ::..:::. :: .: mKIAA1 -------EMSQLMLK--------------------------EP---TH------------ 850 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 VDFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDHVVHQRRSATSSLRCCLLTELPSFLCV : .:.: . .... . :: :: mKIAA1 ------------CEANPDLIFEDM-EVMTDFELHV----------------------LCK 860 870 880 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 ASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERGVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELATDWLSRRSQFFPEP .... :: mKIAA1 QYQHINSYQLDM------------------------------------------------ 890 720 730 740 750 760 770 mKIAA1 AGGLLSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDL .:: ::::. :: .:..::..: ::...::.: :.:. mKIAA1 ----------------------DLILDSGKFRALGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDI 900 910 920 930 780 790 800 810 820 830 mKIAA1 LEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQTRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVI :: . ...: :.::::...:::: .. .:.: :::::::::.:::::::::.:..:: mKIAA1 LEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNTDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVI 940 950 960 970 980 990 840 850 860 870 880 890 mKIAA1 FYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGG ..: : :: :.:: :: ::.::::.: : .:: .::::: .:. ..: .... . . mKIAA1 LHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKLEQDMTTVD 1000 1010 1020 1030 1040 1050 900 910 920 930 940 950 mKIAA1 NFKPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEESNRVKERKRKREKYAEKKKKED . .. : ....:: mKIAA1 EADEGSM-PADIATLLKTSMGL 1060 1070 >>mKIAA0308 ( 1890 res) mia33045 (1890 aa) initn: 865 init1: 299 opt: 519 Z-score: 361.2 bits: 79.5 E(): 5.7e-15 Smith-Waterman score: 519; 36.078% identity (37.398% ungapped) in 255 aa overlap (734-986:195-442) 710 720 730 740 750 760 mKIAA1 RRSQFFPEPAGGLLSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIY ...: ..::: .: :: ..:. ::.:::. mKIAA0 NHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPSASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIF 170 180 190 200 210 220 770 780 790 800 810 820 mKIAA1 SQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADF-QTRNDIFVFLLSTRAGGLG :::.: .:.::.:...... : :.:: . . :. . : . .: ::::: ::::::: mKIAA0 SQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLG 230 240 250 260 270 280 830 840 850 860 870 880 mKIAA1 INLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKS :::::::: :..:::::: : ::. : ::.::.: : ::::. ... :.....::. : mKIAA0 INLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKL 290 300 310 320 330 340 890 900 910 920 930 940 mKIAA1 EIQRMVISGGNFKPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEESNRVKERKRKRE ... :... . . .... . .: .:.: :: ..::.. : .. . mKIAA0 GLDKAVLQSMSGRDSNVSGIQQLS----KKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDID 350 360 370 380 390 400 950 960 970 980 990 1000 mKIAA1 KYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLV-IPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEIS . .. : .... : : ... :: :.. ...: : : .: mKIAA0 QILLRRTKTITIESEGR--GSTFAKASFVASGNRTDISLD-DPNFWQKWAKKAELDIDTI 410 420 430 440 450 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA1 ISSELHTGSIPPDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASITGSVSDTVNGISIQEVPA mKIAA0 SGRNSLVIDTPRIRKQTRPFSATKDELAELSEAESEGEEKPKLRRPCDRSGGYGRTECFR 460 470 480 490 500 510 >>mKIAA0809 ( 1368 res) mbp01279 (1368 aa) initn: 354 init1: 234 opt: 294 Z-score: 209.5 bits: 51.0 E(): 1.6e-06 Smith-Waterman score: 387; 22.859% identity (29.001% ungapped) in 1308 aa overlap (4-1196:1-1146) 10 20 30 40 50 mKIAA1 KEHRKRAEKEALEQRKLDEEMREAK-------RQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGH .:::.: . .:.. . .:: . ::..:. . .. . . mKIAA0 KKRAQKPSHMRRNIRKLLREDQLEPVTKAAQQEELERRKRLEQQRKEYAAPIPTVPL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 DGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQ----EDYDSNHFKAQALKNAE-NAYHIH . . :::. . :. : . . :. . . :: :.. .. :...: .. :: mKIAA0 EFLPEEIVLRASDGP-QLPPRVLAQEVICLDSSSGSEDEKSSRDEVIELSSGEEDTLHIV 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 QARTRSFDEDAKESRAAA-LRAADKSGSGFGESY-SLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKG .. .:: .: .... . : .. ...:. .: .: . :.. . .: mKIAA0 DSSESVSEEDEEEEKGGTHVNDALNQHDALGRVLVNLNHPPEE--ENVFLAPQLARAVKP 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 mKIAA1 YQLKGMNWLA-NLYEQ--------GINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFL .:. :. .: :: :. :.. ::: ::::::.: :... : :.. : mKIAA0 HQIGGIRFLYDNLVESLERFKTSSGFGCILAHSMGLGKTLQVISFIDVLF-RHTPAKTVL 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 IISPASTLNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDV : :..::.:: ::. ..: ..:: ..:.. :: mKIAA0 AIVPVNTLQNWLAEFNMWLPAPEALPADSKPEE-----------------------VQP- 240 250 260 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 KYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFI ..:. ... :: ... : : :. .. .. .:: : :.. :: . mKIAA0 RFFKV----HILNDEHKTVAS----RAKVTADWVSEGGVLLMGY-------EMYRLLT-L 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 MPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPF--MLRRIKKDVENELS .: :. . .. :. . :: .. .: . . . : : : :: . mKIAA0 KKSLATSRPKKTKKRSHPV--------IIDLDEEDRQQEFRREFEKALCRPGPDVV--IC 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 DKIEILTYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVC :. . . :: .. : :::: . : ... : :.: .... . mKIAA0 DEGHRIKNCQASTSQ-----ALKN-----------IRSRRRVVLTGYPLQNNLIEYWCMV 370 380 390 400 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 N--HPELF-ERQETWSPFHISLKPYEISKFIYRHGQ-IRVFNHSRDRWLKVLLSPFAPDY . .:... ::: . :. .: .. : : .:.. . :.. :. :: :. mKIAA0 DFVRPDFLGTRQEFSNMFE---RPILNGQCIDSTPQDVRLMRY-RSHVLHSLLEGFV--- 410 420 430 440 450 460 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 IQQSLFHRKGINEGSCFSFLRFIDVSPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRS .:.: . :. : . ::. :..: : :. .. .: . mKIAA0 ------QRRG------HTVLK-IHL-PAKEENVILVRLSQIQRDLYTQFMDRFRDCGTSG 470 480 490 500 580 590 600 610 620 mKIAA1 WAEPDGTSHQSYLRNKDFLLGVDFPLSFPNLCSCPLLKS---LVFSSHCKAVSGYSDHVV : ::.. ::. .: : . . : . . . ... .: : mKIAA0 W------------------LGLN-PLKAFCVC-CKIWNHPDVLYEALQKENLANEQDLDV 510 520 530 540 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 HQRRSATSSLRCCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERGV----LKEGGSL .. :: .: :: : .. . .:.: .:. . .... .:: ..: :. mKIAA0 EELGSAGTSARC------PPHGTKVKGEDSALP-SSMGEATNSKFLQGVGFNPFQERGN- 550 560 570 580 590 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 AAKQCLLNGAPELATDWLSRRSQFFPEPAGGLLSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLY . . : :: :.. . :.: :. : :: .: :: mKIAA0 --NIVTYEWAKELLTNYQT-----------GVLENSPKMVLLF-------HLIEESVKL- 600 610 620 630 750 760 770 780 mKIAA1 ALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYM------------------VYRKHTYMR : ..:..:: . :.::.. :. .:.: mKIAA0 ------------GDKILVFSQSLSTLALIEEFLGKRDMPCLPGAEGQGTQKWVRNVSYFR 640 650 660 670 680 790 800 810 820 830 840 mKIAA1 LDGSSKISERRDMVADFQTRNDI--FVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQ ::::. ::. .. .:. ... ..:::::::: ::.:: .:. :. .:..::: : mKIAA0 LDGSTPAFERERLINQFNDPSNLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDA 690 700 710 720 730 740 850 860 870 880 890 900 mKIAA1 QAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLKPKEV ::. :..: :: : .:::. :.:..: .: :. .. :.. : . . ::: mKIAA0 QAVCRVYRYGQKKPCHIYRLVADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLNPMLNFTR-KEV 750 760 770 780 790 800 910 920 930 940 mKIAA1 VSLL------------LDDEELEKKL---------RLRQEEKRQQEES--NRVKERKRKR .:: :: . ..... .: .: ..: :: .. : mKIAA0 ENLLHFVEKEPAPQTSLDIKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKA 810 820 830 840 850 860 950 960 970 980 mKIAA1 EKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIP----FVPSADNSNLSAD------------GDDS :: : ::. :.. .. .: . : . :..:.: : ::.. mKIAA0 EKKAAKKSYEED-----KRTSVPYTRPSYAQYYPASDQSLTSIPAFSQRNWQPTLKGDEK 870 880 890 900 910 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA1 FI-SVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPPDESSSDMLVIVD--DPASSAPQSRATNSPAS . :: .. .:. . : : . ....: .. . :. :. .:.. mKIAA0 PVASVRPVQSTPIPMMPRHVPLSGGVSSASSTNTSMNFPINYLQRAGVLVQKVVTTTDIV 920 930 940 950 960 970 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA1 ITGSVSDT-----VN-GISIQEVPAAGRGHSAR-SRGRPKGSGSTAKGAGKGRSRKSTAG : : :.: .: : ::. . .. .: : : :: . .:.: . .: ...: mKIAA0 IPGLNSSTDVQARINAGESIHIIRGT-KGTYIRTSDGRIFAVRATGKPKAPEDGRMAASG 980 990 1000 1010 1020 1030 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA1 S-AAAMAGAKAGAAAASAAAYAAYGYNVSKGISASSP-LQTSIVRPAGLADFGPSSASSP : . ..:... : .::. : .... .: .:: . . . . : .: : ::: mKIAA0 SQGPSLASTSNGRHSASSPK-APDPEGLARPVSPDSPEIISELQQYADVAAARESRQSSP 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1160 1170 1180 1190 mKIAA1 -----LSSP---LNKGNNIPGTPKSLHMTSSLASDSLIRKQGKGTNPSGGR : .: : ...:::: .: :.. : . .::::: mKIAA0 SISAALPGPPGQLMDNSTIPGT--ALGTEPCLGGHCLNSSLLVTGQPSGGRHPVLDLRGH 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA0 KRKLATPSVTQESIRRRSRKGHLPAPVQPYEHGYPVSGGFAMPPVSLNHNLTTPFTSQAG 1160 1170 1180 1190 1200 1210 >>mKIAA2023 ( 1687 res) mtg03092 (1687 aa) initn: 303 init1: 128 opt: 218 Z-score: 156.6 bits: 41.5 E(): 0.0014 Smith-Waterman score: 218; 26.984% identity (28.492% ungapped) in 189 aa overlap (730-915:1506-1687) 700 710 720 730 740 750 mKIAA1 DWLSRRSQFFPEPAGGLLSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYAL--DVLLTRLKSQG :: : : : :. :. .. .:.. : mKIAA2 SIKCAICRQTTSHKEVSYVFTSEKANQEDDIPVKGS---HSTKVEAVVRTLMKIQLRDPG 1480 1490 1500 1510 1520 1530 760 770 780 790 800 810 mKIAA1 HRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQTRNDIFVFLLSTR ..:..: ..:.. . .. . . .. :.:. .. .. :. : ..:: . mKIAA2 AKALVFSTWQDVLDIISKALTDNNMEFTQI---SRIKTFQENLSAFKYDPHINILLLPLH 1540 1550 1560 1570 1580 820 830 840 850 860 870 mKIAA1 AGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQR .:. :... : :.. . ::. . ::. :.::.:::: . :.:.. :.::::: .: mKIAA2 TGSNGLTIIEATHVLLVEPILNPAHELQAIGRVHRIGQTKPTIVHRFLIKATIEER-MQA 1590 1600 1610 1620 1630 1640 880 890 900 910 920 930 mKIAA1 AKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLKPKEVVSLLL-DDEELEKKLRLRQEEKRQQEESNRVKE . .: .. :: . . ..: ...:. ..:::: mKIAA2 MLKTAERSHTSSSGKHSEASVLTVAGLADLFTKENEELE 1650 1660 1670 1680 940 950 960 970 980 990 mKIAA1 RKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSP 1196 residues in 1 query sequences 1767821 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:39:32 2006 done: Mon Mar 27 10:39:33 2006 Scan time: 1.120 Display time: 0.450 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]