# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpm03293.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0466.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0466, 1214 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917026 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8113+/-0.000192; mu= 16.3143+/- 0.011 mean_var=82.9132+/-16.326, 0's: 31 Z-trim: 36 B-trim: 3306 in 2/63 Lambda= 0.140852 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|190360178|sp|Q6ZQA6.2|IGSF3_MOUSE RecName: Full (1194) 7952 1627.0 0 gi|31127126|gb|AAH52892.1| Immunoglobulin superfam (1194) 7939 1624.3 0 gi|172046061|sp|O75054.3|IGSF3_HUMAN RecName: Full (1194) 7538 1542.8 0 gi|84040284|gb|AAI10652.1| Immunoglobulin superfam (1195) 7534 1542.0 0 gi|73981172|ref|XP_540257.2| PREDICTED: similar to (1232) 7531 1541.4 0 gi|190689969|gb|ACE86759.1| immunoglobulin superfa (1195) 7523 1539.8 0 gi|190691343|gb|ACE87446.1| immunoglobulin superfa 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