FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0460.ptfa, 1385 aa vs ./tmplib.26680 library 1767632 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0750+/-0.00944; mu= -25.9633+/- 0.620 mean_var=576.7929+/-144.737, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 6 in 1/35 Lambda= 0.0534 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1205 ( 1848 res) mpf00780 (1848) 301 39 0.0091 >>mKIAA1205 ( 1848 res) mpf00780 (1848 aa) initn: 506 init1: 183 opt: 301 Z-score: 142.1 bits: 39.2 E(): 0.0091 Smith-Waterman score: 418; 24.217% identity (28.189% ungapped) in 1086 aa overlap (241-1246:310-1322) 220 230 240 250 260 mKIAA0 FYEAQYKEVKVVANAYKTFANRVNNLKKKLDQLKSTLPDPEESPVPSPSMDAPS-PTGSE :::.. : . : :.:. . . ::.: mKIAA1 SKGPSYSGGPPQPPSGPPPPGLATCQSYSPDQLQGQLYGVQSEPYPGPAAHSQGLPTASP 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 SPFQGMGGEEPQSPAMESDKSATPEPVTDNRDVEDMELSDVEDDGSKIIVEDRKEKPV-- : 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