FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0801.ptfa, 1078 aa vs ./tmplib.26680 library 1767939 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7832+/-0.00614; mu= -2.2636+/- 0.405 mean_var=334.6553+/-77.017, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0701 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0111 ( 410 res) mpk01295 ( 410) 668 82 1.9e-16 mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264) 317 47 1.9e-05 mKIAA1595 ( 615 res) mpj03292 ( 615) 293 44 6.5e-05 mKIAA1019 ( 480 res) mbg02982 ( 480) 280 43 0.00014 mKIAA3013 ( 1461 res) mpm01086 (1461) 233 39 0.0074 mKIAA0553 ( 666 res) mbh02787 ( 666) 226 38 0.0075 mKIAA1542 ( 1085 res) mpg00592 (1085) 229 38 0.0082 >>mKIAA0111 ( 410 res) mpk01295 (410 aa) initn: 629 init1: 400 opt: 668 Z-score: 387.5 bits: 82.0 E(): 1.9e-16 Smith-Waterman score: 668; 31.818% identity (32.782% ungapped) in 374 aa overlap (429-798:43-409) 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 EEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIM :. .: .. .:.:::. :: .:: :. mKIAA0 RKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQII 20 30 40 50 60 70 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 SGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKK .:::.:. ...:.::: .: . ... . : ..: . :.:..::::::.:: : mKIAA0 KGRDVIAQSQSGTGKTATFSVSVLQCLDIQ--VRETQ---ALILAPTRELAVQIQKGLLA 80 90 100 110 120 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 FSKTLGLRV-VCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGKSRVFYYLF-- .. .... .:. :::...:.: .: : .... ::::..::. : ..:.. .: mKIAA0 LGDYMNVQCHACI-GGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLD 130 140 150 160 170 180 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 SLLFVLDMIFVEADLRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVV .:. : : . . : :.:..:::.:. . .. .... ::.. : .. mKIAA0 EADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELT 190 200 210 220 230 240 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 CSDVEQQVIVIE-EEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMS ..: ...: :: :: : .: . .:: : . ....: : . . .:.. : mKIAA0 LEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVI-FCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSS 250 260 270 280 290 300 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 LHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAG .:: . : .:.::...:..:. ..:..:.: :::::: .. :..::. ::. : :.:: : mKIAA0 MHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIG 310 320 330 340 350 360 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 RTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIK :.:: : :: : .:. .:. : :: . . .: .. : mKIAA0 RSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI 370 380 390 400 410 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 KSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVK >>mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264 aa) initn: 986 init1: 280 opt: 317 Z-score: 190.2 bits: 47.2 E(): 1.9e-05 Smith-Waterman score: 426; 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