FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0661.ptfa, 1035 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767982 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9172+/-0.0085; mu= 0.9501+/- 0.564
 mean_var=368.4810+/-84.489, 0's: 0 Z-trim: 22  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.0668

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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>>mKIAA4116  ( 979 res)   mfj08213                        (979 aa)
 initn: 3072 init1: 1766 opt: 1822  Z-score: 966.7  bits: 190.4 E(): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 3598;  58.391% identity (60.308% ungapped) in 1007 aa overlap (30-1034:2-978)

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                                           10        20        30  

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       .. ::  .: :.:::.:::::.: ..:: ::.:::: :.:::: ::::::.:::::.:::
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       ::::.::::::::.:.::... .:. :. .. :.   ..   ...:   :.:.:.: ...
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        .:    . :.  .:::..:...:..:: ::.: ::: :.: :. :::..: . :.::..
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       :. : ... : ::.    :...  .  :..:: :::.:.  :::::: .: :. .:: ::
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        ..:..:  .:. ..::::::.:.:::::.::.::::.::..:: :: : :..... :: 
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       ::.. .::: .:::::::.:::..:  :::::. ... ..  ::.::: :::  ::::.:
mKIAA4 ITINARKFEEMNAELEENKELAQNRHCELEKLRQDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEEVVKE
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mKIAA0 TGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLASKNSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTE
       : ::: .:.:::.:::::::.:..::::: :: .....: :..: .: ::..:.::::::
mKIAA4 TPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLHGTRGTHQRQVELIERDEVSLHKKLRTE
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       ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.. ::
mKIAA4 VIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGEVLRY
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       ::::::.:....: : . :::.  . . :  .::        :..  :      . :.. 
mKIAA4 KRKLREAQSDLNKTRLR-SGSA-LLQSQSSTEDP--------KDE--P-----TELKQDS
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         ::  .:: .. ...:. :..:. .      .    : ::   : :.. ::::  .:  
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              :  :.::.: .....::.:..: :. :::::::::::::::::::.:::::::
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       :::::::::.:.:::...::.:...::.....:.::.:::::::.:: .:::::.::.::
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       . .::::::::::::::::::::::::: ::.:::::::::::::::::::.:::::::.
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       :::.::..::: ::.:::::: .:.::::::. ::...:  :::: ::.::::.:::::.
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       ::::::.:::.::: .: .:...:  ..:. ...::. ::.:::::::::::::::  .:
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        .     ::::.::::.::::::::::: :::::::::::::::::::. ::..::::::
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       ::::::::.::::.::.
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         :.    .  :: :.. . .. .  .:     : :. ..:  :  .  .:. ::. : .
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       . :  ..:.    .:..: ...: . .: . .. . .  ..  . :  . . .  :. : 
mKIAA4 QEEEENVALEEENKRALEKTNQLTEALEAIKKESFEQ-KAQLDSFVKSMSSLQDDRD-RI
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       ..:   ::.:.:    :: ..: . ... ..:. :    .. :.  .. : ... ::. .
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       :..  ..::    .. :             :. ..:.:.:..:.:: :    :  ::. .
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mKIAA0 LQGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESL------QVKTQLDEAR
       :.:    .. :...  .: .:    . : . ::.:.. : .:.       :.:.. .: .
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        : .: ..:. :  . .: . . .::.   .: ..::   :..:: . :.    :  ...
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        .:.:... . :   ::.. . .. ..:..: .. : . :..  .:        :.: :.
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mKIAA0 AQASGSSHCIPTLSHPDDPGL--NALAPGKEDSGPGPGGTPDCKKEMALLAGATSATSSI
        . ..: . .  :.. .: .   ..:. .    . . .     .:    :..       .
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       ..: : ::....:... .  .: . : :      : .  :.     . : :::. .... 
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mKIAA0 AKAEVDELRSRIRELE-ERDRRE-SKKIADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEA
        . :    . ..:.:. :..  :  ..   :. :  : . ..:. :::  :   ..  .:
mKIAA4 LRQENLSWQHELRQLRMEKNSWELHERRMKEQFLMAISDKDQQLGHLQSLLRELRSSSQA
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mKIAA0 LLSEMDVTGQAF-EDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIH-KLLR-EEKDEL
        .   .   ::  :     .:   :.:  . .     ... .:  .:: : :: .. .  
mKIAA4 QILSTQYQRQASPETSASLDGS--QKLVYETELLRTQLNDSLK--EIHQKELRIQQLNSK
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mKIAA0 GEQVLGLKSQVDAQLLTV-QKLEEKER---ALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEA
         :.:  :. ...::  . :.:.:...    : .  . .:::.  . ::  ::   :  :
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mKIAA0 AQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVE
        :  . .. . :   :   : :: ..:     ...  : :   .:. .:.. ::..:  .
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       . :. :  . .:.:..                                            
mKIAA4 LTAENALSLAKEQIRRLEHSEWESARTPIMGACGSQEQALLIDLPGHSCRRTRSGAGWKR
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>>mFLJ00238  ( 1452 res)   mfj01101                       (1452 aa)
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       .....:. : . .:  .:.: .. : .:.::...:...   ..:  ..:.:  .::.   
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       .  .. .   . .:.    : ::  :..    .:.     . . .    .: :  . .::
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             .:  .:  ::   ....::.:..  .:..:: .:: :.. : ::     .   :
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       :.....   :.  :  ... ..  :.   :.: . .:. ..:  :   :::  ..   . 
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       .    : ::..  .. .:  . .: ....  ..:.. ::.: ::..:  .. :       
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mKIAA0 SLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLASKNSHLRHIEHMESDEL
        .::.  .   : .. ..  :   .: :: . :    :. :: .:      .. ...:  
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       .::.  :  .::   .::... :   .:    ..: .: : ..:   .. :.  ..  . 
mFLJ00 ALQQ--REAAIQ--GSLASLEAEQASIRHLGNQMEASLLAVKKA---KETMKAQVAEKEA
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         .. ... ::       .: :  . : :: .... . .: .  .  .. .   . ..: 
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          . :. . ..  :. :     . . ..: .   : ::   :. :    : :. :  : 
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         : .. : ..   .. .:.   .   :. ..::    . .. .:...:.:: ..:.:::
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       .... :..  .:   ..  .  . . : ..:        :: :...  .  :  : .: .
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       :.     .    .. : ... :.::.:.   :  :::  :   . .:  .   :: .. :
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       :.   .:.:  .:.: .: .  ..  :   ::  .:  :.    .:..    .::.::  
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       . :.. .:. . ..:. . ::  : : .     : . :  . .::.. ....:    : .
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mKIAA0 -------PCCNTRKKDAVLTK------CFHVFCFEC-----VRGRYEARQRKCPKCNAAF
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       ..       .:   . .  : . . ..:.: :  : .. :.:    .   : : .     
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        ::....: ..     :. .   .:. :  ::   :: . ... :.. .  ..    :.:
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       . .: ...:  .. .:.:..  :. ..:..  ..:.  . .: :..  : .     . : 
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