FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1601.ptfa, 856 aa vs ./tmplib.26680 library 1768161 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4300+/-0.00846; mu= 0.0609+/- 0.561 mean_var=401.5518+/-95.986, 0's: 0 Z-trim: 30 B-trim: 23 in 1/35 Lambda= 0.0640 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 399 52 4.8e-07 mKIAA1561 ( 1106 res) mej02373 (1106) 366 49 3.6e-06 mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319) 333 46 3.3e-05 mKIAA1749 ( 922 res) meh00393 ( 922) 327 45 4e-05 mKIAA1319 ( 1240 res) mic06048 (1240) 325 45 5.3e-05 mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 327 46 6e-05 mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729) 320 45 8.7e-05 mKIAA3005 ( 1833 res) mbg08806 (1833) 312 44 0.00015 mFLJ00238 ( 1452 res) mfj01101 (1452) 292 42 0.00047 mKIAA0336 ( 1693 res) mbg01823 (1693) 285 42 0.00081 mKIAA1764 ( 1034 res) mpm02096 (1034) 279 41 0.00091 mFLJ00150 ( 1174 res) mfj11357 (1174) 280 41 0.00091 mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916) 254 39 0.0063 >>mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335 aa) initn: 142 init1: 90 opt: 399 Z-score: 218.8 bits: 52.2 E(): 4.8e-07 Smith-Waterman score: 400; 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