FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0407.ptfa, 1207 aa vs ./tmplib.26680 library 1767810 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9367+/-0.00475; mu= 18.8399+/- 0.318 mean_var=103.3305+/-24.259, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 42 in 1/35 Lambda= 0.1262 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0315 ( 1299 res) mbg03309 (1299) 1339 255 4.9e-68 mKIAA1206 ( 1374 res) mbg00219 (1374) 1305 249 3.7e-66 mKIAA4053 ( 1400 res) mbg07434 (1400) 1279 244 9.9e-65 mKIAA0620 ( 1746 res) mpf00920 (1746) 1106 213 3.4e-55 mKIAA0463 ( 1529 res) mbg07539 (1529) 980 190 2.5e-48 mKIAA4078 ( 609 res) mic26093 ( 609) 906 176 1.6e-44 mKIAA1550 ( 199 res) mfj03098 ( 199) 692 136 4.3e-33 >>mKIAA0315 ( 1299 res) mbg03309 (1299 aa) initn: 2549 init1: 1037 opt: 1339 Z-score: 1313.9 bits: 255.3 E(): 4.9e-68 Smith-Waterman score: 2580; 41.104% identity (49.800% ungapped) in 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.:.:::: . :. : ::.::::.::.::. mKIAA1 IVCVTSPAPNGTAGPVQVAIKSRPPGISTQNFTYQDPVLLSLNPQWGPQAGGTQLTIHGQ 540 550 560 570 580 590 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 KLLTGRLEDIRVVVGDQPCHLLLEQQSEQLHCETGP-YPVPAELPVTVLFGATERRLQHG : :: .: : :::::: . : : : : .: :: :: .::.: mKIAA1 YLQTGG--NISVFVGDQPCPMSL--------CVLKPSYATPC--PV---FGHVERKLLTT 600 610 620 630 640 340 350 360 370 380 mKIAA0 QFKYTSDPNVTSVGPSKSFFSGGREIWVRGQDLDVVQRPRIRVTVV--PRQHGQGLAQKQ :.::..:... . :: :: .::: : ::: :::: .: . : . :. .. :. : : mKIAA1 PFRYTANPQLVEAEPSVSFRGGGRVIRVRGTGLDVVWQPLLSVWLEDEPKVKALGV-QAQ 650 660 670 680 690 700 390 400 410 420 mKIAA0 HVVPEKF-----EEP----------------CLVNSSHLLMCRTPALPGPPWDSGVQVEF . :.. .: : :::: ::.:..::.: . .: : mKIAA1 DANPRRSCGAPAADPQACIHLESGLLQCSTLCSVNSSSLLLCHSPAVPDGALPK--RVFF 710 720 730 740 750 760 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 ILDNMVFDFAALSPTP-FSYEADPTLRSLNPEDPSTPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMSKE :::: :::. : : :. .: : :. : . :.. ::: :..::::.:.:..::: mKIAA1 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. .::..: ...::..: :: ::.:::.::.:: :::. ::::. .::.:..:: : mKIAA4 -QANVEKSLTLFGQLLTKKHFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYATG 860 870 880 890 900 910 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 ILRTLLSDLVAQYV-AKN-PKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFR .:. :::::. . . .:: :::.:::::.:.::.::::... :: :... .::::.::. mKIAA4 VLKQLLSDLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYC 920 930 940 950 960 970 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 GIKHQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQCVPVKVL .::.:..:::.:..::.:.:.:....:.:....:. :::: :.: .: :::: : mKIAA4 AIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNC---VNPEHENAPEVPVKGL 980 990 1000 1010 1020 850 860 870 880 890 900 mKIAA0 DCDTISQAKEKMLDQLYKGVLLAQRPDSCTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSELQGLWRR .:::..:.:::.:: .:::: .::: . .:.:::.: ...::.:::::..... :.: mKIAA4 NCDTVTQVKEKLLDAVYKGVPYSQRPKAGDMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 910 920 930 940 mKIAA0 LNTLQHYKVPDGATVALVP------------CLTKHILR-ENQDYV---PGE---RTPML :::: ::.: ::..::::: .:: . : :.. . : ::::. mKIAA4 LNTLAHYQVTDGSSVALVPKQTSAYNISNSSTFTKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMI 1090 1100 1110 1120 1130 1140 950 960 970 980 990 1000 mKIAA0 EDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFV :.: . ::::: :. . . ::: : . ::::::::. :::::::: mKIAA4 TPDLESGTKLWHLVKNHDHLDQREGDRGS---------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFV 1150 1160 1170 1180 1190 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA0 DDLFQVILSTSR---PVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINII ::::..:.::.. .:::.::.::.:::::..: : :.:. : ::.: ::::::.:.: mKIAA4 DDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADKHQIHDSDVRHTWKSNCLPLRFWVNVI 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA0 KNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKQMVE ::::::::.. .. :: : :.::::::.:. ..::::.::: ::::::.::: ::. :: mKIAA4 KNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVE 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1130 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA0 RYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSRNCSADLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDG :::::: . :::.:.. ::: :: ..... ::::.:.:: :: :.:..:::.: 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