FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0466.ptfa, 1214 aa vs ./tmplib.26680 library 1767803 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8447+/-0.0044; mu= 11.8395+/- 0.293 mean_var=114.7367+/-26.992, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1197 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1436 ( 812 res) mbg18759 ( 812) 634 121 5.9e-28 mFLJ00271 ( 494 res) mib18067 ( 494) 431 86 1.5e-17 >>mKIAA1436 ( 812 res) mbg18759 (812 aa) initn: 568 init1: 182 opt: 634 Z-score: 594.3 bits: 121.5 E(): 5.9e-28 Smith-Waterman score: 822; 25.831% identity (28.212% ungapped) in 782 aa overlap (89-831:1-755) 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 TIWCNVSGYQGPSEQNFQWSIYLPSAPEREVQIVSTVDSSFPYAIYTQRVRGGKIYVERI :...:: . .:: .: .:.. : : ..: mKIAA1 VELASTWEVGFPAQLYRERLQRGDILLRRT 10 20 30 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 QGNSALLHITDLQARDAGEYECHTPNTDERYFGSYSAKMNLVVIPDSL---QTTAVPQTL .... ::: ..: : :.:.: ::.:: :.: ... :. :.: .. : : mKIAA1 ANDAVELHIKNVQPSDQGHYKCSTPSTDATVQGNYEDTVQVKVLADALVVGPSSRPPPGL 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 HKVEQDPLELSCEVATETVQHTHLSVSWLRQKGGENPVE--VISLSRDFILHSSSEYAQR : .:.:: : ..: . ::::.. : ..: ::. ...::.. .: . : :: mKIAA1 SLREGEPFELRCIASTTSPLHTHLALRWELHRG---PVHRSILALSHEGRFHPGPGYEQR 100 110 120 130 140 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 QSLGEVRLDKLGRSTFRLTIFHLQPSDQGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVN :.:::: .: ...::.. . .::: . : ..::: . .::: . .: : :.: mKIAA1 YHSGDVRLDTVGSDAYRLSVARALSADQGSYRCVVSEWITE-QGSWQEIQEKAVEVATVV 150 160 170 180 190 200 300 310 320 330 340 mKIAA0 VQPTDKEFTVRLETDKRLHTVGEPVEFRCILEAQNIPDRYFAVSWAF----NSSLIATMG .::: ...: .. : :. ... : . .. . : :.: : ..::.:. mKIAA1 IQPTALQLAVPRTVSV---TEGKDLDLSCNITTDRVDDVRPEVTWYFKKTPDTSLLAS-- 210 220 230 240 250 260 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 PNAVPVLNSD-FAHREAKGQLKVAKESDGVFVLKIYHLRQEDSGKYNCRVT--EREKTVT . . :. : ..: .. .. ... . . : . . .:.:: : : :. .. . mKIAA1 -HMLARLDRDSLVH--SSPHVALSHVDTRSYHLLVRDVSKENSGYYLCLVALWAPGHNRS 270 280 290 300 310 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 GEFIDKESKRPKNIPIVVLPLKSSISVEVASNASVV--LEGEDLHFSCTVRTVGRLQA-- . . . . :... .. : . .. . ::: : . . ...: : . ::.: mKIAA1 WHKVAEAMSAPSGVSVTWLEPEYQVYL----NASKVPGFSDDPTELQCRVIDTKRLEAGV 320 330 340 350 360 370 470 480 490 500 510 mKIAA0 RFSVIWQLVDRQNRRSN-------VMWLDRDGTLQPGSAYWERSSYGGIQMEQVQPNSFS :..: : :..::.. . .: : ::. : .:.. : . . . . ..:. mKIAA1 RLTVSWYY--RMTRRNDDVVASELLAVMDGDWTLRYGERSKQRAQDGEFIFSKEHTDTFN 380 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 LGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAVDGEWQIVGERRASTLVSI--TALETGFAVTAISRT . : . .::.:.: : :. :.: .. : . .. : :.: .. .. ..: : . mKIAA1 FRIQRTTEEDRGNYYCVVSAWTRQRNNSW-VKSKDVFSKPVNIFWASEDSVLVVKARQPK 440 450 460 470 480 490 580 590 600 610 620 mKIAA0 PGVTYSDSFDLQCII--KPHYPARVPVSVTWRFQPVGTV----EFHDLVTFTRDGGVQ-- : . ...:.. : . : : : .: . .::: . : . .... .:. :. mKIAA1 PFFAAGNTFEMTCKVSSKNIKSPRYSVLITAE-KPVGDLSSPNETKYIISLDQDSVVKLE 500 510 520 530 540 550 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 -WGDKSSTFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEAGKYQCVAELWRRNYNNTWTRLAER : : : . ...::.. .. : . ... ..:: :.:.. : .. : . : mKIAA1 NWTDASRV--DGVVLEKVQE-DEFRYRMYQTQVSDAGLYRCMVTAWSPIGGSLWREAATS 560 570 580 590 600 690 700 710 720 730 mKIAA0 TSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENRAIQLNCSVKSQTS---PNSH-FAVLWY-V :: .:: ...: . : ..... :.: : : . . :.. : : :. : mKIAA1 LSNPIEIDFQTSGPTFNASVHSDTPSVTRGDLIKLFCIVTVEGAVLDPDDMAFDVSWFAV 610 620 630 640 650 660 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 HKPSDADGKLILKTTHSSAFEYGTYAEEEGLRGRLQFERHVSGGLFSLTVQRAEVSDSGS :. . . ..:.. .. . . .. .. ...:: :: : : :. .: .: :. mKIAA1 HSFGLDKAPVLLSSLDRKGV---VTTGQRDWKSTVSLER-VSVLEFLLQVHGSEDQDFGN 670 680 690 700 710 720 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 YYCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLKLSQVQGSLSVLETRQIQLECV ::: : :. ::. .: . :: : .:::. mKIAA1 YYCSVTPWVRSPTGSWQREAEIHSRPIFITVKMDVLNAFKYPLLIGVGLSTVIGLLSCLI 730 740 750 760 770 780 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 VLNRTSVASQLLVEWFVWKPNHPEREVVAHLSRDATFHYGEQAAKNNLKGRLHAESPSSG mKIAA1 GYCSSHWCCKKEVRETRRERRRLMSMEMD 790 800 810 >>mFLJ00271 ( 494 res) mib18067 (494 aa) initn: 559 init1: 292 opt: 431 Z-score: 407.5 bits: 86.2 E(): 1.5e-17 Smith-Waterman score: 646; 30.837% identity (33.981% ungapped) in 454 aa overlap (133-552:1-446) 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 IYTQRVRGGKIYVERIQGNSALLHITDLQARDAGEYECHTPNTDERYFGSYSAKMNLVVI .:.: :::.::.:: .:.:.::::..: :. mFLJ00 QDSGFYECYTPSTDTQYLGNYSAKVELRVL 10 20 30 170 180 190 200 mKIAA0 PDSLQTTAVPQ--------------TLHKVEQDPLELSCEVATETVQHTHLSVSWLRQKG :: ::..:.: :.: : . : :.: . :.: .:::::::. : mFLJ00 PDELQVSAAPPGPRGRQAATSPSRLTVH--EGQELALGCLAQTKTKKHTHLSVSFGRAIP 40 50 60 70 80 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 GENPV------EVISLSRDFILHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRSTFRLTIFHLQPSDQG : :: ::..: :. ..... ::.: . ::.::.: : . .:... : .:.: mFLJ00 -EAPVGRATLQEVVGLHSDMAVEAGAPYAERLASGELRLSKEGTDRYRMVVGGAQAGDSG 90 100 110 120 130 140 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 EFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETDKRLHTVGEPVEFRC ..: :::::::::::: ...::. : :.:: .....: . .: :::.:. : mFLJ00 TYHCTAAEWIQDPDGSWVQVAEKRAVLAHVDVQTLSSQLAVTVGPGERRIGPGEPLELLC 150 160 170 180 190 200 330 340 350 360 370 mKIAA0 -ILEAQNIPDRY--FAVSWAFNSS-------LIATMGPNAVPVLNSDFAHREAKGQLKVA . : : :. ..:.: . . :.: . ... :. . :. . ::: mFLJ00 NVSGALPPPGRHAAYSVGWEMAPAGAPGPGRLVAQLDTEGIGSLGPGYEDRHIAME-KVA 210 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 KESDGVFVLKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEFIDKESKRPKNIPIVVLPLKSSIS ... . :.. : :.: : : . . .. . : : . .:. : . mFLJ00 SRT---YRLRLEAARPADAGTYRCLAKAYVRGSGTRLREAASARSRPLPVHVREEGVVLE 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 mKIAA0 VEVASNASVVLEGEDLHFSCTVRTVGRLQA-RFSVIWQLVDR--QNRRSNVMWLDRDGTL . . ...: .:: . :.. . : . :... : :.: ... :. :. mFLJ00 AVAWLAGGTVYRGETASLLCNISVRGGPPGLRLAASWW-VERPEEGELSTGPAQLVGGVG 330 340 350 360 370 380 490 500 510 520 530 540 mKIAA0 QPGSAYWE-RSSYGGIQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAVDGEWQIVG : : : : . : ...: : : : : . . :::: :.: . ::. .: : .: mFLJ00 QDGVAELGVRPGGGPVSVELVGPRSHRLRLHGLGPEDEGIYHCAPSAWVQHADYSWYQAG 390 400 410 420 430 440 550 560 570 580 590 600 mKIAA0 ERRASTLVSITALETGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPARVPVSVTWRFQPVG :.. mFLJ00 SARSGPVTVYPYTHAVDTLFVPLLVGTGVALVTGASVLATITCCFMKRMRKR 450 460 470 480 490 1214 residues in 1 query sequences 1767803 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:21:29 2006 done: Mon Mar 27 10:21:30 2006 Scan time: 1.120 Display time: 0.110 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]