FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0545.ptfa, 886 aa vs ./tmplib.26680 library 1768131 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1554+/-0.00742; mu= -7.3745+/- 0.490 mean_var=326.1396+/-78.716, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0710 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1389 ( 1185 res) mbh01631 (1185) 774 94 1.6e-19 mKIAA0440 ( 1510 res) mbg05561 (1510) 648 81 1.5e-15 mKIAA4074 ( 1099 res) mfj12253 (1099) 326 48 9.9e-06 mKIAA0303 ( 950 res) mbg07543 ( 950) 254 40 0.0015 >>mKIAA1389 ( 1185 res) mbh01631 (1185 aa) initn: 1449 init1: 661 opt: 774 Z-score: 442.9 bits: 93.5 E(): 1.6e-19 Smith-Waterman score: 1480; 38.702% identity (45.526% ungapped) in 894 aa overlap (37-879:367-1177) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 RIQHGWEDVSTTHSPWPAASALSAPLSHRIWTPDSSTIKIFYGRGDHIFLQAAEGSVEDI :: .:: :: ::. ..:..... ::: mKIAA1 LLGISNEFIMLIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTSGLVSIKAFYERGECLLLSSVDNRSEDI 340 350 360 370 380 390 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 RDIVQRLKVMTNGWETVDMTLRRNGLGQLGFHVKYDGTVAEVEDYGFAWQAGLRQGSRLV :.::::: ..: : :::.:::::::::::::::...: ::.:: .::::.:::::::::: mKIAA1 REIVQRLLIVTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHVNFEGIVADVEPFGFAWKAGLRQGSRLV 400 410 420 430 440 450 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 EICKVAVVTLSHDQMIDLLRTSVTVKVVIIPPFEDGTPRRGWPETYDMNASEPKTESETT :::::::.::.:.::::::::::::::::: : :::.:::: : . : : .:: : mKIAA1 EICKVAVATLTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPHEDGSPRRGCSELCRIPMVEYKLDSEGT 460 470 480 490 500 510 190 200 210 220 230 mKIAA0 TPGGRPPYRSNAPWQWSG-----PASHNS-LPATKWTTPATPGHAQSLSRLPKQTPV--- . :.: :. :. :.:. : .:.: : :. . .:..: mKIAA1 PCEYKTPFRRNTTWHRVPTPALQPVSRASPVPGTPDRLQCQPLLQQAQAAIPRSTSFDRK 520 530 540 550 560 570 240 250 260 270 280 mKIAA0 VP--FRESQPLHSKRYAAAPHPLLSFDPHFMHDGMSS---------GDSSSGGLTSQEST .: : : .:. .: . :. .:: : :. : ::. mKIAA1 LPDGTRSSPSNQSSSSDPGPGGSGPWRPQVGYDGCPSPLLLEHQGPGSVECDGTGEQEDL 580 590 600 610 620 630 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 MERPK-PEPLWHVPAQARLSAMTGSIGSKHPSRQDAAGKDSPNRHSK-GEPQYSSHSSSN .: . :: :: : . ::.. . .: :.. :.:::. :. :. . ::::::: mKIAA1 LEGGRLPETKWHGPPSKVLSSYKERVLQK-----DGSCKESPNKLSHIGDKSCSSHSSSN 640 650 660 670 680 690 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 TLSSNASSSHSDDRWFDPLDPLEPEQDPFS--KGGSSDSGIDTTLYTSSPSCMSLAKAPR ::::: .::.:::. : : ..:: .. ::.:.::::::: : :: mKIAA1 TLSSN-TSSNSDDKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDTT-----P-CM------- 700 710 720 730 410 420 430 440 450 mKIAA0 PTKPHKPPGNIGLCGGGRESAGRPHPVDRRREVSPA---PVVAGQNKGYRPKLYSSGSCT : : . : :. .: . .:: : :. .:: . ::.. mKIAA1 ---PATILGPVHLTGSRSLMHSRAEQWADAADVSVADDDPAKMYALHGYASAISSSAA-- 740 750 760 770 780 790 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 PPGLVGGSRDPPRQPSDMGSR-AGYPTQ--VYKTASAETPRPSQLSQCSPFQLSTSVPKS : .: . . : ::. .: :. .:.: .. . ... . : .: : mKIAA1 -DGSMGDLSEVSSHSS--GSQHSGSPSAHCSKSTSSLDSSKVYIVTHGGGQQAPGAVTKP 800 810 820 830 840 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 FFSKQPAHNKHSTGWKRTDEPPPRPLPFTDSKKQVDTNAKNVFGQPRLRASLRDLRSPRK . .: : ::. :::... :: : . .. . . . : . : : . mKIAA1 YH-RQGAANKYVIGWKKSEGSPPPEEPEVTECPRIYGEMDIMSTATQHPAVVGDSVSETQ 850 860 870 880 890 900 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 NYKSTIEDDLKKLIVMDNLGPEQERDTGSPKRKWSYPLFRSQPQAERAPRNYLGSHSPKT . : .::. ::.. :. : :. .::.:. :. ::. mKIAA1 HVLS--KDDFLKLMLPDS--PLVEEG----RRKFSF----------------YGNVSPR- 910 920 930 940 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 QSPQKSLQRTLSDESLCSGRREPSFASPAS--LEPGLPSDVLFTSTCTFPSSTLPARRQH .:: :::::::.::.:: :::: : :: .::.:.::..: . :::: : mKIAA1 ----RSLYRTLSDESVCSNRRGSSFASSRSSILEQALPNDILFSTTPPY-HSTLPPR--- 950 960 970 980 990 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 QHAHPPSGAPSTTPATGNGFPEKKSAISASELSLADGRDRPLRRLDPGMMPLPDTAAGLE .:: .:. :. .. . :. ::.: . :::.::::::::::. mKIAA1 --THP-------APSMGS----LRNEFWFSDGSLSDKS----KCADPGLMPLPDTAAGLD 1000 1010 1020 1030 760 770 780 790 mKIAA0 WSSLVNAAKAYEV------------------QRAVSLFSLNDPALSPEIPPAHSPVHSHL :: ::.::.:.: ::..:. .:.: . :. : : .: mKIAA1 WSHLVDAARAFEGLDSDEELGLLCHHASYLDQRVASFCTLTDLQHGQELEGA--P---EL 1040 1050 1060 1070 1080 1090 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 SLERGPQTPRA-TPTMSEESPLDLTGKVYQLEVMLKQLHTDLQKEKQDKVVLQSEVASLR :: : . . : .:.:: ::::: :::..:.::.:::.::::::.:::.:: :: mKIAA1 SLCVDPTSGKEFMDTPGEQSPSTLTGKVNQLELILRQLQTDLRKEKQDKAVLQAEVQHLR 1100 1110 1120 1130 1140 1150 860 870 880 mKIAA0 QNNQRLQEESQAASEQLRKFAELFSREKKEL :.:.:::::::.:. :::::.: : mKIAA1 QDNMRLQEESQTATAQLRKFTEWFFSTIDKKA 1160 1170 1180 >>mKIAA0440 ( 1510 res) mbg05561 (1510 aa) initn: 1334 init1: 570 opt: 648 Z-score: 371.7 bits: 80.7 E(): 1.5e-15 Smith-Waterman score: 1556; 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