FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0829.ptfa, 1332 aa vs ./tmplib.26680 library 1767685 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0113+/-0.00587; mu= 2.9578+/- 0.391 mean_var=195.2596+/-46.514, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0918 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0667 ( 1243 res) mpm08346 (1243) 5115 691 3.9e-199 >>mKIAA0667 ( 1243 res) mpm08346 (1243 aa) initn: 5188 init1: 1926 opt: 5115 Z-score: 3667.5 bits: 690.9 E(): 3.9e-199 Smith-Waterman score: 5115; 60.032% identity (61.003% ungapped) in 1256 aa overlap (84-1332:1-1243) 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 RGLDVASERLPQSASRCDPGSGRRRQGEEEPRPRGPAATEPAGGIEAGNMASASYHISNL :.::: :..:......::.: mKIAA0 PQPRG-----------AASMSTGAFYISSL 10 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 LEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILRLLEDKNGEVQNLAVKC ::::::::::::::::.:::.:::::::.::.:::::::. .::::::..:::::::::: mKIAA0 LEKMTSSDKDFRFMATSDLMSELQKDSIQLDEDSERKVVRTLLRLLEDRSGEVQNLAVKC 20 30 40 50 60 70 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 LGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPASSGSALAANVC :::::.::::::::.::::::.:: :::::::::..::::::..:::::..::.:: ::: mKIAA0 LGPLVGKVKEYQVENIVDTLCANMRSDKEQLRDIAGIGLKTVLSELPPAATGSGLAINVC 80 90 100 110 120 130 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 KKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCLLPQLTSPRLAV .::::.::::::.::::.::::::::..::::: :. : .:: :.: ::::::.:::::: mKIAA0 RKITGQLTSAIAQQEDVAVQLEALDILSDMLSRLGAPLGTFHASLLHCLLPQLSSPRLAV 140 150 160 170 180 190 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 RKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELS---KNDSMSTTRTYIQCIAAISRQAGHR ::::..:::::. .:.. .::.: .::...: : .. :: :::.....:::::: mKIAA0 RKRTVVALGHLAAACSTDLFVELADHLVDRLPGPRAPASPAAIRTLIQCLGSVGRQAGHR 200 210 220 230 240 250 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 IGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINICLKYLTYD .: .:....:.: .:::.::::::: :.::::.:.:.::::. ::: .. ..::.:. .: mKIAA0 LGAHLDRLVPMVEEFCNLDDDELRESCLQAFEAFLRKCPKEMDPHVPNVTSLCLQYMKHD 260 270 280 290 300 310 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 PNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAVVSTRHEML :::..:..::.. :... .. ..: :.::::::::::::::::::::. :..:.: ..: mKIAA0 PNYDHDSDDEEQ--METEDSEFSEQESEDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCMAALISSRPDLL 320 330 340 350 360 370 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 PEFYKTVSPALIARFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQGDTPLTML :.:. :..:::: ::::::::::::.: ::. ::..::: ..:: . : :.:: mKIAA0 PDFHCTLAPALIRRFKEREENVKADIFGAYIMLLRHTRPPKGWLEAVEEPTQTGRNLNML 380 390 400 410 420 430 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 QSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGIIFSLNDKS ..::: ..:::..:.:...:.::: :::..:::..::::.:..:. ::: ::.::: : : mKIAA0 RAQVPLVIKALQRQLKDRNVRTRQGCFNLFTELAGVLPGSLAEHMAVLVSGIVFSLADYS 440 450 460 470 480 490 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 SSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEALLVTQQLVK :::....:::. : .: .. ..::::. .:.:::.:::.:::::...::::: :.::. mKIAA0 SSSTIRMDALAFLQGLLGTEPAEAFHPHLPTLLPPVMACVADPFYKVAAEALLVLQELVR 500 510 520 530 540 550 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 VIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNLGDNLGPDL .. :::.: .: ::. .. : :. ::.:.:.:::::::::::.:... .::: :: :: mKIAA0 TLWPLDRPRLLDPEPYVGEMSTATLARLRATDLDQEVKERAISCVGHLVGHLGDRLGDDL 560 570 580 590 600 610 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 SNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLRKNQRALKL ::...:.::.:::::: .::::::.: :::..::.:.:.:..::::::::::::::.: mKIAA0 EPTLMLLLDRLRNEITRLPAVKALTLVAMSPLRLDLQPILAEALPILASFLRKNQRALRL 620 630 640 650 660 670 780 790 800 810 820 830 mKIAA0 GTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLAKVYPSSLS .::.::: : .. . .: . .:: ::: :.::.::::.:.:..::::.... :::: mKIAA0 ATLAALDALAQSQGLGLPPPAVRTVLTELPALVSENDMHVAQLAVDFLTTVTQTQPSSLV 680 690 700 710 720 730 840 850 860 870 880 mKIAA0 KISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLTGPVYSQ-- ..:: .:.::. :..:::: .:.:.: :.:::: : . : .:. .::.:::.: mKIAA0 EVSGPVLGELLQLLHSPLLPAGVLAATEGFLQALVGTRPPCVEYSELISLLTAPVYNQVG 740 750 760 770 780 790 890 900 910 920 930 940 mKIAA0 -STALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALLSLGEV . ::: ..:.:.:::::. :::.:. ....... :.:. .:. ....::.:::.:: mKIAA0 DGGPGLHKQVFHSLARCVAALSAACPQEAAGTASRLVCDAKSPHSSTGVKVLAFLSLAEV 800 810 820 830 840 850 950 960 970 980 990 1000 mKIAA0 GHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEITSQPKR :. . : :::.:.:::..::::.:..::.:::: ...::::..:::.: .: .::.: mKIAA0 GQVAGPGPQRELKTVLLEALGSPSEDVRAAAAYALGRVGAGNLPDFLPFLLAQIEAQPRR 860 870 880 890 900 910 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA0 QYLLLHSLKEIISSASVAGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTLIDPET ::::::.:.: ...:. .::::::..::::...:: ::::: :::::.:::....: mKIAA0 QYLLLHALREALGAAQPDNLKPYVEDVWALLFQRCESPEEGTRCVVAECIGKLVFVNPPY 920 930 940 950 960 970 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA0 LLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDLNVRRV ::::.. : .:. :.::.:.::::: :::.:. ::::::. :..:...:.::::::::. mKIAA0 LLPRFRKQLAAGQPYTRSTVITAVKFLISDQPHSIDPLLKSFIAEFMESLQDPDLNVRRA 980 990 1000 1010 1020 1030 1130 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA0 ALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDSVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLDIRKAA .:. ::::.::::::.:::::..:: ::.:::.:..:::::::::::::::::::.:::: mKIAA0 TLTFFNSAVHNKPSLVRDLLDDILPLLYQETKIRRDLIREVEMGPFKHTVDDGLDVRKAA 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1190 1200 1210 1220 1230 1240 mKIAA0 FECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQRLDRL :::::.::.::: .::. ::::::::::::::::.::::.::.::.::::. ::::.::: mKIAA0 FECMYSLLESCLGQLDMCEFLNHVEDGLKDHYDIRMLTFIMLARLATLCPAPVLQRVDRL 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1250 1260 1270 1280 1290 1300 mKIAA0 VEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQSQISSN .::::::::.::::.:::::.:::.::::::::::::::: ::..::: ...:..:: :: mKIAA0 IEPLRATCTAKVKAGSVKQELEKQEELKRSAMRAVAALLTNPEVRKSPTVADFSAQIRSN 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1310 1320 1330 mKIAA0 PELAAIFESIQKDSSS-TNLESMDTS :::...:::::::..: . .::. : mKIAA0 PELTTLFESIQKDTASGPSTDSMELS 1220 1230 1240 1332 residues in 1 query sequences 1767685 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:29:46 2006 done: Mon Mar 27 10:29:48 2006 Scan time: 1.130 Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]