# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpm03155.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0460.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0460, 1385 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7892973 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0888+/-0.000214; mu= 7.2849+/- 0.012 mean_var=175.0671+/-33.280, 0's: 40 Z-trim: 117 B-trim: 148 in 1/68 Lambda= 0.096933 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81892071|sp|Q6NXI6.1|RPRD2_MOUSE RecName: Full= (1469) 8523 1205.4 0 gi|73981313|ref|XP_860613.1| PREDICTED: similar to (1436) 7875 1114.8 0 gi|149751211|ref|XP_001489528.1| PREDICTED: simila (1462) 7216 1022.7 0 gi|193786970|dbj|BAG51793.1| unnamed protein produ (1461) 7206 1021.3 0 gi|73981315|ref|XP_540301.2| PREDICTED: similar to (1462) 7199 1020.3 0 gi|73981317|ref|XP_860674.1| PREDICTED: similar to (1480) 7184 1018.2 0 gi|148706887|gb|EDL38834.1| mCG16744, isoform CRA_ 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