FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1721.ptfa, 1149 aa vs ./tmplib.26680 library 1767868 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4618+/-0.00429; mu= 18.9040+/- 0.288 mean_var=82.7783+/-18.482, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1410 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0745 ( 1078 res) mbh01225 (1078) 291 70 2.2e-12 >>mKIAA0745 ( 1078 res) mbh01225 (1078 aa) initn: 164 init1: 77 opt: 291 Z-score: 314.8 bits: 70.1 E(): 2.2e-12 Smith-Waterman score: 476; 20.491% identity (23.937% ungapped) in 1181 aa overlap (10-1142:2-1060) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 AAALGPPEVIAQLENAAKVLMAPPSMVSNEQRQHAEHIFLSFRKSKSPFAVCRHILETSK .::::: : :. . .. : .::. .. : .: . .. :. .:: .. mKIAA0 SLAQLENLCKQLYETTDTTT---RLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGS 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 VDYVLFQAATAIMEAVVREWVLLEKGSIESLRTFLLTYVLQRPNLQKYVREQILLAVAVI .: . ::: . . 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