FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0661.ptfa, 1035 aa vs ./tmplib.26680 library 1767982 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9172+/-0.0085; mu= 0.9501+/- 0.564 mean_var=368.4810+/-84.489, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0668 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4116 ( 979 res) mfj08213 ( 979) 1822 190 1.1e-48 mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916) 258 40 0.0038 mFLJ00238 ( 1452 res) mfj01101 (1452) 253 39 0.0045 mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 245 39 0.0093 >>mKIAA4116 ( 979 res) mfj08213 (979 aa) initn: 3072 init1: 1766 opt: 1822 Z-score: 966.7 bits: 190.4 E(): 1.1e-48 Smith-Waterman score: 3598; 58.391% identity (60.308% ungapped) in 1007 aa overlap (30-1034:2-978) 10 20 30 40 50 mKIAA0 PRWWRLADPTVTEVPPPPACQPRRALSCPSATAAMSGLSNKRAAGD-GGSGPPEKKMNRE :. . :::..::::::. : : ::::: : mKIAA4 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